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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||||||||
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タイトル | Structure of Muscarinic receptor (M2R) in complex with beta-arrestin1 (Local refine, cross-linked) | |||||||||||||||
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![]() | GPCR / Arrestin / SIGNALING PROTEIN / SIGNALING PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex | |||||||||||||||
機能・相同性 | ![]() MAP2K and MAPK activation / Activation of SMO / Golgi Associated Vesicle Biogenesis / Lysosome Vesicle Biogenesis / AP-2 adaptor complex binding / Muscarinic acetylcholine receptors / symmetric synapse / phospholipase C-activating G protein-coupled acetylcholine receptor signaling pathway / clathrin heavy chain binding / Ub-specific processing proteases ...MAP2K and MAPK activation / Activation of SMO / Golgi Associated Vesicle Biogenesis / Lysosome Vesicle Biogenesis / AP-2 adaptor complex binding / Muscarinic acetylcholine receptors / symmetric synapse / phospholipase C-activating G protein-coupled acetylcholine receptor signaling pathway / clathrin heavy chain binding / Ub-specific processing proteases / G protein-coupled acetylcholine receptor activity / clathrin coat of coated pit / regulation of smooth muscle contraction / desensitization of G protein-coupled receptor signaling pathway / cholinergic synapse / Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis / inositol hexakisphosphate binding / adenylate cyclase-inhibiting G protein-coupled acetylcholine receptor signaling pathway / Clathrin-mediated endocytosis / clathrin-dependent endocytosis / G protein-coupled serotonin receptor activity / arrestin family protein binding / G protein-coupled receptor internalization / acetylcholine receptor binding / Thrombin signalling through proteinase activated receptors (PARs) / G alpha (s) signalling events / regulation of heart contraction / clathrin binding / negative regulation of Notch signaling pathway / pseudopodium / phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding / positive regulation of receptor internalization / G protein-coupled receptor signaling pathway, coupled to cyclic nucleotide second messenger / asymmetric synapse / small molecule binding / axon terminus / presynaptic modulation of chemical synaptic transmission / visual perception / G protein-coupled receptor binding / clathrin-coated endocytic vesicle membrane / response to virus / adenylate cyclase-modulating G protein-coupled receptor signaling pathway / G protein-coupled acetylcholine receptor signaling pathway / receptor internalization / protein transport / Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis / Clathrin-mediated endocytosis / presynaptic membrane / nervous system development / G alpha (i) signalling events / cytoplasmic vesicle / ubiquitin-dependent protein catabolic process / chemical synaptic transmission / postsynaptic membrane / molecular adaptor activity / positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade / positive regulation of protein phosphorylation / G protein-coupled receptor signaling pathway / neuronal cell body / glutamatergic synapse / synapse / dendrite / signal transduction / membrane / nucleus / plasma membrane / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | |||||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.2 Å | |||||||||||||||
![]() | Maharana J / Sano FK / Shihoya W / Banerjee R / Nureki O / Shukla AK | |||||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Molecular insights into atypical modes of β-arrestin interaction with seven transmembrane receptors. 著者: Jagannath Maharana / Fumiya K Sano / Parishmita Sarma / Manish K Yadav / Longhan Duan / Tomasz M Stepniewski / Madhu Chaturvedi / Ashutosh Ranjan / Vinay Singh / Sayantan Saha / Gargi Mahajan ...著者: Jagannath Maharana / Fumiya K Sano / Parishmita Sarma / Manish K Yadav / Longhan Duan / Tomasz M Stepniewski / Madhu Chaturvedi / Ashutosh Ranjan / Vinay Singh / Sayantan Saha / Gargi Mahajan / Mohamed Chami / Wataru Shihoya / Jana Selent / Ka Young Chung / Ramanuj Banerjee / Osamu Nureki / Arun K Shukla / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 要旨: β-arrestins (βarrs) are multifunctional proteins involved in signaling and regulation of seven transmembrane receptors (7TMRs), and their interaction is driven primarily by agonist-induced receptor ...