ChemComp-DM6: 4'-EPIDOXORUBICIN

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: DM6
• 名称: 名称: 4'-epidoxorubicin / 別称: 4'-EPIADRIAMYCIN
• コメント: 薬剤, 化学療法薬*YM

Chemical information

組成

組成式: C₂₇H₃₀NO₁₁ / 原子数: 69 / 化学式量: 544.527 / 形式電荷: 1

その他

1d54

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAD / 3文字コード: DM6 / モデル座標のPDB-ID: 1D54

履歴

作成	1999年7月8日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2021年3月1日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / ChEBI / Metabolights / PubChem / SureChEMBL / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C2c1c(O)c5c(c(O)c1C(=O)c3cccc(OC)c23)CC(O)(C(=O)CO)CC5OC4OC(C(O)C(C4)[NH3+])C
• CACTVS 3.341: COc1cccc2C(=O)c3c(O)c4C[C](O)(C[CH](O[CH]5C[CH]([NH3+])[CH](O)[CH](C)O5)c4c(O)c3C(=O)c12)C(=O)CO
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CC1C(C(CC(O1)OC2CC(Cc3c2c(c4c(c3O)C(=O)c5cccc(c5C4=O)OC)O)(C(=O)CO)O)[NH3+])O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: COc1cccc2C(=O)c3c(O)c4C[C@](O)(C[C@H](O[C@H]5C[C@H]([NH3+])[C@@H](O)[C@H](C)O5)c4c(O)c3C(=O)c12)C(=O)CO
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C[C@H]1[C@@H]([C@H](C[C@@H](O1)O[C@H]2C[C@@](Cc3c2c(c4c(c3O)C(=O)c5cccc(c5C4=O)OC)O)(C(=O)CO)O)[NH3+])O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C27H29NO11/c1-10-22(31)13(28)6-17(38-10)39-15-8-27(36,16(30)9-29)7-12-19(15)26(35)21-20(24(12)33)23(32)11-4-3-5-14(37-2)18(11)25(21)34/h3-5,10,13,15,17,22,29,31,33,35-36H,6-9,28H2,1-2H3/p+1/t10-,13-,15-,17-,22-,27-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: AOJJSUZBOXZQNB-VTZDEGQISA-O

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: (1S,3S)-3,5,12-trihydroxy-3-(hydroxyacetyl)-10-methoxy-6,11-dioxo-1,2,3,4,6,11-hexahydrotetracen-1-yl 3-ammonio-2,3,6-trideoxy-alpha-L-arabino-hexopyranoside
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2S,3R,4S,6R)-3-hydroxy-2-methyl-6-[[(1S,3S)-3,5,12-trihydroxy-3-(2-hydroxyethanoyl)-10-methoxy-6,11-dioxo-2,4-dihydro-1H-tetracen-1-yl]oxy]oxan-4-yl]azanium

PDBエントリ

全6件を表示しています

PDB-1d15:
TERNARY INTERACTIONS OF SPERMINE WITH DNA: 4'-EPIADRIAMYCIN AND OTHER DNA: ANTHRACYCLINE COMPLEXES

PDB-1d54:
ANTHRACYCLINE BINDING TO DNA: HIGH RESOLUTION STRUCTURE OF D(TGTACA) COMPLEXED WITH 4'-EPIADRIAMYCIN

PDB-1d58:
THE MOLECULAR STRUCTURE OF A 4'-EPIADRIAMYCIN COMPLEX WITH D(TGATCA) AT 1.7 ANGSTROM RESOLUTION-COMPARISON WITH THE STRUCTURE OF 4'-EPIADRIAMYCIN D(TGTACA) AND D(CGATCG) COMPLEXES

PDB-1qda:
Crystal structure of epidoxorubicin-formaldehyde virtual crosslink of DNA

PDB-6kxz:
HUMAN PARALLEL STRANDED 7-MER G-QUADRUPLEX COMPLEXED WITH 2 EPIRUBICIN (EPI) MOLECULES

PDB-7cps:
A 2:1 stoichiometric complex of anticancer drug 4'-Epiadriamycin bound to parallel G-quadruplex DNA [d-(TTGGGGT)]4.