ChemComp-DUN: 2'-DEOXYURIDINE 5'-ALPHA,BETA-IMIDO-DIPHOSPHATE

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: DUN
• 名称: 名称: 2'-deoxyuridine 5'-alpha,beta-imido-diphosphate; 別称: 2,4(1H,3H)-PYRIMIDINEDIONE; 1-[2-DEOXY-5-O-[HYDROXY(PHOSPHONOAMINO)PHOSPHINYL]-BETA-D-ERYTHRO-PENTOFURANOSYL]-

Chemical information

組成

組成式: C₉H₁₅N₃O₁₀P₂ / 原子数: 39 / 化学式量: 387.177 / 形式電荷: 0

その他

1w2y

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: DUN / モデル座標のPDB-ID: 1W2Y

履歴

作成	2004年7月9日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2019年12月17日
Modify synonyms	2020年1月26日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / CompTox / DrugBank / PubChem / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=P(O)(O)NP(=O)(O)OCC2OC(N1C(=O)NC(=O)C=C1)CC2O
• CACTVS 3.341: O[CH]1C[CH](O[CH]1CO[P](O)(=O)N[P](O)(O)=O)N2C=CC(=O)NC2=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1C(C(OC1N2C=CC(=O)NC2=O)COP(=O)(NP(=O)(O)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: O[C@H]1C[C@@H](O[C@@H]1CO[P@@](O)(=O)N[P](O)(O)=O)N2C=CC(=O)NC2=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1[C@@H]([C@H](O[C@H]1N2C=CC(=O)NC2=O)CO[P@@](=O)(NP(=O)(O)O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C9H15N3O10P2/c13-5-3-8(12-2-1-7(14)10-9(12)15)22-6(5)4-21-24(19,20)11-23(16,17)18/h1-2,5-6,8,13H,3-4H2,(H,10,14,15)(H4,11,16,17,18,19,20)/t5-,6+,8+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: COFNIXBQVWFHTR-SHYZEUOFSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy(phosphonoamino)phosphoryl]uridine
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [[[(2R,3S,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3-hydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]amino]phosphonic acid

PDBエントリ

全4件を表示しています

PDB-1w2y:
The crystal structure of a complex of Campylobacter jejuni dUTPase with substrate analogue dUpNHp

PDB-2cje:
THE CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX OF Leishmania major DUTPASE WITH SUBSTRATE ANALOGUE DUPNHP

PDB-4dk4:
Crystal Structure of Trypanosoma brucei dUTPase with dUpNp, Ca2+ and Na+

PDB-4dkb:
Crystal Structure of Trypanosoma brucei dUTPase with dUpNp and Ca2+