ChemComp-F2U: 2'-deoxy-5-ethynyl-2',2'-difluorouridine

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: F2U
• 名称: 名称: 2'-deoxy-5-ethynyl-2',2'-difluorouridine / 別称: 2'-deoxy-2',2'-difluoro-5-ethynyluridine

Chemical information

組成

組成式: C₁₁H₁₀F₂N₂O₅ / 原子数: 30 / 化学式量: 288.204 / 形式電荷: 0

その他

4oql

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: F2U / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4OQL

履歴

作成	2014年2月12日
Modify synonyms	2014年2月17日
公開	2014年8月13日
Modify synonyms	2021年3月13日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C1NC(=O)N(C=C1C#C)C2OC(C(O)C2(F)F)CO
• CACTVS 3.370: OC[CH]1O[CH](N2C=C(C#C)C(=O)NC2=O)C(F)(F)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C#CC1=CN(C(=O)NC1=O)C2C(C(C(O2)CO)O)(F)F

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: OC[C@H]1O[C@@H](N2C=C(C#C)C(=O)NC2=O)C(F)(F)[C@@H]1O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C#CC1=CN(C(=O)NC1=O)[C@H]2C([C@@H]([C@H](O2)CO)O)(F)F

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C11H10F2N2O5/c1-2-5-3-15(10(19)14-8(5)18)9-11(12,13)7(17)6(4-16)20-9/h1,3,6-7,9,16-17H,4H2,(H,14,18,19)/t6-,7-,9-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: JFVJRPYRLUHQTG-ZXFLCMHBSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 2'-deoxy-5-ethynyl-2',2'-difluorouridine
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: 1-[(2R,4R,5R)-3,3-bis(fluoranyl)-5-(hydroxymethyl)-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]-5-ethynyl-pyrimidine-2,4-dione

PDBエントリ

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PDB-4oql:
Crystal structure of thymidine kinase from herpes simplex virus type 1 in complex with dF-EdU