ChemComp-G0B: (1S,2R,3S,4R,6S)-4,6-bis{[amino(iminio)methyl]amino}-2-{[3-O-(2,6...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: G0B
• 名称: 名称: (1S,2R,3S,4R,6S)-4,6-bis{[amino(iminio)methyl]amino}-2-{[3-O-(2,6-bis{[amino(iminio)methyl]amino}-2,6-dideoxy-beta-L-glucopyranosyl)-beta-D-arabinofuranosyl]oxy}-3-hydroxycyclohexyl 2,6-bis{[amino(iminio)methyl]amino}-2,6-dideoxy-beta-L-glucopyranoside

Chemical information

組成

組成式: C₂₉H₆₄N₁₈O₁₃ / 原子数: 124 / 化学式量: 872.931 / 形式電荷: 6

その他

2juk

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: G0B / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 2JUK

履歴

作成	2007年11月13日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify name	2011年6月7日
記述子を修正	2011年6月7日
識別子を修正	2011年6月7日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O(C2C(OC1OC(CNC(=[NH2+])\N)C(O)C(O)C1NC(=[NH2+])\N)C(NC(=[NH2+])\N)CC(NC(=[NH2+])\N)C2O)C4OC(C(OC3OC(CNC(=[NH2+])\N)C(O)C(O)C3NC(=[NH2+])\N)C4O)CO
• CACTVS 3.370: NC(=[NH2+])NC[CH]1O[CH](O[CH]2[CH](O)[CH](O[CH]2CO)O[CH]3[CH](O)[CH](C[CH](NC(N)=[NH2+])[CH]3O[CH]4O[CH](CNC(N)=[NH2+])[CH](O)[CH](O)[CH]4NC(N)=[NH2+])NC(N)=[NH2+])[CH](NC(N)=[NH2+])[CH](O)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: C1C(C(C(C(C1NC(=[NH2+])N)OC2C(C(C(C(O2)CNC(=[NH2+])N)O)O)NC(=[NH2+])N)OC3C(C(C(O3)CO)OC4C(C(C(C(O4)CNC(=[NH2+])N)O)O)NC(=[NH2+])N)O)O)NC(=[NH2+])N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: NC(=[NH2+])NC[C@@H]1O[C@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2CO)O[C@@H]3[C@@H](O)[C@@H](C[C@H](NC(N)=[NH2+])[C@@H]3O[C@H]4O[C@@H](CNC(N)=[NH2+])[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]4NC(N)=[NH2+])NC(N)=[NH2+])[C@@H](NC(N)=[NH2+])[C@H](O)[C@H]1O
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: C1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@H]([C@H]1NC(=[NH2+])N)O[C@@H]2[C@H]([C@@H]([C@H]([C@@H](O2)CNC(=[NH2+])N)O)O)NC(=[NH2+])N)O[C@H]3[C@H]([C@@H]([C@H](O3)CO)O[C@@H]4[C@H]([C@@H]([C@H]([C@@H](O4)CNC(=[NH2+])N)O)O)NC(=[NH2+])N)O)O)NC(=[NH2+])N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C29H58N18O13/c30-24(31)42-2-7-13(50)15(52)10(46-28(38)39)21(55-7)58-18-6(45-27(36)37)1-5(44-26(34)35)12(49)20(18)60-23-17(54)19(9(4-48)57-23)59-22-11(47-29(40)41)16(53)14(51)8(56-22)3-43-25(32)33/h5-23,48-54H,1-4H2,(H4,30,31,42)(H4,32,33,43)(H4,34,35,44)(H4,36,37,45)(H4,38,39,46)(H4,40,41,47)/p+6/t5-,6+,7+,8+,9-,10+,11+,12+,13+,14+,15+,16+,17+,18+,19-,20-,21-,22-,23+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: PKRWVRYPYSMBDP-OBAWDCFYSA-T

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: (1S,2R,3S,4R,6S)-4,6-bis{[amino(iminio)methyl]amino}-2-{[3-O-(2,6-bis{[amino(iminio)methyl]amino}-2,6-dideoxy-beta-L-glucopyranosyl)-beta-D-arabinofuranosyl]oxy}-3-hydroxycyclohexyl 2,6-bis{[amino(iminio)methyl]amino}-2,6-dideoxy-beta-L-glucopyranoside
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: [[[(1S,2S,3R,4S,5R)-5-[[azaniumylidene(azanyl)methyl]amino]-2-[(2R,3S,4S,5R,6S)-3-[[azaniumylidene(azanyl)methyl]amino]-6-[[[azaniumylidene(azanyl)methyl]amino]methyl]-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3-[(2S,3S,4S,5R)-4-[(2R,3S,4S,5R,6S)-3-[[azaniumylidene(azanyl)methyl]amino]-6-[[[azaniumylidene(azanyl)methyl]amino]methyl]-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-5-(hydroxymethyl)-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]oxy-4-oxidanyl-cyclohexyl]amino]-azanyl-methylidene]azanium

PDBエントリ

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PDB-2juk:
guanidino neomycin B recognition of an HIV-1 RNA helix