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基本情報
| 登録情報 | ![]() | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| タイトル | Human kidney respiratory complex III | |||||||||
マップデータ | ||||||||||
試料 |
| |||||||||
キーワード | human / kidney / respiratory complex III / MEMBRANE PROTEIN | |||||||||
| 機能・相同性 | 機能・相同性情報Complex III assembly / Complex III assembly / Complex III assembly / Complex III assembly / Complex III assembly / response to D-galactosamine / Complex III assembly / Complex III assembly / Complex III assembly / Complex III assembly ...Complex III assembly / Complex III assembly / Complex III assembly / Complex III assembly / Complex III assembly / response to D-galactosamine / Complex III assembly / Complex III assembly / Complex III assembly / Complex III assembly / response to mercury ion / Respiratory electron transport / subthalamus development / pons development / response to cobalamin / cerebellar Purkinje cell layer development / mitochondrial respiratory chain complex III assembly / pyramidal neuron development / response to alkaloid / cellular respiration / thalamus development / Mitochondrial protein import / respiratory chain complex / respiratory chain complex III / oxidative phosphorylation / quinol-cytochrome-c reductase / response to glucagon / quinol-cytochrome-c reductase activity / response to copper ion / mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c / hypothalamus development / midbrain development / electron transport coupled proton transport / animal organ regeneration / response to hyperoxia / response to cadmium ion / Mitochondrial protein degradation / aerobic respiration / response to activity / respiratory electron transport chain / generation of precursor metabolites and energy / hippocampus development / response to calcium ion / metalloendopeptidase activity / response to toxic substance / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / response to ethanol / response to hypoxia / electron transfer activity / oxidoreductase activity / mitochondrial inner membrane / mitochondrial matrix / response to xenobiotic stimulus / ubiquitin protein ligase binding / heme binding / protein-containing complex binding / mitochondrion / proteolysis / nucleoplasm / metal ion binding / nucleus / membrane 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
| 生物種 | Homo sapiens (ヒト) | |||||||||
| 手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.96 Å | |||||||||
データ登録者 | Zhang Z / Lyu M / Tringides M | |||||||||
| 資金援助 | 米国, 1件
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引用 | ジャーナル: To Be Publishedタイトル: Human kidney respiratory complex III 著者: Zhang Z / Lyu M | |||||||||
| 履歴 |
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構造の表示
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
| マップデータ | emd_45567.map.gz | 63 MB | EMDBマップデータ形式 | |
|---|---|---|---|---|
| ヘッダ (付随情報) | emd-45567-v30.xml emd-45567.xml | 24.9 KB 24.9 KB | 表示 表示 | EMDBヘッダ |
| FSC (解像度算出) | emd_45567_fsc.xml | 11.8 KB | 表示 | FSCデータファイル |
| 画像 | emd_45567.png | 66.6 KB | ||
| Filedesc metadata | emd-45567.cif.gz | 7.1 KB | ||
| その他 | emd_45567_half_map_1.map.gz emd_45567_half_map_2.map.gz | 115.9 MB 115.9 MB | ||
| アーカイブディレクトリ | http://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-45567 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-45567 | HTTPS FTP |
-検証レポート
| 文書・要旨 | emd_45567_validation.pdf.gz | 1.2 MB | 表示 | EMDB検証レポート |
|---|---|---|---|---|
| 文書・詳細版 | emd_45567_full_validation.pdf.gz | 1.2 MB | 表示 | |
| XML形式データ | emd_45567_validation.xml.gz | 19.3 KB | 表示 | |
| CIF形式データ | emd_45567_validation.cif.gz | 25 KB | 表示 | |
| アーカイブディレクトリ | https://ftp.pdbj.org/pub/emdb/validation_reports/EMD-45567 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/validation_reports/EMD-45567 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
| 関連構造データ | ![]() 9cg3MC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
|---|---|
| 類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 F&H 検索 |
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リンク
| EMDBのページ | EMDB (EBI/PDBe) / EMDataResource |
|---|---|
| 「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
| ファイル | ダウンロード / ファイル: emd_45567.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 125 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES) | ||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.07 Å | ||||||||||||||||||||
| 密度 |
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| 対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
| 詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
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試料の構成要素
+全体 : respiratory complex III
+超分子 #1: respiratory complex III
+分子 #1: Cytochrome b-c1 complex subunit 8
+分子 #2: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial
+分子 #3: Cytochrome b-c1 complex subunit 9
+分子 #4: Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial
+分子 #5: Cytochrome b-c1 complex subunit 7
+分子 #6: Cytochrome b-c1 complex subunit 10
+分子 #7: Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial
+分子 #8: Cytochrome b
+分子 #9: Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial
+分子 #10: Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial
+分子 #11: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
+分子 #12: HEME C
+分子 #13: PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
-実験情報
-構造解析
| 手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
|---|---|
解析 | 単粒子再構成法 |
| 試料の集合状態 | particle |
-
試料調製
| 緩衝液 | pH: 7.5 |
|---|---|
| 凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-
電子顕微鏡法
| 顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
|---|---|
| 撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 38.0 e/Å2 |
| 電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN |
| 電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 1.5 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.8 µm / 倍率(公称値): 81000 |
| 実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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キーワード
Homo sapiens (ヒト)
データ登録者
米国, 1件
引用









解析
FIELD EMISSION GUN
