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データを開く
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基本情報
登録情報 | ![]() | ||||||||||||
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タイトル | Cryo-Electron Tomography of a Cryo-Lamella Milled Inside a Zebra Fish Muscle Tissue Biopsy | ||||||||||||
![]() | Cryo-Electron Tomography of Zebra Fish Muscle Tissue Biopsy | ||||||||||||
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![]() | Thin filament / thick filament / MOTOR PROTEIN | ||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||||||||
手法 | 電子線トモグラフィー法 | ||||||||||||
![]() | Trepout S / Ramm G | ||||||||||||
資金援助 | ![]() ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Cryo-Electron Tomography of a Cryo-Lamella Milled Inside a Zebra Fish Muscle Tissue Biopsy 著者: Trepout S / Ramm G | ||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 3.7 GB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 9 KB 9 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 250.3 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 3.6 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | Cryo-Electron Tomography of Zebra Fish Muscle Tissue Biopsy | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 14.66 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : Biopsy of Zebra Fish Muscle
全体 | 名称: Biopsy of Zebra Fish Muscle |
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要素 |
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-超分子 #1: Biopsy of Zebra Fish Muscle
超分子 | 名称: Biopsy of Zebra Fish Muscle / タイプ: tissue / ID: 1 / 親要素: 0 詳細: Cryo-lamella cut inside the biopsy using the bbq method. |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-実験情報
-構造解析
![]() | 電子線トモグラフィー法 |
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試料の集合状態 | tissue |
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試料調製
緩衝液 | pH: 6.9 |
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加圧凍結法 | 装置: OTHER 詳細: The value given for _em_high_pressure_freezing.instrument is HPF Wohlwend Compact 03. This is not in a list of allowed values {'EMS-002 RAPID IMMERSION FREEZER', 'BAL-TEC HPM 010', 'LEICA EM ...詳細: The value given for _em_high_pressure_freezing.instrument is HPF Wohlwend Compact 03. This is not in a list of allowed values {'EMS-002 RAPID IMMERSION FREEZER', 'BAL-TEC HPM 010', 'LEICA EM PACT2', 'OTHER', 'LEICA EM PACT', 'LEICA EM HPM100'} so OTHER is written into the XML file. |
切片作成 | 集束イオンビーム - 装置: OTHER / 集束イオンビーム - イオン: OTHER / 集束イオンビーム - 電圧: 30 / 集束イオンビーム - 電流: 1 / 集束イオンビーム - 時間: 1800 / 集束イオンビーム - 温度: 100 K / 集束イオンビーム - Initial thickness: 100000 / 集束イオンビーム - 最終 厚さ: 250 集束イオンビーム - 詳細: The value given for _em_focused_ion_beam.instrument is FEI Helios G4 UX. This is not in a list of allowed values {'DB235', 'OTHER'} so OTHER is written into the XML file. |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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特殊光学系 | エネルギーフィルター - 名称: GIF Bioquantum / エネルギーフィルター - スリット幅: 20 eV |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 QUANTUM (4k x 4k) 検出モード: COUNTING / 平均電子線量: 1.5 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 4.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 4.0 µm / 倍率(公称値): 19500 |
試料ステージ | 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER ホルダー冷却材: NITROGEN |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
最終 再構成 | アルゴリズム: BACK PROJECTION / ソフトウェア - 名称: ![]() |
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