β-arrestins (βarrs) are multifunctional proteins involved in signaling and regulation of seven transmembrane receptors (7TMRs), and their interaction is driven primarily by agonist-induced receptor activation and phosphorylation. Here, we present seven cryo-electron microscopy structures of βarrs either in the basal state, activated by the muscarinic receptor subtype 2 (M2R) through its third intracellular loop, or activated by the βarr-biased decoy D6 receptor (D6R). Combined with biochemical, cellular, and biophysical experiments, these structural snapshots allow the visualization of atypical engagement of βarrs with 7TMRs and also reveal a structural transition in the carboxyl terminus of βarr2 from a β strand to an α helix upon activation by D6R. Our study provides previously unanticipated molecular insights into the structural and functional diversity encoded in 7TMR-βarr complexes with direct implications for exploring novel therapeutic avenues. | |||||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 56.1 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 21.7 KB 21.7 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 9.5 KB | 表示 | ![]() |
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Filedesc metadata | ![]() | 6.7 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 59.5 MB 59.5 MB | ||
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-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 679.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 678.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 16.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 21.5 KB | 表示 | |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8j97MC ![]() 8go9C ![]() 8j8rC ![]() 8j8vC ![]() 8j8zC ![]() 8j9kC ![]() 8ja3C ![]() 8jafC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.3487 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_36090_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_36090_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Muscarinic receptor (M2R) in complex with beta-arrestin1
全体 | 名称: Muscarinic receptor (M2R) in complex with beta-arrestin1 |
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要素 |
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-超分子 #1: Muscarinic receptor (M2R) in complex with beta-arrestin1
超分子 | 名称: Muscarinic receptor (M2R) in complex with beta-arrestin1 タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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-超分子 #2: beta-arrestin1
超分子 | 名称: beta-arrestin1 / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-超分子 #3: Fab30
超分子 | 名称: Fab30 / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #2-#3 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-超分子 #4: Muscarinic receptor M2R
超分子 | 名称: Muscarinic receptor M2R / タイプ: complex / ID: 4 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #4 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-分子 #1: Beta-arrestin-1
分子 | 名称: Beta-arrestin-1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 39.656668 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: GTRVFKKASP NGKLTVYLGK RDFVDHIDLV EPVDGVVLVD PEYLKERRVY VTLTCAFRYG REDLDVLGLT FRKDLFVANV QSFPPAPED KKPLTRLQER LIKKLGEHAY PFTFEIPPNL PCSVTLQPGP EDTGKACGVD YEVKAFCAEN LEEKIHKRNS V RLVIRKVQ ...文字列: GTRVFKKASP NGKLTVYLGK RDFVDHIDLV EPVDGVVLVD PEYLKERRVY VTLTCAFRYG REDLDVLGLT FRKDLFVANV QSFPPAPED KKPLTRLQER LIKKLGEHAY PFTFEIPPNL PCSVTLQPGP EDTGKACGVD YEVKAFCAEN LEEKIHKRNS V RLVIRKVQ YAPERPGPQP TAETTRQFLM SDKPLHLEAS LDKEIYYHGE PISVNVHVTN NTNKTVKKIK ISVRQYADIC LF NTAQYKC PVAMEEADDT VAPSSTFCKV YTLTPFLANN REKRGLALDG KLKHEDTNLA SSTLLREGAN REILGIIVSY KVK VKLVVS RGGLLGDLAS SDVAVELPFT LMHPKPK UniProtKB: Beta-arrestin-1 |
-分子 #2: Fab30 Heavy Chain
分子 | 名称: Fab30 Heavy Chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 12.861245 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: VQLVESGGGL VQPGGSLRLS CAASGFNVYS SSIHWVRQAP GKGLEWVASI SSYYGYTYYA DSVKGRFTIS ADTSKNTAYL QMNSLRAED TAVYYCARSR QFWYSGLDYW GQGTLVTV |
-分子 #3: Fab30 Light Chain
分子 | 名称: Fab30 Light Chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 11.50082 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: DIQMTQSPSS LSASVGDRVT ITCRASQSVS SAVAWYQQKP GKAPKLLIYS ASSLYSGVPS RFSGSRSGTD FTLTISSLQP EDFATYYCQ QYKYVPVTFG QGTKVEI |
-分子 #4: Muscarinic acetylcholine receptor M2
分子 | 名称: Muscarinic acetylcholine receptor M2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 1.226853 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: EN(TPO)V(SEP)(TPO)(SEP)LG UniProtKB: Muscarinic acetylcholine receptor M2 |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 検出モード: COUNTING / 実像数: 17869 / 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス(公称値): 1.6 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.8 µm |
試料ステージ | 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER ホルダー冷却材: NITROGEN |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |