ChemComp-DDN: 3,4-DIHYDRO-2'-DEOXYURIDINE-5'-MONOPHOSPHATE

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: DDN
• 名称: 名称: 3,4-dihydro-2'-deoxyuridine-5'-monophosphate; 別称: ((2R,3S,5R)-3-HYDROXY-5-(4-HYDROXY-2-OXO-3,4-DIHYDROPYRIMIDIN-1(2H)-YL)-TETRAHYDROFURAN-2-YL)METHYL DIHYDROGEN PHOSPHATE

Chemical information

組成

組成式: C₉H₁₅N₂O₈P / 原子数: 35 / 化学式量: 310.198 / 形式電荷: 0

その他

1vq2

DU

タイプ: DNA LINKING / PDB分類: ATOMN / 1文字コード: U / 3文字コード: DDN / モデル座標のPDB-ID: 1VQ2 / 親要素: DU

履歴

作成	2004年12月14日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2021年3月13日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / DrugBank / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C1NC(O)C=CN1C2OC(C(O)C2)COP(=O)(O)O
• CACTVS 3.341: O[CH]1C[CH](O[CH]1CO[P](O)(O)=O)N2C=C[CH](O)NC2=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1C(C(OC1N2C=CC(NC2=O)O)COP(=O)(O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: O[C@H]1C[C@@H](O[C@@H]1CO[P](O)(O)=O)N2C=C[C@@H](O)NC2=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1[C@@H]([C@H](O[C@H]1N2C=C[C@H](NC2=O)O)COP(=O)(O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C9H15N2O8P/c12-5-3-8(11-2-1-7(13)10-9(11)14)19-6(5)4-18-20(15,16)17/h1-2,5-8,12-13H,3-4H2,(H,10,14)(H2,15,16,17)/t5-,6+,7+,8+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: ILSIYJVILUIVPM-LXGUWJNJSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: (4R)-1-(2-deoxy-5-O-phosphono-beta-D-erythro-pentofuranosyl)-4-hydroxy-3,4-dihydropyrimidin-2(1H)-one
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-[(4R)-4-hydroxy-2-oxo-3,4-dihydropyrimidin-1-yl]oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-1vq2:
CRYSTAL STRUCTURE OF T4-BACTERIOPHAGE DEOXYCYTIDYLATE DEAMINASE, MUTANT R115E

PDB-2hvw:
Crystal structure of dCMP deaminase from Streptococcus mutans