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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Structure of Xenopus tropicalis acid-sensitive outwardly rectifying channel ASOR (resting state) | |||||||||
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![]() | Chloride Channel / MEMBRANE PROTEIN | |||||||||
機能・相同性 | pH-gated chloride channel activity / TMEM206 protein / TMEM206 protein family / chloride transport / chloride channel complex / cell surface / plasma membrane / Proton-activated chloride channel![]() | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.48 Å | |||||||||
![]() | Chi P / Wang X / Li J / Li K / Zhang Y / Geng J / Wu J / Deng D | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure of Xenopus tropicalis acid-sensitive outwardly rectifying channel ASOR (resting state) 著者: Chi P / Wang X / Li J / Li K / Zhang Y / Geng J / Wu J / Deng D | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 118 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 13.2 KB 13.2 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 84.2 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 5.3 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 115.9 MB 115.9 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 911.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 910.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 13.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 16.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8h8fMC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.087 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_34545_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_34545_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Complex of Xenopus tropical acid-sensitive outwardly rectifying c...
全体 | 名称: Complex of Xenopus tropical acid-sensitive outwardly rectifying channel ASOR trimer and tRNA in GDN |
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要素 |
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-超分子 #1: Complex of Xenopus tropical acid-sensitive outwardly rectifying c...
超分子 | 名称: Complex of Xenopus tropical acid-sensitive outwardly rectifying channel ASOR trimer and tRNA in GDN タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-分子 #1: Proton-activated chloride channel
分子 | 名称: Proton-activated chloride channel / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 41.031789 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MEAIRKELSR SYQELNEEAE PVAIDPEEAE DEEKEQEEAA SAVAPDRDSD RSSPPVRFSR TCLKNFFSVL LILVYLLLMG VAVFLVYQT ITDFRDKLKH PVMSVSYKEV NMYDAPGIAL YPGKARLLSC EHHWYDHIPP LKDPGQPGEN TCVTQDISYI D PYTNKTMK ...文字列: MEAIRKELSR SYQELNEEAE PVAIDPEEAE DEEKEQEEAA SAVAPDRDSD RSSPPVRFSR TCLKNFFSVL LILVYLLLMG VAVFLVYQT ITDFRDKLKH PVMSVSYKEV NMYDAPGIAL YPGKARLLSC EHHWYDHIPP LKDPGQPGEN TCVTQDISYI D PYTNKTMK HALIVQGPRD VRRRELVFLQ FHLNETKQDF SAIDYLLFSS YEAFLKSHDQ VKFMQDCESS FSSWKFSGGF RT WVKMSLV KTKEEDGSQS VEFRQETSVV NFIDRRETPD KGDQLFFVVF EWKDPYIQEI QDIITANPWS MIALLCSVFL VLF KAADFA KLSVKWMIKV RRRHLKKRAR ELNHIS UniProtKB: Proton-activated chloride channel |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 8 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.5 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
初期モデル | モデルのタイプ: NONE |
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最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.48 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 172281 |
初期 角度割当 | タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION |
最終 角度割当 | タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION |