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- EMDB-27934: Vigna radiata supercomplex I+III2 (full bridge) -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-27934
タイトルVigna radiata supercomplex I+III2 (full bridge)
マップデータVigna radiata supercomplex I III2 (SC I III2) composite map of full supercomplex (bridged class 1).
試料
  • 複合体: Vigna radiata supercomplex I+III2 (full bridge)
    • タンパク質・ペプチド: x 59種
  • リガンド: x 13種
キーワードrespiratory supercomplex / nadh-cyt c oxidoreductase / membrane complex / ELECTRON TRANSPORT
機能・相同性
機能・相同性情報


TIM22 mitochondrial import inner membrane insertion complex / mitochondrial processing peptidase / P450-containing electron transport chain / photorespiration / protein insertion into mitochondrial inner membrane / NADH dehydrogenase complex / respiratory chain complex III / quinol-cytochrome-c reductase / quinol-cytochrome-c reductase activity / mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c ...TIM22 mitochondrial import inner membrane insertion complex / mitochondrial processing peptidase / P450-containing electron transport chain / photorespiration / protein insertion into mitochondrial inner membrane / NADH dehydrogenase complex / respiratory chain complex III / quinol-cytochrome-c reductase / quinol-cytochrome-c reductase activity / mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c / NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating) / electron transport coupled proton transport / mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone / acyl binding / mitochondrial respiratory chain complex I assembly / oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H / NADH dehydrogenase activity / respiratory chain complex I / NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity / acyl carrier activity / quinone binding / ATP synthesis coupled electron transport / RNA splicing / aerobic respiration / chloroplast / respiratory electron transport chain / spliceosomal complex / electron transport chain / metalloendopeptidase activity / mitochondrial intermembrane space / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / mitochondrial membrane / mRNA processing / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / response to oxidative stress / electron transfer activity / mitochondrial inner membrane / nuclear speck / mitochondrial matrix / mRNA binding / heme binding / protein-containing complex binding / mitochondrion / proteolysis / membrane / metal ion binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM22 / NADH-ubiquinone oxidoreductase 11kDa subunit / Putative NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase 11 kDa subunit / At2g27730-like / Cytochrome b-c1 complex subunit 8, plants / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, plant/fungi / : / : ...Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM22 / NADH-ubiquinone oxidoreductase 11kDa subunit / Putative NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase 11 kDa subunit / At2g27730-like / Cytochrome b-c1 complex subunit 8, plants / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, plant/fungi / : / : / : / Hexapeptide repeat of succinyl-transferase / NADH-ubiquinone oxidoreductase, 21kDa subunit, N-terminal / NADH-ubiquinone oxidoreductase complex I, 21 kDa subunit / Adrenodoxin / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 3, bacterial/plastid / : / Cytochrome b-c1 complex, subunit 6 / Cytochrome b-c1 complex subunit 7 / Cytochrome b-c1 complex subunit 7 superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase complex 14kD subunit / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 superfamily / Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, transmembrane domain / Ubiquinol cytochrome reductase transmembrane region / Cytochrome b-c1 complex subunit 9 / Cytochrome b-c1 complex subunit 9 superfamily / Cytochrome b-c1 complex subunit 9 / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge protein / Cytochrome c1, transmembrane anchor, C-terminal / : / Hexapeptide repeat / Ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulphur subunit / Cytochrome c1 / Cytochrome C1 family / Peptidase M16, zinc-binding site / Insulinase family, zinc-binding region signature. / Tim17/Tim22/Tim23/Pmp24 family / Rieske iron-sulphur protein, C-terminal / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 / Rieske iron-sulphur protein / Peptidase M16, C-terminal / Peptidase M16 inactive domain / Peptidase M16, N-terminal / Insulinase (Peptidase family M16) / NADH-ubiquinone oxidoreductase MWFE subunit / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex subunit 1 / : / Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like / NADH-ubiquinone oxidoreductase NDSU1/NuoG-like, 4Fe-4S domain / Zinc finger, CHCC-type / Zinc-finger domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B12 subunit family / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7, NDUB7 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B18 subunit (NDUFB7) / GRIM-19 / GRIM-19 protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NDUFB9, LYR domain / NDUFA6, LYR domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 / ETC complex I subunit conserved region / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 6 / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4-like superfamily / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4 / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH ubiquinone oxidoreductase subunit NDUFA12 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 8 / NADH-quinone oxidoreductase, chain G, C-terminal / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit G, C-terminal / Trimeric LpxA-like superfamily / : / NADH-quinone oxidoreductase subunit 3, ferredoxin-like domain / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 20 Kd subunit signature. / NADH-ubiquinone oxidoreductase, 20 Kd subunit / NADH-quinone oxidoreductase, chain I / Rieske [2Fe-2S] domain / Rieske [2Fe-2S] iron-sulphur domain / Rieske [2Fe-2S] iron-sulfur domain profile. / Rieske [2Fe-2S] iron-sulphur domain superfamily / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 3. / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 2. / Complex 1 LYR protein domain / Complex 1 protein (LYR family) / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 1. / : / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 75kDa subunit, conserved site / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 3 superfamily / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase-G iron-sulfur binding region / NADH-ubiquinone oxidoreductase-G iron-sulfur binding region / NAD-dependent epimerase/dehydratase / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 24 Kd subunit signature. / 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain
類似検索 - ドメイン・相同性
Acyl carrier protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein / Uncharacterized protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein / Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial / Uncharacterized protein LOC106754061 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2 / Outer envelope pore protein 16-3, chloroplastic/mitochondrial / Serine/arginine-rich-splicing factor SR34 isoform X2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 1, mitochondrial ...Acyl carrier protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein / Uncharacterized protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein / Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial / Uncharacterized protein LOC106754061 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2 / Outer envelope pore protein 16-3, chloroplastic/mitochondrial / Serine/arginine-rich-splicing factor SR34 isoform X2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 1, mitochondrial / Complex III subunit 9 / Uncharacterized protein LOC106758628 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 / mitochondrial processing peptidase / Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / Uncharacterized protein LOC106761134 / Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial-like / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial / Cytochrome b-c1 complex subunit 7 / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 / Complex III subunit II / Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / Uncharacterized protein LOC106766640 / Uncharacterized protein LOC106767179 / Uncharacterized protein LOC106768957 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3-B / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7 / Uncharacterized protein LOC106771273 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial isoform X1 / Complex III subunit II / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10-B / Cytochrome b-c1 complex subunit 6 / Uncharacterized protein LOC106775330 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8-B / Uncharacterized protein LOC106779486 / Acyl carrier protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / Cytochrome c1-2, heme protein, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
類似検索 - 構成要素
生物種Vigna radiata (リョクトウ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.2 Å
データ登録者Maldonado M / Letts JA
資金援助 米国, 1件
OrganizationGrant number国
Department of Energy (DOE, United States)DE-SC0022293 米国
引用ジャーナル: Nat Plants / 年: 2023
タイトル: Plant-specific features of respiratory supercomplex I + III from Vigna radiata.
著者: M Maldonado / Z Fan / K M Abe / J A Letts /
要旨: The last steps of cellular respiration-an essential metabolic process in plants-are carried out by mitochondrial oxidative phosphorylation. This process involves a chain of multi-subunit membrane ...The last steps of cellular respiration-an essential metabolic process in plants-are carried out by mitochondrial oxidative phosphorylation. This process involves a chain of multi-subunit membrane protein complexes (complexes I-V) that form higher-order assemblies called supercomplexes. Although supercomplexes are the most physiologically relevant form of the oxidative phosphorylation complexes, their functions and structures remain mostly unknown. Here we present the cryogenic electron microscopy structure of the supercomplex I + III from Vigna radiata (mung bean). The structure contains the full subunit complement of complex I, including a newly assigned, plant-specific subunit. It also shows differences in the mitochondrial processing peptidase domain of complex III relative to a previously determined supercomplex with complex IV. The supercomplex interface, while reminiscent of that in other organisms, is plant specific, with a major interface involving complex III's mitochondrial processing peptidase domain and no participation of complex I's bridge domain. The complex I structure suggests that the bridge domain sets the angle between the enzyme's two arms, limiting large-scale conformational changes. Moreover, complex I's catalytic loops and its response in active-to-deactive assays suggest that, in V. radiata, the resting complex adopts a non-canonical state and can sample deactive- or open-like conformations even in the presence of substrate. This study widens our understanding of the possible conformations and behaviour of complex I and supercomplex I + III. Further studies of complex I and its supercomplexes in diverse organisms are needed to determine the universal and clade-specific mechanisms of respiration.
履歴
登録2022年8月23日-
ヘッダ(付随情報) 公開2023年1月11日-
マップ公開2023年1月11日-
更新2024年12月25日-
現状2024年12月25日処理サイト: RCSB / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_27934.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_27934.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 87.2 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Vigna radiata supercomplex I III2 (SC I III2) composite map of full supercomplex (bridged class 1).
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸X (Sec.)Y (Row.)Z (Col.)
0.88 Å/pix.
x 226 pix.
= 198.88 Å		0.88 Å/pix.
x 269 pix.
= 236.72 Å		0.88 Å/pix.
x 376 pix.
= 330.88 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

これらの図は立方格子座標系で作成されたものです

ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.88 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 6.5
最小 - 最大-25.093775000000001 - 59.066498000000003
平均 (標準偏差)0.28915003 (±2.8661964)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderZYX
Origin180133179
サイズ269376226
Spacing226269376
セルA: 198.88 Å / B: 236.72 Å / C: 330.88 Å
α=β=γ: 90.0 °

-
添付データ

-
マスク #1

ファイルemd_27934_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
追加マップ: Vigna radiata supercomplex I III2 bridged class 1

ファイルemd_27934_additional_1.map
注釈Vigna radiata supercomplex I III2 bridged class 1
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: Vigna radiata supercomplex I III2 bridged class 1 half map B

ファイルemd_27934_half_map_1.map
注釈Vigna radiata supercomplex I III2 bridged class 1_half map B
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: Vigna radiata supercomplex I III2 bridged class 1 half map A

ファイルemd_27934_half_map_2.map
注釈Vigna radiata supercomplex I III2 bridged class 1_half map A
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
試料の構成要素

+
全体 : Vigna radiata supercomplex I+III2 (full bridge)

全体名称: Vigna radiata supercomplex I+III2 (full bridge)
要素
  • 複合体: Vigna radiata supercomplex I+III2 (full bridge)
    • タンパク質・ペプチド: MPP-beta
    • タンパク質・ペプチド: MPP-alpha (protomer 1)
    • タンパク質・ペプチド: COB (cyt b)
    • タンパク質・ペプチド: CYC1 (cyt c1)
    • タンパク質・ペプチド: UCR1 (Rieske iron-sulfur protein subunit)
    • タンパク質・ペプチド: QCR7
    • タンパク質・ペプチド: QCR8
    • タンパク質・ペプチド: QCR6
    • タンパク質・ペプチド: QCR9
    • タンパク質・ペプチド: QCR10 (UCRY)
    • タンパク質・ペプチド: MPP-alpha (protomer 2)
    • タンパク質・ペプチド: Nad1
    • タンパク質・ペプチド: Nad2
    • タンパク質・ペプチド: Nad3
    • タンパク質・ペプチド: Nad4
    • タンパク質・ペプチド: Nad4L
    • タンパク質・ペプチド: Nad5
    • タンパク質・ペプチド: Nad6
    • タンパク質・ペプチド: NDUA1
    • タンパク質・ペプチド: NDUA2
    • タンパク質・ペプチド: NDUA3
    • タンパク質・ペプチド: NDUA5
    • タンパク質・ペプチド: NDUA6
    • タンパク質・ペプチド: NDUA7
    • タンパク質・ペプチド: NDUA8
    • タンパク質・ペプチド: NDUA9
    • タンパク質・ペプチド: NDUA11
    • タンパク質・ペプチド: NDUA12
    • タンパク質・ペプチド: NDUA13
    • タンパク質・ペプチド: NDUAB1-beta
    • タンパク質・ペプチド: NDUAB1-alpha
    • タンパク質・ペプチド: NDUB2
    • タンパク質・ペプチド: NDUB3
    • タンパク質・ペプチド: NDUB4
    • タンパク質・ペプチド: NDUB7
    • タンパク質・ペプチド: NDUB8
    • タンパク質・ペプチド: NDUB9
    • タンパク質・ペプチド: NDUB10
    • タンパク質・ペプチド: NDUB11
    • タンパク質・ペプチド: NDUFX
    • タンパク質・ペプチド: NDUC2
    • タンパク質・ペプチド: NDUP2
    • タンパク質・ペプチド: NDUCA1
    • タンパク質・ペプチド: NDUCA2
    • タンパク質・ペプチド: NDUCAL2
    • タンパク質・ペプチド: NDUS1
    • タンパク質・ペプチド: NDUS2
    • タンパク質・ペプチド: NDUS3
    • タンパク質・ペプチド: NDUS4
    • タンパク質・ペプチド: NDUS5
    • タンパク質・ペプチド: NDUS6
    • タンパク質・ペプチド: NDUS7
    • タンパク質・ペプチド: NDUS8
    • タンパク質・ペプチド: NDUP1
    • タンパク質・ペプチド: NDUP4
    • タンパク質・ペプチド: NDUB6
    • タンパク質・ペプチド: NDUV1
    • タンパク質・ペプチド: NDUV2
    • タンパク質・ペプチド: NDUX1
  • リガンド: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE
  • リガンド: CARDIOLIPIN
  • リガンド: PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
  • リガンド: 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine
  • リガンド: HEME C
  • リガンド: UBIQUINONE-10
  • リガンド: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
  • リガンド: S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate
  • リガンド: FE (III) ION
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: IRON/SULFUR CLUSTER
  • リガンド: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
  • リガンド: FLAVIN MONONUCLEOTIDE

+
超分子 #1: Vigna radiata supercomplex I+III2 (full bridge)

超分子名称: Vigna radiata supercomplex I+III2 (full bridge) / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#59
詳細: Higher-order assembly between respiratory complex I and complex III2
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)

+
分子 #1: MPP-beta

分子名称: MPP-beta / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 58.711238 KDa
配列文字列: MSLNRLLSAA RRSDRRASAL SSFRSLSASP ALAPSAASPP APPPPTAMIY DRAAEAIKSK LRQLENPDPR FLKHGNPRPA LSDHTRILA APETRVTTLP NGLRVATESS LAARTATVGV WIDAGSRFET EETNGTAHFL EHMIFKGTER RNARELEEEI E NMGGHLNA ...文字列:
MSLNRLLSAA RRSDRRASAL SSFRSLSASP ALAPSAASPP APPPPTAMIY DRAAEAIKSK LRQLENPDPR FLKHGNPRPA LSDHTRILA APETRVTTLP NGLRVATESS LAARTATVGV WIDAGSRFET EETNGTAHFL EHMIFKGTER RNARELEEEI E NMGGHLNA YTSREQTTYY AKVTDSDVPQ ALDILADILQ NSRFEENRIS RERDVILREM EEVEGQTEEV IFDHLHATAF QY TPLGRTI LGPAQNIKTI TKAHLQSYIQ THYTAPRMVI AASGAVKHED IVEQVKKLFT KLSTDATTTA QLVAKEPAIF TGS EVRMLD DDIPLAQFAV AFEGASWKDP DSIALMVMQA MLGSWNKTAG GGKHMGSELA QRVGINEVAE SIMAFNTNYK DTGL FGVYA VAKPDCLDDL SYAIMQETTK LVYRVSEDDV TRACNQLKSS LLLHIDGTSP VAEDIGRQLL TYGRRIPFAE LFARI DAVD ASTIKRVANR FIYDKDVAIA AMGPIQRLPD YNWFRRRTYW NRY

UniProtKB: mitochondrial processing peptidase

+
分子 #2: MPP-alpha (protomer 1)

