ChemComp-F7E: [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-pur...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: F7E
• 名称: 名称: [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{S},4~{R},6~{R})-6-methyl-3,4-bis(oxidanyl)-5-oxidanylidene-oxan-2-yl] hydrogen phosphate; 日化辞名称: GDP-4-ケト-6-デオキシ-D-マンノ-ス

Chemical information

組成

組成式: C₁₆H₂₃N₅O₁₅P₂ / 原子数: 61 / 化学式量: 587.326 / 形式電荷: 0

その他

6gpl

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: F7E / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 6GPL

履歴

作成	2018年6月6日
公開	2018年7月18日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / ChEBI / HMDB / KEGG_Ligand / Metabolights / NMRShiftDB / 日化辞 / PubChem / SureChEMBL / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• CACTVS 3.385: C[CH]1O[CH](O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]2O[CH]([CH](O)[CH]2O)n3cnc4C(=O)NC(=Nc34)N)[CH](O)[CH](O)C1=O
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: CC1C(=O)C(C(C(O1)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2C(C(C(O2)n3cnc4c3N=C(NC4=O)N)O)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: C[C@H]1O[C@H](O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O)[C@@H]2O)n3cnc4C(=O)NC(=Nc34)N)[C@@H](O)[C@@H](O)C1=O
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: C[C@@H]1C(=O)[C@@H]([C@@H]([C@H](O1)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H]2[C@H]([C@H]([C@@H](O2)n3cnc4c3N=C(NC4=O)N)O)O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C16H23N5O15P2/c1-4-7(22)9(24)11(26)15(33-4)35-38(30,31)36-37(28,29)32-2-5-8(23)10(25)14(34-5)21-3-18-6-12(21)19-16(17)20-13(6)27/h3-5,8-11,14-15,23-26H,2H2,1H3,(H,28,29)(H,30,31)(H3,17,19,20,27)/t4-,5-,8-,9+,10-,11+,14-,15-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: PNHLMHWWFOPQLK-BKUUWRAGSA-N

SYSTEMATIC NAME

• OpenEye OEToolkits 2.0.6: [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{S},4~{R},6~{R})-6-methyl-3,4-bis(oxidanyl)-5-oxidanylidene-oxan-2-yl] hydrogen phosphate

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-6gpl:
Crystal structure of human GDP-D-mannose 4,6-dehydratase in complex with GDP-4k6d-Man