+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | structure of FliD-FliC at a 10:10 stoichiometry | |||||||||
![]() | ||||||||||
![]() |
| |||||||||
![]() | Complex / STRUCTURAL PROTEIN | |||||||||
機能・相同性 | ![]() TLR5 cascade / MyD88 cascade initiated on plasma membrane / bacterial-type flagellum filament cap / NFkB and MAPK activation mediated by TRAF6 / bacterial-type flagellum hook / The IPAF inflammasome / bacterial-type flagellum / bacterial-type flagellum-dependent cell motility / cell adhesion / receptor ligand activity ...TLR5 cascade / MyD88 cascade initiated on plasma membrane / bacterial-type flagellum filament cap / NFkB and MAPK activation mediated by TRAF6 / bacterial-type flagellum hook / The IPAF inflammasome / bacterial-type flagellum / bacterial-type flagellum-dependent cell motility / cell adhesion / receptor ligand activity / structural molecule activity / extracellular space / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.27 Å | |||||||||
![]() | Chen LX / Chen XQ / Zhang FF / Jiang WX / Xing Q | |||||||||
資金援助 | ![]()
| |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural insights into the initiation of bacterial flagellar filament elongation 著者: Chen LX / Dong X / Zhang FF / Cheng XQ / Wang X / Jiang WX / Ma LX / Xing Q | |||||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
添付画像 |
---|
-
ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 778.5 MB | ![]() | |
---|---|---|---|---|
ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 16.7 KB 16.7 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 19.9 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 89.7 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 5.9 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 765.6 MB 765.6 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 790.4 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 790 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 29.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 39.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 9m6hMC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
---|---|
類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
-
リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
---|---|
「今月の分子」の関連する項目 |
-
マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.75556 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
|
-添付データ
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_63662_half_map_1.map | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
投影像・断面図 |
| ||||||||||||
密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_63662_half_map_2.map | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
投影像・断面図 |
| ||||||||||||
密度ヒストグラム |
-
試料の構成要素
-全体 : the FliD-FliC with 10:10 stoichiometry
全体 | 名称: the FliD-FliC with 10:10 stoichiometry |
---|---|
要素 |
|
-超分子 #1: the FliD-FliC with 10:10 stoichiometry
超分子 | 名称: the FliD-FliC with 10:10 stoichiometry / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
-分子 #1: Flagellar hook-associated protein 2
分子 | 名称: Flagellar hook-associated protein 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 詳細: Sequence reference for strain 'Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium' is not available in UniProt at the time of biocuration. Current sequence reference is from UniProt id P16328. コピー数: 10 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 45.971234 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: DLTKNEKGRL TPITKQQSAN SAKLTAYGTL KSALEKFQTA NTALNKADLF KSTVASSTTE DLKVSTTAGA AAGTYKINVT QLAAAQSLA TKTTFATTKE QLGDTSVTSR TIKIEQPGRK EPLEIKLDKG DTSMEAIRDA INDADSGIAA SIVKVKENEF Q LVLTANSG ...文字列: DLTKNEKGRL TPITKQQSAN SAKLTAYGTL KSALEKFQTA NTALNKADLF KSTVASSTTE DLKVSTTAGA AAGTYKINVT QLAAAQSLA TKTTFATTKE QLGDTSVTSR TIKIEQPGRK EPLEIKLDKG DTSMEAIRDA INDADSGIAA SIVKVKENEF Q LVLTANSG TDNTMKITVE GDTKLNDLLA YDSTTNTGNM QELVKAENAK LNVNGIDIER QSNTVTDAPQ GITLTLTKKV TD ATVTVTK DDTKAKEAIK SWVDAYNSLV DTFSSLTKYT AVEPGEEASD KNGALLGDSV VRTIQTGIRA QFANSGSNSA FKT MAEIGI TQDGTSGKLK IDDDKLTKVL KDNTAAAREL LVGDGKETGI TTKIATEVKS YLADDGIIDN AQDNVNATLK SLTK QYLSV SNSIDETVAR YKAQFTQLDT MMSKL UniProtKB: Flagellar hook-associated protein 2 |
-分子 #2: Flagellin
分子 | 名称: Flagellin / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 詳細: Sequence reference for strain 'Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium' is not available in UniProt at the time of biocuration. Current sequence reference is from UniProt id P06179. コピー数: 10 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 41.695375 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: FTANIKGLTQ ASRNANDGIS IAQTTEGALN EINNNLQRVR ELAVQSANST NSQSDLDSIQ AEITQRLNEI DRVSGQTQFN GVKVLAQDN TLTIQVGAND GETIDIDLKQ INSQTLGLDT LNVQQKYKVS DTAATVTGYA DTTIALDNST FKASATGLGG T DQKIDGDL ...文字列: FTANIKGLTQ ASRNANDGIS IAQTTEGALN EINNNLQRVR ELAVQSANST NSQSDLDSIQ AEITQRLNEI DRVSGQTQFN GVKVLAQDN TLTIQVGAND GETIDIDLKQ INSQTLGLDT LNVQQKYKVS DTAATVTGYA DTTIALDNST FKASATGLGG T DQKIDGDL KFDDTTGKYY AKVTVTGGTG KDGYYEVSVD KTNGEVTLAG GATSPLTGGL PATATEDVKN VQVANADLTE AK AALTAAG VTGTASVVKM SYTDNNGKTI DGGLAVKVGD DYYSATQNKD GSISINTTKY TADDGTSKTA LNKLGGADGK TEV VSIGGK TYAASKAEGH NFKAQPDLAE AAATTTENPL QKIDAALAQV DTLRSDLGAV QNRFNSAITN LGNTVNNLTS ARSR I UniProtKB: Flagellin |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
---|---|
![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-
試料調製
緩衝液 | pH: 8 |
---|---|
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-
電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TALOS ARCTICA |
---|---|
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 30.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: OTHER / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.0 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Talos Arctica / 画像提供: FEI Company |