分子名称: MPP-alpha (protomer 1) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 55.244543 KDa
配列文字列: MYRNVASRLR TIRARSCSRL PVRFASSSSS SVATKQSSSG LGGLFGWLTG DRSSSATPLD FPLPGVILSP PLPDYVAPGK TIITTLPNG VKVASETSAT PTASIGLYVD CGSIYESPIS FGATHLLERM AFKTTRNRSH FRVVREVEAI GGNVQASASR E QMGYTFDA ...文字列:
MYRNVASRLR TIRARSCSRL PVRFASSSSS SVATKQSSSG LGGLFGWLTG DRSSSATPLD FPLPGVILSP PLPDYVAPGK TIITTLPNG VKVASETSAT PTASIGLYVD CGSIYESPIS FGATHLLERM AFKTTRNRSH FRVVREVEAI GGNVQASASR E QMGYTFDA LKTYVPEMVE LLVDCVRNPA FLDWEVNEQL LKVKAEIGEA SKNPQDLLLE AIHSAGFSGA LANPLLASES AI NRLNGAI LEEFVAENYT APRIVLAASG VEHEELLSVA EPLLSDLPSV PRPEEPKSVY TGGDYRCQSE TGRTHFALAF ELP GGWHKL KDAMVLTVLQ MLLGGGGSFS AGGPGKGMYS RLYLNVLNQY PQFHSISAFN NIYNDTGIFG IQVTTSSDFI SKAI DITAN EILAVATHGK VEQLQLDRAK QATKSAILMN LESRMVVSED IGRQILTYGE RKPVEEFLKA VDEVTLKDIS SISQK LISS PLTMASYGDV LYVPSYESVS SKFPTK

UniProtKB: Complex III subunit II

+
分子 #3: COB (cyt b)

分子名称: COB (cyt b) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 44.454645 KDa
配列文字列: MTIRNQRFSL LKEPISSTLN QHLIDYPTPS NLSYWWGFGS LAGICLVIQI VTGVFLAMHY TPHVDLAFNS VEHVMRDVEG GWLLRYMHA NGASMFFIVV YLHIFRGLYY ASYSSPREFV WCLGVVIFLL MIVTAFTGYV LPWGQMSFWG ATVITSLASA I PVVGDTIV ...文字列:
MTIRNQRFSL LKEPISSTLN QHLIDYPTPS NLSYWWGFGS LAGICLVIQI VTGVFLAMHY TPHVDLAFNS VEHVMRDVEG GWLLRYMHA NGASMFFIVV YLHIFRGLYY ASYSSPREFV WCLGVVIFLL MIVTAFTGYV LPWGQMSFWG ATVITSLASA I PVVGDTIV TWLWGGFSVD NATLNRFFSL HYLLPFLLVG ASLLHLAALH QYGSNNPLGV HSEMDQISFY PYFYVKDLVG WV AFAIFFS IWIFYAPNVL GHPDNYIPAN PMSTPPHIVP EWYFLPIYAI LRSIPDKSGG VAAIALVFIC LLALPFFKSM YVR SSSFRP IYQGIFWLLL ADCLLLGWIG CQPVEAPFVT IGQISSFVFF LFFAITPILG RVGRGIPNSY TTDETEMT

+
分子 #4: CYC1 (cyt c1)

分子名称: CYC1 (cyt c1) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 33.556188 KDa
配列文字列: MTGGVFQLLR RKLHPQFTNS SLLSPIIAKK DGAGSTGSRS LKVLALIGAG VSGFFSFSTV AVADEAEHGL ACPSYPWPHK GILSSYDHA SIRRGHQVYT EVCASCHSMS LISYRDLVGV AYTEEEVKAM AAEIEVVDGP NDEGEMFTRP GKLSDRFPQP Y ANEAAARF ...文字列:
MTGGVFQLLR RKLHPQFTNS SLLSPIIAKK DGAGSTGSRS LKVLALIGAG VSGFFSFSTV AVADEAEHGL ACPSYPWPHK GILSSYDHA SIRRGHQVYT EVCASCHSMS LISYRDLVGV AYTEEEVKAM AAEIEVVDGP NDEGEMFTRP GKLSDRFPQP Y ANEAAARF ANGGAYPPDL SLITKARHNG QNYVFSLLTG YRDPPAGVSI REGLHYNPYF PGGAIAMPKM LNDGAVEYED GT PATEAQM GKDVVSFLSW AAEPEMEERK LMGFKWIFVL SLALLQAAYY RRLRWSVLKS RKLVLDVVN

UniProtKB: Cytochrome c1-2, heme protein, mitochondrial

+
分子 #5: UCR1 (Rieske iron-sulfur protein subunit)

分子名称: UCR1 (Rieske iron-sulfur protein subunit) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: quinol-cytochrome-c reductase
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 30.051432 KDa
配列文字列: MLRVAAKRLS SLSSSAWRAN HAASAVLSRN PVAPSLSTEE HRSDPFSLRP EFFLPIRGYA TDSLFHPKEN SLIPEIPATV AAVKNPSSK IIYDEHNHER FPPGDPSKRA FAYFVLTGGR FVYASLIRLL VLKFVLSMSA SKDVLALASL EVDLSSIEPG T TVTVKWRG ...文字列:
MLRVAAKRLS SLSSSAWRAN HAASAVLSRN PVAPSLSTEE HRSDPFSLRP EFFLPIRGYA TDSLFHPKEN SLIPEIPATV AAVKNPSSK IIYDEHNHER FPPGDPSKRA FAYFVLTGGR FVYASLIRLL VLKFVLSMSA SKDVLALASL EVDLSSIEPG T TVTVKWRG KPVFIRRRTE DDIKLANSVD VASLRDPQQD AERVKNPEWL IVIGVCTHLG CIPLPNAGDF GGWFCPCHGS HY DISGRIR KGPAPYNLEV PTYTFLEENK LMIG

UniProtKB: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial

+
分子 #6: QCR7

分子名称: QCR7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 14.392698 KDa
配列文字列:
MASFLQSFLD PKKNWLAAQH MKSLVKRLSK YGLRYDDLYD PYYDLDVKEA LNRLPKEVVD ARHARLKRAI DLSMKHEYLP EDLQAMQTP FRGYLQDMLA LVKRERAERE ALGGLPLYQR SIP

UniProtKB: Cytochrome b-c1 complex subunit 7

+
分子 #7: QCR8

分子名称: QCR8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 8.349831 KDa
配列文字列:
MGKQIVPVKS VIYALSPFQQ KVMTGLWKDL PTKIHHKVSE NWISATLLLG PLVGTYAYVQ NYLEKEKLHH RY

UniProtKB: Cytochrome b-c1 complex subunit 8

+
分子 #8: QCR6

分子名称: QCR6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 8.117424 KDa
配列文字列:
MADEEPVDQK RYLEESCKPK CVKPLLEYQA CIKRIHGDDS GQKHCTGQYF DYWFCVDKCV APKLFTKLK

UniProtKB: Cytochrome b-c1 complex subunit 6

+
分子 #9: QCR9

分子名称: QCR9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 8.20342 KDa
配列文字列:
METVARRRGG GIFESLYKVV MRRNSVYVTF VIAGAFLGER AVDYGIHKLW EANNVGKRYE DIPVLGQKLS EE

UniProtKB: Complex III subunit 9

+
分子 #10: QCR10 (UCRY)

分子名称: QCR10 (UCRY) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 8.948875 KDa
配列文字列:
MAGLPARLRI QPADVKAAAM WGVAAATGGL YLVQVSILVL PPVKVVFHFY LVSGFRICLD VKDLRTMPCS APRIWRLYIL I

+
分子 #11: MPP-alpha (protomer 2)

分子名称: MPP-alpha (protomer 2) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 54.537684 KDa
配列文字列: MYRAAASSFR RHLKGHGSKL GSTRSSTSAA VAARTSKGGL FSWLTGERSS SLPSLDIPLG GVVLPDPLPD SVEQSKTKIT TLSNGLKIA SETSPNPAAS IGLYLDCGSI YETPFSSGAS HLLERMAFKS TTNRSHFRIV REVEAIGGNI GASASREQMG Y TFDALKTY ...文字列:
MYRAAASSFR RHLKGHGSKL GSTRSSTSAA VAARTSKGGL FSWLTGERSS SLPSLDIPLG GVVLPDPLPD SVEQSKTKIT TLSNGLKIA SETSPNPAAS IGLYLDCGSI YETPFSSGAS HLLERMAFKS TTNRSHFRIV REVEAIGGNI GASASREQMG Y TFDALKTY VPQMVELLVD CVRNPAFLDW EVNEELRKVK AELGELSNNP QGLLLEAIHS AGYSGALAYP LLAPEAALNR LD GPSLEEF VAENYTAPRM VLAAAGVEHE ELVSIAEPLL SDLPNVPRPD EPKSVYVGGD FRRHGESGGT HVALAFEVPG GWH KEKDAI VLTVLQMLMG GGGSFSAGGP GKGMHSRLYL RVLNEYQQIQ SFSAFNSIFN NTGLFGIYAS TSPDFAPKAV DIAA KELIA IASPGQVTQV QLDRAKKSTK SAVLMNLESR MIASEDIGRQ ILTYGERKPL EQFLKAVDEI TLNDITKISQ KIISS PLTM ASYGDVLSVP SYESVNRKFH AK

UniProtKB: Complex III subunit II

+
分子 #12: Nad1

分子名称: Nad1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 35.771562 KDa
配列文字列: MYIAVPAEIL GIILPLLLGV AFLVLAERKV MAFVQRRKGP DVVGSFGLLQ PLADGLKLIL KEPISPSSAN FFLFRMAPVA TFMLSLVAW AVVPFDYGMV LSDSNIGLLY LFAISSLGVY GIITAGWSSN SKYAFLGALR SAAQMVSYEV SIGLILITVL I CVGSCNLS ...文字列:
MYIAVPAEIL GIILPLLLGV AFLVLAERKV MAFVQRRKGP DVVGSFGLLQ PLADGLKLIL KEPISPSSAN FFLFRMAPVA TFMLSLVAW AVVPFDYGMV LSDSNIGLLY LFAISSLGVY GIITAGWSSN SKYAFLGALR SAAQMVSYEV SIGLILITVL I CVGSCNLS EIVMAQKQIW FGIPLFPVLV MFFISCLAET NRAPFDLPEA EAESVAGYNV EYSSMGFALF FLGEYANMIL MS GLCTSLS LGGWLPILDL PIFKRIPGSI WFSIKVILFL FLYIWVRAAF PRYRYDQLMG LGWKVFLPLS LAWVVAVSGV SVT FPWLP

+
分子 #13: Nad2

分子名称: Nad2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 54.06302 KDa
配列文字列: MFNLFLAVYP EIFIINATFI LLIHGVVFST SKKYDYPPLV SNVGWLGLLS VLITLLLLAA GAPLLTIAHL FRNNFFRRDN FTYFCQILL LLSTAGTISM CFDFFEQERF DAFEFIVLIL LSTCSMLFMI SAYDLIAMYL AIELQSLCFY VMAASKRKSE F STEAGLKY ...文字列:
MFNLFLAVYP EIFIINATFI LLIHGVVFST SKKYDYPPLV SNVGWLGLLS VLITLLLLAA GAPLLTIAHL FRNNFFRRDN FTYFCQILL LLSTAGTISM CFDFFEQERF DAFEFIVLIL LSTCSMLFMI SAYDLIAMYL AIELQSLCFY VMAASKRKSE F STEAGLKY LILGAFSSGI LLFGCSMIYG STGATHFDQL AKILTGYELA GARSSGIFMG ILFIAVGSLF KITAVPFHMW AP DIYEGSP TPVTAFLSIA PKISIFANIL RVFIYGSYGA TLQQIFCFCS IASMILGALA AMAQTKVKRL LAYSSIGHVG YIC IGFSCG TIEGIQSLLI GIFIYALMTI DAFAIVLALR QTRVKYIADL GALAKTNPIL AITFSITMFS YVGIPPLAGF CSKF YLFFA ALGCGAYFLA SVGVVTSVIG CFYYIRLVKR MFFDTPRTWI LYEPMDRDKS LLLAMTSSFI TLFFLYPSPL FSVTH QMAL SLYL

+
分子 #14: Nad3

分子名称: Nad3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 13.746171 KDa
配列文字列:
MLEFAPICIY LVISLLVSLI LLGLPFLFAS NSSTYPEKLS AYECGFDPFG DARSRFDIRF YLVSILFIIF DLEVTFFFPW AVSLNKIDL FGFWSMMAFL LILTIGFLYE WKRGALDWE

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

+
分子 #15: Nad4

分子名称: Nad4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 55.823391 KDa
配列文字列: MLEHFCECYF DLSGLILCPV LGSIILIFIP NSRIRLIRLI GLCASLITFL YSLVLWIQFD PSTAKFQFVE SLRWLPYENI NLNLGIDGL SFFFVILTTF LIPICILVGW SGMRSYGKEY IIAFLICEFL MIAVFCMLDL LLFYVFFESV LIPMFIIIGV W GSRQRKIK ...文字列:
MLEHFCECYF DLSGLILCPV LGSIILIFIP NSRIRLIRLI GLCASLITFL YSLVLWIQFD PSTAKFQFVE SLRWLPYENI NLNLGIDGL SFFFVILTTF LIPICILVGW SGMRSYGKEY IIAFLICEFL MIAVFCMLDL LLFYVFFESV LIPMFIIIGV W GSRQRKIK AAYQFFLYTL LGSVFMLLAI LLILFQTGTA DLQISLTTEF SERRQIFLWI AFFAAFAVKV PMVPVHIWLP EA HVEAPTA GSVILAGILS KLGTYGFLRF SIPMFPEATL CFTPFIYTLS AIAIIYTSLT TLRQIDLKKI IAYSSVAHMN LVT IGMFSL NIQGIGGSIL LMLSHGLVLS ALFLCVGVLY DRHKTRLVRY YGGLVSTMPN FSTIFFFFTL ANMSLPGTSS FIGE FLISV GAFQRNSLVA TLAALGMILG AAYSLWLYNR VVSGNLKADF LHKFSDLNGR EVFIFIPFLV GVVRMGVHPK VFLDR MHTY VSNLVQHGKF N

+
分子 #16: Nad4L

分子名称: Nad4L / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 11.153495 KDa
配列文字列:
MDLIKYFTFS MIIFILGIWG ILLNRRNILI MLMSIELMLL AVNSNFLVFS VSLDDMMGQL FALLVLTVAA AESAIGLAIF VITFRVRGT IAVEFINSIQ G

+
分子 #17: Nad5

分子名称: Nad5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 74.895273 KDa
配列文字列: MYLLIVFLPL IGSSFAGFFG RFLGSEGSAI MTTTCVSFSS ILSLIAFYEV ALGASACYLR IAPWISSEMF DASWGFLFDS LTVVMLIVV TFISSLVHLY SISYMSEDPH SPRFMCYLSI LTFFMLMLVT GDNFLQLFLG WEGVGLASYL LIHFWFTRLQ A DKAATKAM ...文字列:
MYLLIVFLPL IGSSFAGFFG RFLGSEGSAI MTTTCVSFSS ILSLIAFYEV ALGASACYLR IAPWISSEMF DASWGFLFDS LTVVMLIVV TFISSLVHLY SISYMSEDPH SPRFMCYLSI LTFFMLMLVT GDNFLQLFLG WEGVGLASYL LIHFWFTRLQ A DKAATKAM LVNRVGDFGL ALGILGCFTL FQTVDFSTIF ACASAPRNSW IRCNMRLNAI TLICILLFIG AVGKSAQIGS HT WLPDAME GPTPVSALIH AATMVTAGVF MIARCSPLFE YSPTALIVIT FAGAMTSFLA ATTGILQNDL KRVIAYSTCS QLG YMIFAC GISNYSVSVF HLMNHAFFKA LLFLSAGSVI HAMSDEQDMR KMGGLASSFP FTYAMMLMGS LSLIGFPFLT GFYS KDVIL ELAYTKYTIS GNFAFWLGSV SVLFTSYYSF RSLFLTFLVP TNSFGRDILR CHDAPIPMAI PLILLALGSL FVGYL AKDM MIGLGTNFWA NSLFVLPKNE ILAESEFAAP TITKLIPILF STSGASVAYN VNLVADQFQR AFQTSTFCNR LYSFFN KRW FFDQVLNDFL VRSFLRFGYE VSFEALDKGA IEILGPYGIS YTFRRLAERI SQLQSGFVYH YAFAMLLGLT LFVTFFC MW DSLSSWVDNR SSFILIVSSF FNNKSIIINK N

