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- EMDB-54631: Ternary cryo-EM structure of chicken ALG12 with Dol25-PP-GlcNAc2M... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-54631
タイトルTernary cryo-EM structure of chicken ALG12 with Dol25-PP-GlcNAc2Man7, Dol25-P-Man, and Fab
マップデータ
試料
  • 複合体: Ternary complex of chicken ALG12 with Gg12-11 Fab, anti-kappa light chain nanobody as well as Dol25-P-Man and Dol25-PP-GlcNAc2Man7 substrates
    • 複合体: Anti-kapp light chain nanobody
    • 複合体: Gg12-11 Fab
      • タンパク質・ペプチド: Gg12-11 Fab heavy chain
      • タンパク質・ペプチド: Gg12-11 Fab light chain
    • 複合体: ALG12
      • タンパク質・ペプチド: Mannosyltransferase
  • リガンド: [(3S,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraenyl] dihydrogen phosphate
  • リガンド: [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-5-[(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-5-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{R},6~{R})-4-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{R},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-4-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4-oxidanyl-oxan-2-yl]oxy-6-(hydroxymethyl)-4-oxidanyl-oxan-2-yl] [oxidanyl-[(3~{S},6~{Z},10~{E},14~{E})-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraenoxy]phosphoryl] hydrogen phosphate
  • リガンド: CHOLESTEROL HEMISUCCINATE
  • リガンド: Lauryl Maltose Neopentyl Glycol
  • リガンド: water
キーワードMannosyltransferase / ternary complex / N-linked glycosylation / TRANSFERASE
機能・相同性
機能・相同性情報


dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase activity / Biosynthesis of the N-glycan precursor (dolichol lipid-linked oligosaccharide, LLO) and transfer to a nascent protein / alpha-1,6-mannosyltransferase activity / dolichol-linked oligosaccharide biosynthetic process / protein N-linked glycosylation / 転移酵素; グリコシル基を移すもの; 六炭糖残基を移すもの / endoplasmic reticulum membrane
類似検索 - 分子機能
GPI mannosyltransferase / Alg9-like mannosyltransferase family
類似検索 - ドメイン・相同性
Mannosyltransferase
類似検索 - 構成要素
生物種Lama glama (ラマ) / synthetic construct (人工物) / Gallus gallus (ニワトリ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.42 Å
データ登録者Alexander JAN / Chen SY / Mukherjee S / de Capitani M / Irobalieva RN / Rossi L / Agrawal P / Kowal J / Meirelles MA / Aebi M ...Alexander JAN / Chen SY / Mukherjee S / de Capitani M / Irobalieva RN / Rossi L / Agrawal P / Kowal J / Meirelles MA / Aebi M / Reymond JL / Kossiakoff AA / Riniker S / Locher KP
資金援助 スイス, 2件
OrganizationGrant number国
Swiss National Science Foundation310030_196862 スイス
Swiss National Science Foundation315230_220007 スイス
引用ジャーナル: Nat Chem Biol / 年: 2026
タイトル: Structures of ALG3/9/12 reveal the assembly logic of the N-glycan oligomannose core.
著者: J Andrew N Alexander / Shu-Yu Chen / Somnath Mukherjee / Mario de Capitani / Rossitza N Irobalieva / Lorenzo Rossi / Parth Agrawal / Julia Kowal / Matheus A Meirelles / Markus Aebi / Jean- ...著者: J Andrew N Alexander / Shu-Yu Chen / Somnath Mukherjee / Mario de Capitani / Rossitza N Irobalieva / Lorenzo Rossi / Parth Agrawal / Julia Kowal / Matheus A Meirelles / Markus Aebi / Jean-Louis Reymond / Anthony A Kossiakoff / Sereina Riniker / Kaspar P Locher /
要旨: Asparagine-linked glycans are essential for the maturation and function of most eukaryotic secretory proteins. The biosynthesis and transfer of dolichylpyrophosphate-anchored GlcNAcManGlc glycan is a ...Asparagine-linked glycans are essential for the maturation and function of most eukaryotic secretory proteins. The biosynthesis and transfer of dolichylpyrophosphate-anchored GlcNAcManGlc glycan is a highly conserved process occurring in the endoplasmic reticulum (ER) membrane and involving over a dozen membrane proteins whose dysfunction is linked to congenital disorders of glycosylation (CDGs). Three membrane-integral mannosyltransferases, ALG3, ALG9 and ALG12, mediate four consecutive mannosylation reactions that convert GlcNAcMan to GlcNAcMan. Here, using chemoenzymatically synthesized lipid-linked glycan donor and acceptor analogs, we recapitulated this biosynthetic pathway in vitro. High-resolution cryo-electron microscopy structures of pseudo-Michaelis complexes of each step revealed how the branched glycan is accurately synthesized and unwanted side products are averted. Molecular dynamics simulations and mutagenesis studies uncovered a subtle but precise mechanism selecting the dolichylphosphomannose donor substrate over dolichylphosphoglucose, which is also present in the ER membrane. Our results also provide mechanistic explanations for enzyme dysfunction in CDGs and offer opportunities for N-glycan engineering.
履歴
登録2025年8月1日-
ヘッダ(付随情報) 公開2026年3月18日-
マップ公開2026年3月18日-
更新2026年3月25日-
現状2026年3月25日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_54631.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_54631.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 512 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
0.65 Å/pix.
x 512 pix.
= 332.8 Å		0.65 Å/pix.
x 512 pix.
= 332.8 Å		0.65 Å/pix.
x 512 pix.
= 332.8 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.65 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.34
最小 - 最大-1.4673973 - 2.3104947
平均 (標準偏差)-0.00003855409 (±0.034168508)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ512512512
Spacing512512512
セルA=B=C: 332.8 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_54631_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #1

ファイルemd_54631_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Ternary complex of chicken ALG12 with Gg12-11 Fab, anti-kappa lig...

全体名称: Ternary complex of chicken ALG12 with Gg12-11 Fab, anti-kappa light chain nanobody as well as Dol25-P-Man and Dol25-PP-GlcNAc2Man7 substrates
要素
  • 複合体: Ternary complex of chicken ALG12 with Gg12-11 Fab, anti-kappa light chain nanobody as well as Dol25-P-Man and Dol25-PP-GlcNAc2Man7 substrates
    • 複合体: Anti-kapp light chain nanobody
    • 複合体: Gg12-11 Fab
      • タンパク質・ペプチド: Gg12-11 Fab heavy chain
      • タンパク質・ペプチド: Gg12-11 Fab light chain
    • 複合体: ALG12
      • タンパク質・ペプチド: Mannosyltransferase
  • リガンド: [(3S,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraenyl] dihydrogen phosphate
  • リガンド: [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-5-[(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-5-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{R},6~{R})-4-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{R},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-4-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4-oxidanyl-oxan-2-yl]oxy-6-(hydroxymethyl)-4-oxidanyl-oxan-2-yl] [oxidanyl-[(3~{S},6~{Z},10~{E},14~{E})-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraenoxy]phosphoryl] hydrogen phosphate
  • リガンド: CHOLESTEROL HEMISUCCINATE
  • リガンド: Lauryl Maltose Neopentyl Glycol
  • リガンド: water

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超分子 #1: Ternary complex of chicken ALG12 with Gg12-11 Fab, anti-kappa lig...

超分子名称: Ternary complex of chicken ALG12 with Gg12-11 Fab, anti-kappa light chain nanobody as well as Dol25-P-Man and Dol25-PP-GlcNAc2Man7 substrates
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#3

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超分子 #2: Anti-kapp light chain nanobody

超分子名称: Anti-kapp light chain nanobody / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1
由来(天然)生物種: Lama glama (ラマ)

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超分子 #3: Gg12-11 Fab

超分子名称: Gg12-11 Fab / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #2-#3
由来(天然)生物種: synthetic construct (人工物)

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超分子 #4: ALG12

超分子名称: ALG12 / タイプ: complex / ID: 4 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1
由来(天然)生物種: Gallus gallus (ニワトリ)

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分子 #1: Mannosyltransferase

分子名称: Mannosyltransferase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: 転移酵素; グリコシル基を移すもの; 六炭糖残基を移すもの
由来(天然)生物種: Gallus gallus (ニワトリ)
分子量理論値: 56.295227 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: GPGGSTMAQK RSSSGRSFPL LLLIIVVAFV HLTVCPFTKV QESFNLQAIH DVVYHQLDLD KYDHHEFPGV VPRTFLGPIF IAALSSPAI YILSLLKMSK FYSQLIVRGS LGLSVIYTLW KLQKEVRKQF GATTSTVFCL ITVTQFHLMF YCTRTLPNVF A LPFVLLAL ...文字列:
GPGGSTMAQK RSSSGRSFPL LLLIIVVAFV HLTVCPFTKV QESFNLQAIH DVVYHQLDLD KYDHHEFPGV VPRTFLGPIF IAALSSPAI YILSLLKMSK FYSQLIVRGS LGLSVIYTLW KLQKEVRKQF GATTSTVFCL ITVTQFHLMF YCTRTLPNVF A LPFVLLAL TFWIQQKQRP FIWFSALAII VFRSELAIFL GLMLLVTFLT KRISVLKILS HAVPAGFFWL GLTVAVDSLF WR QLVWPEG KVLWYNTILN KSSNWGTSPF FWYFYSALPR ALGCSIVFVP LGAAEKRTRI LLLPALGFIF LYSFLPHKEL RFI IYTFPV FNIVAAKVCS RILNNYRKSW LYKLGSLFVV MHLLVNAAYS GTSLYVSHFN YPGGVAIQKL HELVPSTAEV SVHI DVAAA QTGVSRFLEI NSDWRYDKRE DVKPGDQLMF SYTHILMETN PLQISHYKTT HRPLANIPGI SKIGLNLTAL PPFTL NLKP KLVLLEKLPL SS

UniProtKB: Mannosyltransferase

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分子 #2: Gg12-11 Fab heavy chain

分子名称: Gg12-11 Fab heavy chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: synthetic construct (人工物)
分子量理論値: 25.119914 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' (大腸菌)
配列文字列: EISEVQLVES GGGLVQPGGS LRLSCAASGF NVSYSSIHWV RQAPGKGLEW VASISSYYGY TSYADSVKGR FTISADTSKN TAYLQMNSL RAEDTAVYYC ARYYWDWWRG GWAFDYWGQG TLVTVSSAST KGPSVFPLAP SSKSTSGGTA ALGCLVKDYF P EPVTVSWN ...文字列:
EISEVQLVES GGGLVQPGGS LRLSCAASGF NVSYSSIHWV RQAPGKGLEW VASISSYYGY TSYADSVKGR FTISADTSKN TAYLQMNSL RAEDTAVYYC ARYYWDWWRG GWAFDYWGQG TLVTVSSAST KGPSVFPLAP SSKSTSGGTA ALGCLVKDYF P EPVTVSWN SGALTSGVHT FPAVLQSSGL YSLSSVVTVP SSSLGTQTYI CNVNHKPSNT KVDKKVEPKS CDKTHT

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分子 #3: Gg12-11 Fab light chain

分子名称: Gg12-11 Fab light chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: synthetic construct (人工物)
分子量理論値: 23.346848 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' (大腸菌)
配列文字列: SDIQMTQSPS SLSASVGDRV TITCRASQSV SSAVAWYQQK PGKAPKLLIY SASSLYSGVP SRFSGSRSGT DFTLTISSLQ PEDFATYYC QQSSYDPITF GQGTKVEIKR TVAAPSVFIF PPSDSQLKSG TASVVCLLNN FYPREAKVQW KVDNALQSGN S QESVTEQD ...文字列:
SDIQMTQSPS SLSASVGDRV TITCRASQSV SSAVAWYQQK PGKAPKLLIY SASSLYSGVP SRFSGSRSGT DFTLTISSLQ PEDFATYYC QQSSYDPITF GQGTKVEIKR TVAAPSVFIF PPSDSQLKSG TASVVCLLNN FYPREAKVQW KVDNALQSGN S QESVTEQD SKDSTYSLSS TLTLSKADYE KHKVYACEVT HQGLSSPVTK SFNRGEC

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分子 #4: [(3S,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen...

分子名称: [(3S,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraenyl] dihydrogen phosphate
タイプ: ligand / ID: 4 / コピー数: 1 / 式: A1JMT
分子量理論値: 440.596 Da

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分子 #5: [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-5-[(2~{S},3~{R},4~{R...

分子名称: [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-5-[(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-5-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{R},6~{R})-4-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6- ...名称: [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-5-[(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-5-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{R},6~{R})-4-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-6-[[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{R},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-4-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4-oxidanyl-oxan-2-yl]oxy-6-(hydroxymethyl)-4-oxidanyl-oxan-2-yl] [oxidanyl-[(3~{S},6~{Z},10~{E},14~{E})-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraenoxy]phosphoryl] hydrogen phosphate
タイプ: ligand / ID: 5 / コピー数: 1 / 式: A1JMC
分子量理論値: 2.061945 KDa

+
分子 #6: CHOLESTEROL HEMISUCCINATE

分子名称: CHOLESTEROL HEMISUCCINATE / タイプ: ligand / ID: 6 / コピー数: 1 / 式: Y01
分子量理論値: 486.726 Da
Chemical component information

ChemComp-Y01:
CHOLESTEROL HEMISUCCINATE

+
分子 #7: Lauryl Maltose Neopentyl Glycol

分子名称: Lauryl Maltose Neopentyl Glycol / タイプ: ligand / ID: 7 / コピー数: 1 / 式: AV0
分子量理論値: 1.005188 KDa
Chemical component information

ChemComp-AV0:
Lauryl Maltose Neopentyl Glycol

+
分子 #8: water

分子名称: water / タイプ: ligand / ID: 8 / コピー数: 85 / 式: HOH
分子量理論値: 18.015 Da
Chemical component information

ChemComp-HOH:
WATER

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

濃度3.9 mg/mL
緩衝液pH: 7.5
凍結凍結剤: ETHANE-PROPANE

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電子顕微鏡法

顕微鏡TFS KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)
平均電子線量: 43.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD
最大 デフォーカス（公称値）: 2.8000000000000003 µm
最小 デフォーカス（公称値）: 0.6 µm
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

CTF補正タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION
初期モデルモデルのタイプ: INSILICO MODEL
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.42 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC / 使用した粒子像数: 580115
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
FSC曲線 (解像度の算出)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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