ChemComp-GAV: GUANOSINE-5'-RP-ALPHA-THIO-TRIPHOSPHATE

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: GAV
• 名称: 名称: guanosine-5'-rp-alpha-thio-triphosphate

Chemical information

組成

組成式: C₁₀H₁₆N₅O₁₃P₃S / 原子数: 48 / 化学式量: 539.246 / 形式電荷: 0

• その他: タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: GAV / 理論座標の詳細: Corina

履歴

作成	2007年5月15日
aromatic_flag"を修正	2011年6月4日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify internal type	2012年2月17日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=P(O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(S)OCC3OC(n2cnc1c2N=C(N)NC1=O)C(O)C3O
• CACTVS 3.370: NC1=Nc2n(cnc2C(=O)N1)[CH]3O[CH](CO[P](S)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[CH](O)[CH]3O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: c1nc2c(n1C3C(C(C(O3)COP(=O)(OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)S)O)O)N=C(NC2=O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: NC1=Nc2n(cnc2C(=O)N1)[C@@H]3O[C@H](CO[P@](S)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]3O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: c1nc2c(n1[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CO[P@](=O)(O[P@@](=O)(O)OP(=O)(O)O)S)O)O)N=C(NC2=O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C10H16N5O13P3S/c11-10-13-7-4(8(18)14-10)12-2-15(7)9-6(17)5(16)3(26-9)1-25-31(24,32)28-30(22,23)27-29(19,20)21/h2-3,5-6,9,16-17H,1H2,(H,22,23)(H,24,32)(H2,19,20,21)(H3,11,13,14,18)/t3-,5-,6-,9-,31-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: YRUWXBKVSXSSGS-KIOICMOXSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 5'-O-[(R)-{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}(sulfanyl)phosphoryl]guanosine
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: [[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1H-purin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-sulfanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate

PDBエントリ

全4件を表示しています

PDB-2v0n:
ACTIVATED RESPONSE REGULATOR PLED IN COMPLEX WITH C-DIGMP AND GTP- ALPHA-S

PDB-4h54:
Crystal structure of the diguanylate cyclase DgcZ

PDB-4isz:
RNA ligase RtcB in complex with GTP alphaS and Mn(II)

PDB-4zvf:
Crystal structure of GGDEF domain of the E. coli DosC - form II (GTP-alpha-S-bound)