+
分子 #18: Nad6

分子名称: Nad6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 23.604369 KDa
配列文字列: MILSVLFSLA LVSGLMVVRA KNPVHSVLFF ILVFCDTSGL LLLLGLDFFA MIFLVVYIGA IAVLFLFVVM MFHIQIAEIH EEVLRYLPV SGIIGLILWW EMFFILDNET IPLLPTQINT TSLIYTVYAG KVRSWTNLET LGNLLYTYYF VWFLVPSLIL L VAMIGAIV ...文字列:
MILSVLFSLA LVSGLMVVRA KNPVHSVLFF ILVFCDTSGL LLLLGLDFFA MIFLVVYIGA IAVLFLFVVM MFHIQIAEIH EEVLRYLPV SGIIGLILWW EMFFILDNET IPLLPTQINT TSLIYTVYAG KVRSWTNLET LGNLLYTYYF VWFLVPSLIL L VAMIGAIV LTMHRTTKVK RQDVFRRNAI DFRRTIMRRT TDPLTID

+
分子 #19: NDUA1

分子名称: NDUA1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 7.357572 KDa
配列文字列:
MNLRWMEAVL PLGIIAGMLC VMGNAQYYIH KAAHGRPKHI GNDLWDVAME RRDKKLHEQA ASSSN

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1

+
分子 #20: NDUA2

分子名称: NDUA2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 10.884632 KDa
配列文字列:
MAWRGQLSKN IKELRFLMCQ SSSASASARA FVEKNYKELK TLNPKLPILI RECSGVEPQL WARYDLGVEK AIKLEGLSEA QISKALEDL AKAGQSSKA

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2

+
分子 #21: NDUA3

分子名称: NDUA3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 6.695044 KDa
配列文字列:
MAVMEKLKMF VVQEPVVAAS CLIAGFGLFL PAVVRPILDS YQATKQPPQP ALSDVVAGMT GKK

UniProtKB: Uncharacterized protein LOC106754061

+
分子 #22: NDUA5

分子名称: NDUA5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 18.977604 KDa
配列文字列:
MFLRAVARPL MAKVKASTGI VGLEVVPNAR EVLIGLYSKT LKEIQKVPED EGYRKAVESF TKHRLSVCKE EEDWEAIEKR LGCGQVEEL IEEAQDELKL ISYMIEWDPW GVPDDYECEV IENDAPVPKH VPLHRPPPLP TEFHKTLEAL SSQSGKDIPG A SSTESPSK T

UniProtKB: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5, mitochondrial

+
分子 #23: NDUA6

分子名称: NDUA6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 14.920034 KDa
配列文字列:
MASALRNVKV LPNSASVEEA RQRVFDFFRA TCRSLPSVME IYNLYDVTSV AQLRSTVASE IRKNIGVSDP KVIDMLLFKG MEELMNVVN HSKQRHHIIG QYVVGQQGQV QDSASKDPAI SPFLKNFYSS NYF

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6

+
分子 #24: NDUA7

分子名称: NDUA7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 14.356376 KDa
配列文字列:
MAKSASNSLV QTLKRYIKKP WEITGPCADP EYRSAVPLAT EYRLQCPATT KEKPCIPNSL PETVYDIKYF SRDQRRNRPP IRRTVLKKA DVEKLAKEQT FAVSDFPPVY LNSAVEEDIN AIGGGYQG

UniProtKB: Uncharacterized protein LOC106768957

+
分子 #25: NDUA8

分子名称: NDUA8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 12.022893 KDa
配列文字列:
MASAVDASGN PIPSSSVLMA SSKHIGIRCH SENLDFLKCK KKDPNPEKCL DKGRDVTRCV LGLLKDLHQK CTKEMDDYVG CMYYHTNEF DLCRKEQQAF EKKCSLE

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8-B

+
分子 #26: NDUA9

分子名称: NDUA9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 43.781504 KDa
配列文字列: MQTIARRLGH QSLKSSTSIR AIYPISDHHY VADHQRYVST IATKGVGHLV RKGTGGRSSV SGIIATVFGA TGFLGRYVVQ QLAKMGSQV LVPFRGSEDC PRHLKLMGDL GQIVPMKYNP RDESSVKAVM AKANVVINLI GRDYETRNYS FEEVHYHMAE N LAKISREH ...文字列:
MQTIARRLGH QSLKSSTSIR AIYPISDHHY VADHQRYVST IATKGVGHLV RKGTGGRSSV SGIIATVFGA TGFLGRYVVQ QLAKMGSQV LVPFRGSEDC PRHLKLMGDL GQIVPMKYNP RDESSVKAVM AKANVVINLI GRDYETRNYS FEEVHYHMAE N LAKISREH GGILRFIQVS CLGASPSSPS RMLRAKAAAE EVVLRELPEA TILKPAVMIG TEDRILNPWA HFAKKYGFIP LF GNGSTKI QPVYVVDVAA ALTTVLKDDG TSMGKTYELG GPEIFTVHDL AELMYETIRE WPRYVKVPFP IAKALATPRE ILL NKVPFP LPTPEILNLD KIQALTTDTI VSENALTFND LGIIPHKLKG YPVEFLISYR KGGPQFGSTI SERVTPDAWP

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial isoform X1

+
分子 #27: NDUA11

分子名称: NDUA11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 17.284715 KDa
配列文字列:
MVDAAERRYL EDEDTPFMKT IKGATTGLVA GTIWGTVVAT WYDVPRVERS VALPGLIRTF KMMGNYGLTF AAIGGVYIGV EQLLQNYRM KRDLVNGAVG GFVAGATILG YKGRSIKTAL SAGSALAFTS AYIDFGGQTL KHDEGKEYAA YTTKKRTSGD E

UniProtKB: Outer envelope pore protein 16-3, chloroplastic/mitochondrial

+
分子 #28: NDUA12

分子名称: NDUA12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 18.192482 KDa
配列文字列:
MASVVKNVLK SIREKGFGTF LRELKDEGYL RCLPDGNLLQ TKIHNIGATL VGVDKFGNKY YEKLGDTQYG RHRWVEYAEK SRYNASQVP PEWHGWLHFI TDHTGDELLL LKPKRYGVEH KENLSGEGEQ YIYHSKGHAL NPGQRDWTRY QPWESKA

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12

+
分子 #29: NDUA13

分子名称: NDUA13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 16.1896 KDa
配列文字列:
MTEAYIRNKP GMVSVKDMPV LQDGPPPGGF APVRFARRIP NKGPSAVAIF LAAFGTFSWG MYQVGQGNKI RRALKEEKYA ARRSILPVL QAEEDERFVR EWHKYLAYEA EVMKDVPGWK VGESVYNSGR WVPPASGELR PDIW

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13

+
分子 #30: NDUAB1-beta

分子名称: NDUAB1-beta / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 13.066032 KDa
配列文字列:
MAVRAAVLRH IRVPLQAVPR LQPWRAMSSH GDDHLSKEEV IQRVLAVVKD FPKVDPSKVT PDVHFQKDLG LDSLDNVEIV MALEEEFKL EIPDKEADKI DSCNLAIEYI ANHPMAG

UniProtKB: Acyl carrier protein

+
分子 #31: NDUAB1-alpha

分子名称: NDUAB1-alpha / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 14.314356 KDa
配列文字列:
MAASRSTLPL IKYLRVRVDA LPRNSPLTLA PTVFLRRFCE EVRGSFLDKS EVADRVISCV KNFQKVDPAK VTPNAHFQND LGLDSLDAV EIVMALEEEF GFEIPDNEAD KINSIKHAVD FIASHPQAK

