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-基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-35136 | |||||||||
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タイトル | Follicle stimulating hormone receptor | |||||||||
マップデータ | ||||||||||
試料 |
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キーワード | FSH / FSHR / GPCR / HORMONE | |||||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 follicle-stimulating hormone receptor activity / Hormone ligand-binding receptors / follicle-stimulating hormone signaling pathway / female gamete generation / gonad development / cellular response to follicle-stimulating hormone stimulus / regulation of protein kinase A signaling / G protein-coupled peptide receptor activity / female gonad development / hormone-mediated signaling pathway ...follicle-stimulating hormone receptor activity / Hormone ligand-binding receptors / follicle-stimulating hormone signaling pathway / female gamete generation / gonad development / cellular response to follicle-stimulating hormone stimulus / regulation of protein kinase A signaling / G protein-coupled peptide receptor activity / female gonad development / hormone-mediated signaling pathway / adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway / male gonad development / G alpha (s) signalling events / spermatogenesis / positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction / positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade / receptor complex / G protein-coupled receptor signaling pathway / membrane / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 6.0 Å | |||||||||
データ登録者 | Duan J / Xu P / Yang J / Ji Y / Zhang H / Mao C / Luan X / Jiang Y / Zhang Y / Zhang S / Xu HE | |||||||||
資金援助 | 中国, 1件
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引用 | ジャーナル: Nat Commun / 年: 2023 タイトル: Mechanism of hormone and allosteric agonist mediated activation of follicle stimulating hormone receptor. 著者: Jia Duan / Peiyu Xu / Huibing Zhang / Xiaodong Luan / Jiaqi Yang / Xinheng He / Chunyou Mao / Dan-Dan Shen / Yujie Ji / Xi Cheng / Hualiang Jiang / Yi Jiang / Shuyang Zhang / Yan Zhang / H Eric Xu / 要旨: Follicle stimulating hormone (FSH) is an essential glycoprotein hormone for human reproduction, which functions are mediated by a G protein-coupled receptor, FSHR. Aberrant FSH-FSHR signaling causes ...Follicle stimulating hormone (FSH) is an essential glycoprotein hormone for human reproduction, which functions are mediated by a G protein-coupled receptor, FSHR. Aberrant FSH-FSHR signaling causes infertility and ovarian hyperstimulation syndrome. Here we report cryo-EM structures of FSHR in both inactive and active states, with the active structure bound to FSH and an allosteric agonist compound 21 f. The structures of FSHR are similar to other glycoprotein hormone receptors, highlighting a conserved activation mechanism of hormone-induced receptor activation. Compound 21 f formed extensive interactions with the TMD to directly activate FSHR. Importantly, the unique residue H615 in FSHR plays an essential role in determining FSHR selectivity for various allosteric agonists. Together, our structures provide a molecular basis of FSH and small allosteric agonist-mediated FSHR activation, which could inspire the design of FSHR-targeted drugs for the treatment of infertility and controlled ovarian stimulation for in vitro fertilization. | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
添付画像 |
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-ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | emd_35136.map.gz | 28.4 MB | EMDBマップデータ形式 | |
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ヘッダ (付随情報) | emd-35136-v30.xml emd-35136.xml | 14.4 KB 14.4 KB | 表示 表示 | EMDBヘッダ |
画像 | emd_35136.png | 37.3 KB | ||
Filedesc metadata | emd-35136.cif.gz | 5.6 KB | ||
その他 | emd_35136_half_map_1.map.gz emd_35136_half_map_2.map.gz | 27.6 MB 23.8 MB | ||
アーカイブディレクトリ | http://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-35136 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-35136 | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | emd_35136_validation.pdf.gz | 672.8 KB | 表示 | EMDB検証レポート |
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文書・詳細版 | emd_35136_full_validation.pdf.gz | 672.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | emd_35136_validation.xml.gz | 10.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | emd_35136_validation.cif.gz | 12.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://ftp.pdbj.org/pub/emdb/validation_reports/EMD-35136 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/validation_reports/EMD-35136 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | 8i2hMC 8i2gC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索 |
-リンク
EMDBのページ | EMDB (EBI/PDBe) / EMDataResource |
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「今月の分子」の関連する項目 |
-マップ
ファイル | ダウンロード / ファイル: emd_35136.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 30.5 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.045 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_35136_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_35136_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-試料の構成要素
-全体 : Follicle stimulating hormone receptor
全体 | 名称: Follicle stimulating hormone receptor |
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要素 |
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-超分子 #1: Follicle stimulating hormone receptor
超分子 | 名称: Follicle stimulating hormone receptor / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
-分子 #1: Follicle-stimulating hormone receptor
分子 | 名称: Follicle-stimulating hormone receptor / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
分子量 | 理論値: 76.97193 KDa |
組換発現 | 生物種: Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ) |
配列 | 文字列: LGSGCHHRIC HCSNRVFLCQ ESKVTEIPSD LPRNAIELRF VLTKLRVIQK GAFSGFGDLE KIEISQNDVL EVIEADVFSN LPKLHEIRI EKANNLLYIN PEAFQNLPNL QYLLISNTGI KHLPDVHKIH SLQKVLLDIQ DNINIHTIER NSFVGLSFES V ILWLNKNG ...文字列: LGSGCHHRIC HCSNRVFLCQ ESKVTEIPSD LPRNAIELRF VLTKLRVIQK GAFSGFGDLE KIEISQNDVL EVIEADVFSN LPKLHEIRI EKANNLLYIN PEAFQNLPNL QYLLISNTGI KHLPDVHKIH SLQKVLLDIQ DNINIHTIER NSFVGLSFES V ILWLNKNG IQEIHNCAFN GTQLDELNLS DNNNLEELPN DVFHGASGPV ILDISRTRIH SLPSYGLENL KKLRARSTYN LK KLPTLEK LVALMEASLT YPSHCCAFAN WRRQISELHP ICNKSILRQE VDYMTQARGQ RSSLAEDNES SYSRGFDMTY TEF DYDLCN EVVDVTCSPK PDAFNPCEDI MGYNILRVLI WFISILAITG NIIVLVILTT SQYKLTVPRF LMCNLAFADL CIGI YLLLI ASVDIHTKSQ YHNYAIDWQT GAGCDAAGFF TVFASELSVY TLTAITLERW HTITHAMQLD CKVQLRHAAS VMVMG WIFA FAAALFPIFG ISSYMKVSIC LPMDIDSPLS QLYVMSLLVL NVLAFVVICG CYIHIYLTVR NPNIVSSSSD TRIAKR MAM LIFTDFLCMA PISFFAISAS LKVPLITVSK AKILLVLFHP INSCANPFLY AIFTKNFRRD FFILLSKCGC YEMQAQI YR TETSSTVHNT HPRNGHCSSA PRVTNGSTYI LVPLSHLAQN UniProtKB: Follicle-stimulating hormone receptor |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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解析 | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-試料調製
緩衝液 | pH: 7.5 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE-PROPANE |
-電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k) 平均電子線量: 70.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN |
電子光学系 | 照射モード: OTHER / 撮影モード: OTHER / 最大 デフォーカス(公称値): 2.2 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.2 µm |
実験機器 | モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
-画像解析
初期モデル | モデルのタイプ: NONE |
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最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 6.0 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 356211 |
初期 角度割当 | タイプ: RANDOM ASSIGNMENT |
最終 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |