ChemComp-DCF: 2'-DEOXYCOFORMYCIN

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: DCF
• 名称: 名称: 2'-deoxycoformycin / 日化辞名称: ペントスタチン
• コメント: 抗がん剤*YM

Chemical information

組成

組成式: C₁₁H₁₆N₄O₄ / 原子数: 35 / 化学式量: 268.269 / 形式電荷: 0

その他

1a4l

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: DCF / モデル座標のPDB-ID: 1A4L

履歴

作成	1999年7月8日
記述子を修正	2011年6月4日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: n2c1c(N=CNCC1O)n(c2)C3OC(C(O)C3)CO
• CACTVS 3.341: OC[CH]1O[CH](C[CH]1O)n2cnc3[CH](O)CNC=Nc23
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc2c(n1C3CC(C(O3)CO)O)N=CNCC2O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: OC[C@H]1O[C@H](C[C@@H]1O)n2cnc3[C@H](O)CNC=Nc23
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc2c(n1[C@H]3C[C@@H]([C@H](O3)CO)O)N=CNC[C@H]2O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C11H16N4O4/c16-3-8-6(17)1-9(19-8)15-5-14-10-7(18)2-12-4-13-11(10)15/h4-9,16-18H,1-3H2,(H,12,13)/t6-,7+,8+,9+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: FPVKHBSQESCIEP-JQCXWYLXSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: (8R)-3-(2-deoxy-beta-D-erythro-pentofuranosyl)-3,6,7,8-tetrahydroimidazo[4,5-d][1,3]diazepin-8-ol
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: (8R)-3-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-7,8-dihydro-6H-imidazo[4,5-f][1,3]diazepin-8-ol

PDBエントリ

全6件を表示しています

PDB-1a4l:
ADA STRUCTURE COMPLEXED WITH DEOXYCOFORMYCIN AT PH 7.0

PDB-2pgr:
Crystal structure of adenosine deaminase from Plasmodium vivax in complex with pentostatin

PDB-6n91:
Crystal Structure of Adenosine Deaminase from Vibrio cholerae Complexed with Pentostatin (Deoxycoformycin)

PDB-6n9m:
Crystal Structure of Adenosine Deaminase from Salmonella typhimurium with Pentostatin (Deoxycoformycin)

PDB-9ntg:
Helix pomatia AMP deaminase (HPAMPD) in complex with Pentostatin

PDB-9ntj:
Chimeric Adenosine deaminase growth factor (ADGF) in complex with pentostatin