UniProtKB: Acyl carrier protein

+
分子 #32: NDUB2

分子名称: NDUB2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 7.555608 KDa
配列文字列:
MGGHGEGTTY KGVTIHQPKR WHTITGKGLC AVMWFWVLYR AKQDGPVVLG WRHPWEGHHD DHGKGH

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2

+
分子 #33: NDUB3

分子名称: NDUB3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 7.843885 KDa
配列文字列:
MGSGKHTAEF FRRRDAWRKH PMLTNQFRHA TPGLGIALVA FGFYLVGEQV YDRLNADSHV HVKAENHH

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3-B

+
分子 #34: NDUB4

分子名称: NDUB4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 8.364627 KDa
配列文字列:
MGGGMEANKN KFIEDWGTAR ENLEFNFRWT RRNLALVGIF GIAIPVLVYK GIVREFHMQD EDNGRPYRKF M

UniProtKB: Uncharacterized protein LOC106766640

+
分子 #35: NDUB7

分子名称: NDUB7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 11.600554 KDa
配列文字列:
MEVEGSSKKM IATQEEMVEA RVPLAYRDQC AHLLIPLNKC RQAEFYLPWK CENERHSYEK CEYELVMERM LQMQKIREEQ KKADAKQPL ILVPKPANA

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7

+
分子 #36: NDUB8

分子名称: NDUB8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 13.592655 KDa
配列文字列:
MAGRLTNAAS RILGGNGVVY RSVASSLRLR SGMGLPVGKH YIPDKPLPMN EELLWDNGTP FPEPCIDRIA DTVGKYEALA WLCGGLSFF ASLGLLAVWN DKASKIPFTP KVYPYDNLRV ELGGEP

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial

+
分子 #37: NDUB9

分子名称: NDUB9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 13.519021 KDa
配列文字列:
MASTAAYLAR RAAQKERVRI LYRRALKDTL NWAVHRHLFY NDAENLRDRF EENKHVEDPD TIDRLIADAE ASYNKWRHPD PYIVPWAPG GSKFTRNPAP PQGIEIVYDY GREDNN

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9

+
分子 #38: NDUB10

分子名称: NDUB10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 12.587426 KDa
配列文字列:
MGRKKGYVEF DESPPDDFDP ANPYKDPVAM LEMREYIVRE KWIQIEKAKI IREKLRWCYR IEGVNHLQKC RHLVNQYLES TRGIGWGKD GRHPSLHAPK VEPVESE

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10-B

+
分子 #39: NDUB11

分子名称: NDUB11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 13.157823 KDa
配列文字列:
MPPATPFATA SATIRRRVLQ SLRTRGGAES GPSRWTSPGH EERPKGYLFN RTPPPPGQSR KWEDWELPCY ITSFLTIVIL GVGLNAKPD LTIETWAHEK ALERLKIENA LASNNDSSE

UniProtKB: Uncharacterized protein LOC106771273

+
分子 #40: NDUFX

分子名称: NDUFX / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 17.610127 KDa
配列文字列:
MAVANLQRLS SQVQRLPSLS FFSKSLISRS TATSSSSKKV SDRIVRLSAI DFEGKKHEVV GLAGHTLLKA LINTGLIDPD SHRLEEIDA CSAHCEVNIA QEWLDKLPPR SYDEEYVLVR NSRARVLNKH SRLGCQVLLD HNLQGMVVAL PEPKPWDTS

UniProtKB: Uncharacterized protein LOC106779486

+
分子 #41: NDUC2

分子名称: NDUC2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 9.243669 KDa
配列文字列:
MVLSATTIGA LLGLGTQMYS NALRKLPYMR HPWEHVVGMG LGAVFVNQLL KWEAQVEQDL DKMLEKAKAA NERRYIDGDD DI

+
分子 #42: NDUP2

分子名称: NDUP2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 12.172666 KDa
配列文字列:
MAARVAARYG SRRLFSSGSG KILSEEEKAA ENAYFKKAEQ DKLEKLARKG PQPEASSGGS VIDAKPSGSG HTGASAERVS TDKHRNYAV VAGTITILGA LGWYLKGTAK KPEVQD

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #43: NDUCA1

分子名称: NDUCA1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 29.333197 KDa
配列文字列: MGTLGRAFYA VGFWIRETGQ AIDRLGSRLQ GNYLFQEQLS RHRPLMNLFD KYPSVHKDAF VAPSASLLGD VHVGPASSIW YGCVLRGDV NGIVIGSGTN IQDNSLVHVA KSNLTGKVLP TIIGDNVTVG HSAVLQGCTV EDEAFIGMGA TLLDGVYVEK H AMVAAGAL ...文字列:
MGTLGRAFYA VGFWIRETGQ AIDRLGSRLQ GNYLFQEQLS RHRPLMNLFD KYPSVHKDAF VAPSASLLGD VHVGPASSIW YGCVLRGDV NGIVIGSGTN IQDNSLVHVA KSNLTGKVLP TIIGDNVTVG HSAVLQGCTV EDEAFIGMGA TLLDGVYVEK H AMVAAGAL VRQNTRIPYG EVWGGNPAKF LRKLTEDEMA FFSQSALNYS NLAQAHAAEN AKELEETEFV KVLHKKFAPR GE EYDSILD GGQETPAKLN LQDNVLLDKA PKA

UniProtKB: Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial

+
分子 #44: NDUCA2

分子名称: NDUCA2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 29.780861 KDa
配列文字列: MGTLGRAIYS VGFWIRETGQ AIDRLGSRLQ GGYFFQEQLS RHRTLMNIFD KAPVVDKDVF VAPSASVIGD VQVGRGSSIW YGCVLRGDV NSIRVGSGTN IQDNSLVHVA KSNLSGKVLP TVIGDNVTVG HSAVLHGCTV EDEAFVGMGA VLLDGVVVEK N AMVAAGAL ...文字列:
MGTLGRAIYS VGFWIRETGQ AIDRLGSRLQ GGYFFQEQLS RHRTLMNIFD KAPVVDKDVF VAPSASVIGD VQVGRGSSIW YGCVLRGDV NSIRVGSGTN IQDNSLVHVA KSNLSGKVLP TVIGDNVTVG HSAVLHGCTV EDEAFVGMGA VLLDGVVVEK N AMVAAGAL VRQNTRIPSG EVWAGNPAKF LRKLSNEEIT FISQSAINYT NLAQVHAAEN SKSYDEIEFE KVLRKKYARK DE EYDSMLG VVREIPPELI LPDNVLPDKA EKALQK

UniProtKB: Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial-like

+
分子 #45: NDUCAL2

分子名称: NDUCAL2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 28.268359 KDa
配列文字列: MANLARFSKR ALRSAHSLVR HAQSQVQPQL FAEERAFSTE AAKSITPSPD RVKWDYRGQR KIIPLGQWLP KVAVDAYVAP NVVLAGQVT VWDGASVWPG CVLRGDLNKI SIGFCSNVQE RSVLHAAWTS PTGLPADTSI ERYVTIGAYS LLRSCTIEPE C IIGQHSIL ...文字列:
MANLARFSKR ALRSAHSLVR HAQSQVQPQL FAEERAFSTE AAKSITPSPD RVKWDYRGQR KIIPLGQWLP KVAVDAYVAP NVVLAGQVT VWDGASVWPG CVLRGDLNKI SIGFCSNVQE RSVLHAAWTS PTGLPADTSI ERYVTIGAYS LLRSCTIEPE C IIGQHSIL MEGSLVETQS ILEAGSVVPP GRRIPSGELW AGNPARFVRT LTHEEILEIP KLAVAINDLS RDHYSEFLPY ST VYLEVEK FKKSLGISV

UniProtKB: Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial

+
分子 #46: NDUS1

分子名称: NDUS1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 81.434219 KDa
配列文字列: MGFGLLASKA LRPTSRLLLS SQNPTIFLRT IVSKPQLCNP EASAAQPAQP PPVDLPPRSP LAGARVHFAN PDDAIEVFVD GYPVKIPKG MTVLQACEVA GVDIPRFCYH SRLSIAGNCR MCLVEVEKSP KPVASCAMPA LPGMKIKTDT PVAKKAREGV M EFLLMNHP ...文字列:
MGFGLLASKA LRPTSRLLLS SQNPTIFLRT IVSKPQLCNP EASAAQPAQP PPVDLPPRSP LAGARVHFAN PDDAIEVFVD GYPVKIPKG MTVLQACEVA GVDIPRFCYH SRLSIAGNCR MCLVEVEKSP KPVASCAMPA LPGMKIKTDT PVAKKAREGV M EFLLMNHP LDCPICDQGG ECDLQDQSMA FGSDRGRFTE VKRSVVDKNL GPLVKTVMTR CIQCTRCVRF ATEVAGVQDL GM LGRGSGE EIGTYVEKLL TSELSGNVID ICPVGALTSK PFAFKARNWE LKGTETIDVT DAVGSNIRID SRGPEVMRIV PRL NEDINE EWISDKTRFC YDGLKRQRLN DPMIRGPDGR FKAVNWRDAL SVIADIAHQV KPEEIVGVAG KLSDAESMIA LKDF LNRMG SNDVWGEGIG VNTNADFRSG YIMNTSIAGL EKADVFLLVG TQPRVEAAMV NARIRKTVRS NQAKVGYIGP ATDFN YDHK HLGTDPQTLV EIAEGRHPFF KTLSDAKNPV IIVGAGVFER KDQDAIFAAV ETIAQKANVV RPDWNGLNVL LLHAAQ AAA LDLGLVPQSE KSLESAKFVY LMGADDVNLD KIPDDAFVVY QGHHGDKSVY RANVILPTAA FSEKEGTYQN TEGCTQQ TL PAVPTVGDSR DDWKIIRALS EVAGVRLPYD TIGAVRARIR NVAPNLVNVD EREPATLPSS LRPSFTQKVD TTPFGTVI E NFYMTDAITR ASKIMAQCSA TLLKK

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 1, mitochondrial

+
分子 #47: NDUS2

分子名称: NDUS2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 45.031637 KDa
配列文字列: MTTRNGQIKN FTLNFGPQHP ANFGSLRLVL EMNGEVVERA EPHIGLLHRG TEKLIEYKTY LQALPYFDRL DYVSTMAQEH AYSLAVERL LNCEVPLRAQ YIRVLFCEIT RILNHLLALT THAMDVGAST PFLWAFEERE KLLEFYERVS GARMHASFIR P GGVAQDLP ...文字列:
MTTRNGQIKN FTLNFGPQHP ANFGSLRLVL EMNGEVVERA EPHIGLLHRG TEKLIEYKTY LQALPYFDRL DYVSTMAQEH AYSLAVERL LNCEVPLRAQ YIRVLFCEIT RILNHLLALT THAMDVGAST PFLWAFEERE KLLEFYERVS GARMHASFIR P GGVAQDLP LGLCRDIDSF TQQFASRIDE LEEMLTGNRI WKQRLVDIGT VTAQQAKDWG FSGVMLRGPG VCWDLRRAAP YD VYDQLDF DVPVGTRGDC YDRYCIRIEE MRQSMRIIWQ CLNKIPSGMI KADDRKLCPP SRCRMKLSME SSIHHFELYT EGF SVPASS TYTAVEAPKG EFGVFLVSNG SNRPYRCKIR APGFAHLQGL DFMSKHHMLA DVVTIIGTQD IVFGEVDR

+
分子 #48: NDUS3

分子名称: NDUS3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 22.926971 KDa
配列文字列: MDNQFIFKYS WETLPKKWVK KMERSEHGNR FDTKTDYLFQ LLCFLKLHTY TRVQVLIDIC GVDYPSRKRR FEVVYNLLST RYNSRIRVQ TSADEVTRIS SVVSLFPSAG WWEREVWDMF GVSFINHPDL RRILTDYGFE GHPLRKDFPL SGYVEVRYDD P EKRVVSEP ...文字列:
MDNQFIFKYS WETLPKKWVK KMERSEHGNR FDTKTDYLFQ LLCFLKLHTY TRVQVLIDIC GVDYPSRKRR FEVVYNLLST RYNSRIRVQ TSADEVTRIS SVVSLFPSAG WWEREVWDMF GVSFINHPDL RRILTDYGFE GHPLRKDFPL SGYVEVRYDD P EKRVVSEP IEMTQEFRYF DFASPWEQRS DG

+
分子 #49: NDUS4

分子名称: NDUS4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 16.435736 KDa
配列文字列:
MANTLQRALR ATMARRFSTQ ALVETKPGEI GMVSGIPQEH LRRRVVIYSP ARTASQQGSG KVGRWKINFL STQKWENPLM GWTSTGDPY AHVGDSALTF DSAEAAKAFA EKHGWEYSVK KRHTPLLKVK SYADNFKWKG FPKPAEE

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial

+
分子 #50: NDUS5

分子名称: NDUS5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 9.966398 KDa
配列文字列:
MASGWGITGN KGRCYDFWMD FSECMSRCRE PKDCGLLRED YLECLHHSKE FQRRNRIYKE EQRKIRAAAK KAKDDGVVKE HHY

UniProtKB: Serine/arginine-rich-splicing factor SR34 isoform X2

+
分子 #51: NDUS6

分子名称: NDUS6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 11.582296 KDa
配列文字列:
MASSVLRNLM RFSSPRNTST RSFSLVTSQI SNHTAKWMQD TSKKSPMELI NEVPPIKVEG RIVACEGDTN PALGHPIEFI CLDLPEPAV CKYCGLRYVQ DHHH

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial

+
分子 #52: NDUS7

分子名称: NDUS7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 23.710473 KDa
配列文字列: MALLSRASSR IYQVHSYQRA LSLHTTLPAL NASTSTHTPT PYAPPPPPSA SSPVGVSKAA EFVISKVDDL MNWARRGSIW PMTFGLACC AVEMMHTGAA RYDLDRFGII FRPSPRQSDC MIVAGTLTNK MAPALRKVYD QMPEPRWVIS MGSCANGGGY Y HYSYSVVR ...文字列:
MALLSRASSR IYQVHSYQRA LSLHTTLPAL NASTSTHTPT PYAPPPPPSA SSPVGVSKAA EFVISKVDDL MNWARRGSIW PMTFGLACC AVEMMHTGAA RYDLDRFGII FRPSPRQSDC MIVAGTLTNK MAPALRKVYD QMPEPRWVIS MGSCANGGGY Y HYSYSVVR GCDRIVPVDI YVPGCPPTAE ALLYGLLQLQ KKINRRKDFL HWWTK

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial

+
分子 #53: NDUS8

分子名称: NDUS8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 25.54501 KDa
配列文字列: MAAILARKSL LALRARQLAV SGQGLHSSQS YGLRLSAHSF STKLEDEQRE QLAKEISKDW SSVFERSINT LFLTEMVRGL MLTLKYFFE TKVTINYPFE KGPLSPRFRG EHALRRYPTG EERCIACKLC EAICPAQAIT IEAEEREDGS RRTTRYDIDM T KCIYCGFC ...文字列:
MAAILARKSL LALRARQLAV SGQGLHSSQS YGLRLSAHSF STKLEDEQRE QLAKEISKDW SSVFERSINT LFLTEMVRGL MLTLKYFFE TKVTINYPFE KGPLSPRFRG EHALRRYPTG EERCIACKLC EAICPAQAIT IEAEEREDGS RRTTRYDIDM T KCIYCGFC QEACPVDAIV EGPNFEFATE THEELLYDKE KLLENGDRWE TEIAENLRSE SLYR

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein

+
分子 #54: NDUP1

分子名称: NDUP1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 11.245803 KDa
配列文字列:
MGFIMEFAEN LVLKLMEDPK ERDRRFREHV YRVKDRCEKT KEMWSYPMRP YGFWTFERHN SQLAWDAQIS QVPGRRDPYD DLLQHYSTP PK

UniProtKB: Uncharacterized protein LOC106761134

+
分子 #55: NDUP4

分子名称: NDUP4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 7.316445 KDa
配列文字列:
MVRVASYFAM TLGAFVFWQS MDKVHVWIAL HQDEKQERLE KEAEIRRVRE ELLKQQANQK G

UniProtKB: Uncharacterized protein LOC106767179

+
分子 #56: NDUB6

分子名称: NDUB6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 9.708139 KDa
配列文字列:
MGGGGGDHGH GNGDFRTKVW SMTGGPYCRP KHWKRNTAIA MFGVVLVCIP IAMKSAELEQ RPHHPVRPIP SQLWCKNFGT KDYEQSE

UniProtKB: Uncharacterized protein LOC106758628

+
分子 #57: NDUV1

分子名称: NDUV1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 53.90466 KDa
配列文字列: MRGILSLRSA LVQHRSEKLG LGLRQFSTQG ASTPTSPQPP PPPASPQPPP PPPPPEKTHF GGLKDEDRIF TNLYGLHDPF LKGAMKRGD WYRTKDLVIK GTDWIVNEMK KSGLRGRGGA GFPSGLKWSF MPKVSDGRPS YLVVNADESE PGTCKDREIM R HDPHKLLE ...文字列:
MRGILSLRSA LVQHRSEKLG LGLRQFSTQG ASTPTSPQPP PPPASPQPPP PPPPPEKTHF GGLKDEDRIF TNLYGLHDPF LKGAMKRGD WYRTKDLVIK GTDWIVNEMK KSGLRGRGGA GFPSGLKWSF MPKVSDGRPS YLVVNADESE PGTCKDREIM R HDPHKLLE GCLIAGVGMR ATAAYIYIRG EYVNERKNLE KARQEAYAAG LLGKNACGSG YDFDVHIHFG AGAYICGEET AL LESLEGK QGKPRLKPPF PANAGLYGCP TTVTNVETVA VSPTILRRGP EWFAGFGRKN NAGTKLFCVS GHVNKPCTVE EEM SIPLKE LIERHCGGVR GGWDNLLAVI PGGSSVPLLP KSICDDVLMD YDALKAVQSG LGTAAVIVMD KSTDVVDAIA RLSY FYKHE SCGQCTPCRE GTGWLWTIME RMKVGNAKLE EIDMLQELTK QIEGHTICAL GDAAAWPVQG LIRHFRPELE RRIRE NAER ELLQATGS

+
分子 #58: NDUV2

分子名称: NDUV2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 27.992949 KDa
配列文字列: MLARLAANRF NEIRHIFRQP SRAFSTALNY HLDSPDNNPN LPWEFTEPNK AKVTEILSHY PSNYKQSAVI PLLDLAQQQH GGWLPVSAM NAVANIIEVP PIRVYEVATF YSMFNRAKVG KYHLLVCGTT PCMIRGSRGI EEALLKHLGV KRNEVTPDGL F SVGEMECM ...文字列:
MLARLAANRF NEIRHIFRQP SRAFSTALNY HLDSPDNNPN LPWEFTEPNK AKVTEILSHY PSNYKQSAVI PLLDLAQQQH GGWLPVSAM NAVANIIEVP PIRVYEVATF YSMFNRAKVG KYHLLVCGTT PCMIRGSRGI EEALLKHLGV KRNEVTPDGL F SVGEMECM GCCVNAPMIT VADYSNGSEG YTYNYYEDVT PEKVVEIVEK LRKGEKPPHG TQNPLRIRSG PEGGNTTLLG EP KPPPCRD LDAC

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein

+
分子 #59: NDUX1

分子名称: NDUX1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vigna radiata (リョクトウ)
分子量理論値: 10.94954 KDa
配列文字列:
MNTDITASTK PEYPVVDRNP PFTKVVGNFS TLDYLRFVTI TGVSVTVGYL SGIKPGIRGP SMVTGGLIGV MGGFMYAYQN SAGRLMGFF PNDDEVARHN KK

UniProtKB: Uncharacterized protein LOC106775330

+
分子 #60: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE

分子名称: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / タイプ: ligand / ID: 60 / コピー数: 8 / 式: PC1
分子量理論値: 790.145 Da
Chemical component information

ChemComp-PC1:
1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / リン脂質*YM

+
分子 #61: CARDIOLIPIN

分子名称: CARDIOLIPIN / タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 8 / 式: CDL
分子量理論値: 1.464043 KDa
Chemical component information

ChemComp-CDL:
CARDIOLIPIN / リン脂質*YM

+
分子 #62: PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE

分子名称: PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / タイプ: ligand / ID: 62 / コピー数: 4 / 式: HEM
分子量理論値: 616.487 Da
Chemical component information

ChemComp-HEM:
PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE

+
分子 #63: 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine

分子名称: 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine / タイプ: ligand / ID: 63 / コピー数: 8 / 式: 3PE
分子量理論値: 748.065 Da
Chemical component information

ChemComp-3PE:
1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine / リン脂質*YM

+
分子 #64: HEME C

分子名称: HEME C / タイプ: ligand / ID: 64 / コピー数: 2 / 式: HEC
分子量理論値: 618.503 Da
Chemical component information

ChemComp-HEC:
HEME C

+
分子 #65: UBIQUINONE-10

分子名称: UBIQUINONE-10 / タイプ: ligand / ID: 65 / コピー数: 1 / 式: U10
分子量理論値: 863.343 Da
Chemical component information

ChemComp-U10:
UBIQUINONE-10

+
分子 #66: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE

分子名称: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
タイプ: ligand / ID: 66 / コピー数: 1 / 式: NDP
分子量理論値: 745.421 Da
Chemical component information

ChemComp-NDP:
NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE

+
分子 #67: S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-b...

分子名称: S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate
タイプ: ligand / ID: 67 / コピー数: 2 / 式: ZMP
分子量理論値: 568.704 Da
Chemical component information

ChemComp-ZMP:
S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate

+
分子 #68: FE (III) ION

分子名称: FE (III) ION / タイプ: ligand / ID: 68 / コピー数: 1 / 式: FE
分子量理論値: 55.845 Da

+
分子 #69: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 69 / コピー数: 2 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #70: IRON/SULFUR CLUSTER

分子名称: IRON/SULFUR CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 70 / コピー数: 6 / 式: SF4
分子量理論値: 351.64 Da
Chemical component information

ChemComp-FS1:
IRON/SULFUR CLUSTER

+
分子 #71: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

分子名称: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 71 / コピー数: 2 / 式: FES
分子量理論値: 175.82 Da
Chemical component information

ChemComp-FES:
FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

+
分子 #72: FLAVIN MONONUCLEOTIDE

分子名称: FLAVIN MONONUCLEOTIDE / タイプ: ligand / ID: 72 / コピー数: 1 / 式: FMN
分子量理論値: 456.344 Da
Chemical component information

ChemComp-FMN:
FLAVIN MONONUCLEOTIDE

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

濃度1.55 mg/mL
緩衝液pH: 7.7
詳細: 0.2% digitonin, 30 mM HEPES pH 7.7, 150 mM potassium acetate, 1 mM EDTA, 0.002% PMSF
グリッドモデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: COPPER / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 60 sec. / 前処理 - 雰囲気: AIR
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 90 % / 装置: LEICA EM GP / 詳細: 4 ul, 20 seconds pre-blot, blot 4 seconds.
詳細Digitonin-extracted, amphipol (A8-35)stabilized

-
電子顕微鏡法

顕微鏡TFS GLACIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 撮影したグリッド数: 2 / 実像数: 25712 / 平均露光時間: 3.0 sec. / 平均電子線量: 60.0 e/Å2
電子線加速電圧: 200 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: OTHER / 撮影モード: OTHER / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.5 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.5 µm
試料ステージホルダー冷却材: NITROGEN

+
画像解析

初期モデルモデルのタイプ: NONE
最終 再構成使用したクラス数: 1 / 想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.2 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC / 使用した粒子像数: 123451
初期 角度割当タイプ: NOT APPLICABLE
最終 角度割当タイプ: NOT APPLICABLE
FSC曲線 (解像度の算出)

-
原子モデル構築 1

精密化空間: REAL / プロトコル: RIGID BODY FIT
得られたモデル

PDB-8e73:
Vigna radiata supercomplex I+III2 (full bridge)

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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