ChemComp-G2C: 2'-deoxy-5'-O-[(S)-{[(R)-[dichloro(phosphono)methyl](hydroxy)phos...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: G2C
• 名称: 名称: 2'-deoxy-5'-O-[(S)-{[(R)-[dichloro(phosphono)methyl](hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]guanosine

Chemical information

組成

組成式: C₁₁H₁₆Cl₂N₅O₁₂P₃ / 原子数: 49 / 化学式量: 574.098 / 形式電荷: 0

• その他: タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: G2C / 理論座標の詳細: Corina

履歴

作成	2009年9月11日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 11.02: O=P(O)(O)C(Cl)(Cl)P(=O)(O)OP(=O)(O)OCC3OC(n2cnc1c2N=C(N)NC1=O)CC3O
• CACTVS 3.352: NC1=Nc2n(cnc2C(=O)N1)[CH]3C[CH](O)[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)C(Cl)(Cl)[P](O)(O)=O)O3
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: c1nc2c(n1C3CC(C(O3)COP(=O)(O)OP(=O)(C(P(=O)(O)O)(Cl)Cl)O)O)N=C(NC2=O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.352: NC1=Nc2n(cnc2C(=O)N1)[C@H]3C[C@H](O)[C@@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)C(Cl)(Cl)[P](O)(O)=O)O3
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: c1nc2c(n1[C@H]3C[C@@H]([C@H](O3)CO[P@](=O)(O)O[P@@](=O)(C(P(=O)(O)O)(Cl)Cl)O)O)N=C(NC2=O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C11H16Cl2N5O12P3/c12-11(13,31(21,22)23)32(24,25)30-33(26,27)28-2-5-4(19)1-6(29-5)18-3-15-7-8(18)16-10(14)17-9(7)20/h3-6,19H,1-2H2,(H,24,25)(H,26,27)(H2,21,22,23)(H3,14,16,17,20)/t4-,5+,6+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: FJDLJIOCZHPQHU-KVQBGUIXSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 11.02: 2'-deoxy-5'-O-[(S)-{[(R)-[dichloro(phosphono)methyl](hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]guanosine
• OpenEye OEToolkits 1.6.1: [[[[(2R,3S,5R)-5-(2-azanyl-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl]-dichloro-methyl]phosphonic acid

PDBエントリ

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PDB-3jpn:
Ternary complex of DNA polymerase beta with a dideoxy terminated primer and 2'-deoxyguanosine 5'-beta, gamma-dichloro methylene triphosphate