ChemComp-DO8: 3-deoxy-8-O-phosphono-alpha-D-manno-oct-2-ulopyranosonic acid

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: DO8
• 名称: 名称: 3-deoxy-8-O-phosphono-alpha-D-manno-oct-2-ulopyranosonic acid; 別称: 3-DEOXY-D-MANNO-2-OCTULOSONATE-8-PHOSPHATE; 3-deoxy-8-O-phosphono-alpha-D-manno-oct-2-ulosonic acid;; 日化辞名称: (2R)-2,4β,5β-トリヒドロキシ-6β-[(R)-1-ヒドロキシ-2-(ホスホノオキシ)エチル]テトラヒドロ-(以下略)

Chemical information

組成

組成式: C₈H₁₅O₁₁P / 原子数: 35 / 化学式量: 318.172 / 形式電荷: 0

その他

KDO

タイプ: D-saccharide, alpha linking / PDB分類: ATOMS / 3文字コード: DO8 / 親要素: KDO

履歴

作成	2004年8月18日
記述子を修正	2011年6月4日
Other modification	2020年7月3日
Modify parent residue	2020年7月17日
Modify name	2020年7月17日
Modify synonyms	2020年7月17日
Modify internal type	2020年7月17日
Modify linking type	2020年7月17日
Modify atom id	2020年7月17日
Modify component atom id	2020年7月17日
Modify leaving atom flag	2020年7月17日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / ChEBI / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=P(O)(O)OCC(O)C1OC(O)(C(=O)O)CC(O)C1O
• CACTVS 3.341: O[CH](CO[P](O)(O)=O)[CH]1O[C](O)(C[CH](O)[CH]1O)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1C(C(C(OC1(C(=O)O)O)C(COP(=O)(O)O)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: O[C@H](CO[P](O)(O)=O)[C@H]1O[C@](O)(C[C@@H](O)[C@H]1O)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1[C@H]([C@H]([C@H](O[C@]1(C(=O)O)O)[C@@H](COP(=O)(O)O)O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C8H15O11P/c9-3-1-8(14,7(12)13)19-6(5(3)11)4(10)2-18-20(15,16)17/h3-6,9-11,14H,1-2H2,(H,12,13)(H2,15,16,17)/t3-,4-,5-,6-,8-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: IZZNRKJLBIYBJN-HXUQBWEZSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 3-deoxy-8-O-phosphono-alpha-D-manno-oct-2-ulopyranosonic acid
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: (2R,4R,5R,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-[(1R)-1-hydroxy-2-phosphonooxy-ethyl]oxane-2-carboxylic acid

PDBエントリ

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PDB-1x6u:
KDO8P synthase in it's binary complex with the product KDO8P