ChemComp-GAP: GLYCYL-ADENOSINE-5'-PHOSPHATE

IDまたはキーワード:

登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: GAP
名称	名称: glycyl-adenosine-5'-phosphate / 日化辞名称: グリシン5′-アデニリル

組成

組成式: C₁₂H₁₇N₆O₈P / 原子数: 44 / 化学式量: 404.273 / 形式電荷: 0

その他

1ggm

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: GAP / モデル座標のPDB-ID: 1GGM

履歴

作成	1999年7月8日
記述子を修正	2011年6月4日

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UniChem /

ChemSpider /

Brenda /

ChEBI

/

日化辞 /

/

Rhea /

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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SMILES

ACDLabs 10.04	[O-]P(=O)(OC(=O)C[NH3+])OCC3OC(n2cnc1c(ncnc12)N)C(O)C3O
CACTVS 3.341	Nc1ncnc2n(cnc12)[CH]3O[CH](CO[P]([O-])(=O)OC(=O)C[NH3+])[CH](O)[CH]3O
OpenEye OEToolkits 1.5.0	c1nc(c2c(n1)n(cn2)C3C(C(C(O3)COP(=O)([O-])OC(=O)C[NH3+])O)O)N

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SMILES CANONICAL

CACTVS 3.341	Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]3O[C@H](CO[P]([O-])(=O)OC(=O)C[NH3+])[C@@H](O)[C@H]3O
OpenEye OEToolkits 1.5.0	c1nc(c2c(n1)n(cn2)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CO[P@@](=O)([O-])OC(=O)C[NH3+])O)O)N

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InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C12H17N6O8P/c13-1-6(19)26-27(22,23)24-2-5-8(20)9(21)12(25-5)18-4-17-7-10(14)15-3-16-11(7)18/h3-5,8-9,12,20-21H,1-2,13H2,(H,22,23)(H2,14,15,16)/t5-,8-,9-,12-/m1/s1

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InChIKey

InChI 1.03	HROXHMRQKGGIFT-JJNLEZRASA-N

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SYSTEMATIC NAME

ACDLabs 10.04	5'-O-{[(ammonioacetyl)oxy]phosphinato}adenosine
OpenEye OEToolkits 1.5.0	[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methyl 2-azaniumylethanoyl phosphate

全4件を表示しています

PDB-1ggm:
GLYCYL-TRNA SYNTHETASE FROM THERMUS THERMOPHILUS COMPLEXED WITH GLYCYL-ADENYLATE

PDB-3pzc:
Crystal structure of class II aaRS homologue (Bll0957) complexed with Coenzyme A

PDB-4oxi:
Crystal structure of Vibrio cholerae adenylation domain AlmE in complex with glycyl-adenosine-5'-phosphate

PDB-5e6m:
Crystal structure of human wild type GlyRS bound with tRNAGly

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関連情報:EMDBヘッダ

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