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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Cryo-EM structure of MPXV M2 hexamer in complex with human B7.2 | |||||||||
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![]() | M2 / complex / immune evasion / VIRAL PROTEIN | |||||||||
機能・相同性 | ![]() positive regulation of lymphotoxin A production / CD40 signaling pathway / positive regulation of T-helper 2 cell differentiation / activation of protein kinase C activity / CD28 co-stimulation / : / CD28 dependent Vav1 pathway / positive regulation of immunoglobulin production / CTLA4 inhibitory signaling / B cell activation ...positive regulation of lymphotoxin A production / CD40 signaling pathway / positive regulation of T-helper 2 cell differentiation / activation of protein kinase C activity / CD28 co-stimulation / : / CD28 dependent Vav1 pathway / positive regulation of immunoglobulin production / CTLA4 inhibitory signaling / B cell activation / positive regulation of interleukin-4 production / Interleukin-10 signaling / CD28 dependent PI3K/Akt signaling / centriolar satellite / coreceptor activity / positive regulation of T cell proliferation / T cell costimulation / T cell activation / positive regulation of interleukin-2 production / positive regulation of non-canonical NF-kappaB signal transduction / Constitutive Signaling by Aberrant PI3K in Cancer / PIP3 activates AKT signaling / virus receptor activity / signaling receptor activity / PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling / cellular response to lipopolysaccharide / adaptive immune response / cell surface receptor signaling pathway / receptor ligand activity / immune response / external side of plasma membrane / positive regulation of cell population proliferation / positive regulation of DNA-templated transcription / cell surface / extracellular exosome / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.7 Å | |||||||||
![]() | Wang Y / Yang S / Zhao H / Deng Z | |||||||||
資金援助 | 1件
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![]() | ![]() タイトル: Structural and functional insights into the modulation of T cell costimulation by monkeypox virus protein M2. 著者: Shangyu Yang / Yong Wang / Feiyang Yu / Rao Cheng / Yiwei Zhang / Dan Zhou / Xuanxiu Ren / Zengqin Deng / Haiyan Zhao / ![]() 要旨: The rapid spread of monkeypox in multiple countries has resulted in a global public health threat and has caused international concerns since May 2022. Poxvirus encoded M2 protein is a member of the ...The rapid spread of monkeypox in multiple countries has resulted in a global public health threat and has caused international concerns since May 2022. Poxvirus encoded M2 protein is a member of the poxvirus immune evasion family and plays roles in host immunomodulation via the regulation of innate immune response mediated by the NF-κB pathway and adaptive immune response mediated by B7 ligands. However, the interaction of monkeypox virus (MPXV) M2 with B7 ligands and structural insight into poxviral M2 function have remained elusive. Here we reveal that MPXV M2, co-existing as a hexamer and a heptamer, recognizes human B7.1 and B7.2 (hB7.1/2) with high avidities. The binding of oligomeric MPXV M2 interrupts the interactions of hB7.1/2 with CD28 and CTLA4 and subverts T cell activation mediated by B7.1/2 costimulatory signals. Cryo-EM structures of M2 in complex with hB7.1/2 show that M2 binds to the shallow concave face of hB7.1/2 and displays sterically competition with CD28 and CTLA4 for the binding to hB7.1/2. Our findings provide structural mechanisms of poxviral M2 function and immune evasion deployed by poxviruses. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 117.9 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 14.1 KB 14.1 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 56 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 5.3 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 115.9 MB 115.9 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 818.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 818.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 13.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 16.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.95 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_35075_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_35075_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : M2-hB7.2
全体 | 名称: M2-hB7.2 |
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要素 |
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-超分子 #1: M2-hB7.2
超分子 | 名称: M2-hB7.2 / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-分子 #1: NFkB inhibitor
分子 | 名称: NFkB inhibitor / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 6 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 23.285348 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: VEYKNTICPP RQDYRYWYFV AELTIGVNYD INSTIIGECH MSESYIDRNA NIVLTGYGLK INMTIMDTDQ RFVAAAEGVG KDNKLSVLL FTTQRLDKVH HNISVTITCM EMNCGTTKYN SDLPESIHKS SSCDITINGS CVTCVNLETD PTKINPHYLH P KNKYLYHN ...文字列: VEYKNTICPP RQDYRYWYFV AELTIGVNYD INSTIIGECH MSESYIDRNA NIVLTGYGLK INMTIMDTDQ RFVAAAEGVG KDNKLSVLL FTTQRLDKVH HNISVTITCM EMNCGTTKYN SDLPESIHKS SSCDITINGS CVTCVNLETD PTKINPHYLH P KNKYLYHN SEYSMRGSYG VTFIDELNQC LLDIKELSYD ICYRE UniProtKB: Early protein OPG038 |
-分子 #2: T-lymphocyte activation antigen CD86
分子 | 名称: T-lymphocyte activation antigen CD86 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 6 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 24.420646 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: LKIQAYFNET ADLPCQFANS QNQSLSELVV FWQDQENLVL NEVYLGKEKF DSVHSKYMGR TSFDSDSWTL RLHNLQIKDK GLYQCIIHH KKPTGMIRIH QMNSELSVLA NFSQPEIVPI SNITENVYIN LTCSSIHGYP EPKKMSVLLR TKNSTIEYDG V MQKSQDNV ...文字列: LKIQAYFNET ADLPCQFANS QNQSLSELVV FWQDQENLVL NEVYLGKEKF DSVHSKYMGR TSFDSDSWTL RLHNLQIKDK GLYQCIIHH KKPTGMIRIH QMNSELSVLA NFSQPEIVPI SNITENVYIN LTCSSIHGYP EPKKMSVLLR TKNSTIEYDG V MQKSQDNV TELYDVSISL SVSFPDVTSN MTIFCILETD KTRLLSSPFS IELED UniProtKB: T-lymphocyte activation antigen CD86 |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 8 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | JEOL CRYO ARM 300 |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 40.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.5 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.5 µm |
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画像解析
初期モデル | モデルのタイプ: NONE |
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最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.7 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 198500 |
初期 角度割当 | タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION |
最終 角度割当 | タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION |