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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Full-length insulin receptor bound with site 1 binding deficient mutant insulin (A-V3E) | |||||||||
![]() | Full-length insulin receptor bound with site 1 binding deficient mutant insulin (A-V3E) | |||||||||
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機能・相同性 | ![]() Signaling by Insulin receptor / Insulin receptor recycling / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Bai XC / Choi E | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Synergistic activation of the insulin receptor via two distinct sites. 著者: Jie Li / Junhee Park / John P Mayer / Kristofor J Webb / Emiko Uchikawa / Jiayi Wu / Shun Liu / Xuewu Zhang / Michael H B Stowell / Eunhee Choi / Xiao-Chen Bai / ![]() 要旨: Insulin receptor (IR) signaling controls multiple facets of animal physiology. Maximally four insulins bind to IR at two distinct sites, termed site-1 and site-2. However, the precise functional ...Insulin receptor (IR) signaling controls multiple facets of animal physiology. Maximally four insulins bind to IR at two distinct sites, termed site-1 and site-2. However, the precise functional roles of each binding event during IR activation remain unresolved. Here, we showed that IR incompletely saturated with insulin predominantly forms an asymmetric conformation and exhibits partial activation. IR with one insulin bound adopts a Γ-shaped conformation. IR with two insulins bound assumes a Ƭ-shaped conformation. One insulin binds at site-1 and another simultaneously contacts both site-1 and site-2 in the Ƭ-shaped IR dimer. We further show that concurrent binding of four insulins to sites-1 and -2 prevents the formation of asymmetric IR and promotes the T-shaped symmetric, fully active state. Collectively, our results demonstrate how the synergistic binding of multiple insulins promotes optimal IR activation. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 165.8 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 14.6 KB 14.6 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 33 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 7sl1MC ![]() 7sl2C ![]() 7sl3C ![]() 7sl4C ![]() 7sl6C ![]() 7sl7C ![]() 7sthC ![]() 7stiC ![]() 7stjC ![]() 7stkC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | Full-length insulin receptor bound with site 1 binding deficient mutant insulin (A-V3E) | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.83 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : Full-length insulin receptor bound with site 1 binding deficient ...
全体 | 名称: Full-length insulin receptor bound with site 1 binding deficient mutant insulin (A-V3E) |
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要素 |
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-超分子 #1: Full-length insulin receptor bound with site 1 binding deficient ...
超分子 | 名称: Full-length insulin receptor bound with site 1 binding deficient mutant insulin (A-V3E) タイプ: complex / キメラ: Yes / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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-分子 #1: Insulin receptor
分子 | 名称: Insulin receptor / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: ![]() |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 155.790516 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MGFGRGCETT AVPLLVAVAA LLVGTAGHLY PGEVCPGMDI RNNLTRLHEL ENCSVIEGHL QILLMFKTRP EDFRDLSFPK LIMITDYLL LFRVYGLESL KDLFPNLTVI RGSRLFFNYA LVIFEMVHLK ELGLYNLMNI TRGSVRIEKN NELCYLATID W SRILDSVE ...文字列: MGFGRGCETT AVPLLVAVAA LLVGTAGHLY PGEVCPGMDI RNNLTRLHEL ENCSVIEGHL QILLMFKTRP EDFRDLSFPK LIMITDYLL LFRVYGLESL KDLFPNLTVI RGSRLFFNYA LVIFEMVHLK ELGLYNLMNI TRGSVRIEKN NELCYLATID W SRILDSVE DNYIVLNKDD NEECGDVCPG TAKGKTNCPA TVINGQFVER CWTHSHCQKV CPTICKSHGC TAEGLCCHKE CL GNCSEPD DPTKCVACRN FYLDGQCVET CPPPYYHFQD WRCVNFSFCQ DLHFKCRNSR KPGCHQYVIH NNKCIPECPS GYT MNSSNL MCTPCLGPCP KVCQILEGEK TIDSVTSAQE LRGCTVINGS LIINIRGGNN LAAELEANLG LIEEISGFLK IRRS YALVS LSFFRKLHLI RGETLEIGNY SFYALDNQNL RQLWDWSKHN LTITQGKLFF HYNPKLCLSE IHKMEEVSGT KGRQE RNDI ALKTNGDQAS CENELLKFSF IRTSFDKILL RWEPYWPPDF RDLLGFMLFY KEAPYQNVTE FDGQDACGSN SWTVVD IDP PQRSNDPKSQ TPSHPGWLMR GLKPWTQYAI FVKTLVTFSD ERRTYGAKSD IIYVQTDATN PSVPLDPISV SNSSSQI IL KWKPPSDPNG NITHYLVYWE RQAEDSELFE LDYCLKGLKL PSRTWSPPFE SDDSQKHNQS EYDDSASECC SCPKTDSQ I LKELEESSFR KTFEDYLHNV VFVPRPSRKR RSLEEVGNVT ATTLTLPDFP NVSSTIVPTS QEEHRPFEKV VNKESLVIS GLRHFTGYRI ELQACNQDSP DERCSVAAYV SARTMPEAKA DDIVGPVTHE IFENNVVHLM WQEPKEPNGL IVLYEVSYRR YGDEELHLC VSRKHFALER GCRLRGLSPG NYSVRVRATS LAGNGSWTEP TYFYVTDYLD VPSNIAKIII GPLIFVFLFS V VIGSIYLF LRKRQPDGPM GPLYASSNPE YLSASDVFPS SVYVPDEWEV PREKITLLRE LGQGSFGMVY EGNAKDIIKG EA ETRVAVK TVNESASLRE RIEFLNEASV MKGFTCHHVV RLLGVVSKGQ PTLVVMELMA HGDLKSHLRS LRPDAENNPG RPP PTLQEM IQMTAEIADG MAYLNAKKFV HRDLAARNCM VAHDFTVKIG DFGMTRDIYE TDYYRKGGKG LLPVRWMSPE SLKD GVFTA SSDMWSFGVV LWEITSLAEQ PYQGLSNEQV LKFVMDGGYL DPPDNCPERL TDLMRMCWQF NPKMRPTFLE IVNLL KDDL HPSFPEVSFF YSEENKAPES EELEMEFEDM ENVPLDRSSH CQREEAGGRE GGSSLSIKRT YDEHIPYTHM NGGKKN GRV LTLPRSNPS |
-分子 #2: Insulin B chain
分子 | 名称: Insulin B chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 3.433953 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: FVNQHLCGSH LVEALYLVCG ERGFFYTPKT |
-分子 #3: Insulin A chain
分子 | 名称: Insulin A chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 2.413681 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: GIEEQCCTSI CSLYQLENYC N |
-実験情報
-構造解析
手法 | ![]() |
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![]() | ![]() |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
濃度 | 6 mg/mL |
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緩衝液 | pH: 8 |
グリッド | モデル: Quantifoil / 材質: GOLD / メッシュ: 300 / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE |
凍結 | 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / 装置: FEI VITROBOT MARK IV |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD![]() |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 60.0 e/Å2 |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
粒子像選択 | 選択した数: 589579 |
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CTF補正 | ソフトウェア - 名称: Gctf |
初期モデル | モデルのタイプ: OTHER / 詳細: From RELION3 |
初期 角度割当 | タイプ: PROJECTION MATCHING / ソフトウェア - 名称: RELION |
最終 3次元分類 | ソフトウェア - 名称: RELION |
最終 角度割当 | タイプ: PROJECTION MATCHING / ソフトウェア - 名称: RELION |
最終 再構成 | 想定した対称性 - 点群: C2 (2回回転対称![]() |