ChemComp-YML: [(3R,4S,5S,7R)-4,8-DIHYDROXY-3,5,7-TRIMETHYL-2-OXOOCTYL]PHOSPHONI...

IDまたはキーワード:

登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: YML
名称	名称: [(3R,4S,5S,7R)-4,8-dihydroxy-3,5,7-trimethyl-2-oxooctyl]phosphonic acid

組成

組成式: C₁₁H₂₃O₅P / 原子数: 40 / 化学式量: 266.271 / 形式電荷: 0

その他

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: YML

履歴

作成	2006年6月26日
記述子を修正	2011年6月4日

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構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ACDLabs 10.04	O=C(C(C(O)C(C)CC(C)CO)C)CP(=O)O
CACTVS 3.341	C[CH](CO)C[CH](C)[CH](O)[CH](C)C(=O)C[PH](O)=O
OpenEye OEToolkits 1.5.0	CC(CC(C)C(C(C)C(=O)CP(=O)O)O)CO

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CACTVS 3.341	C[C@@H](CO)C[C@H](C)[C@H](O)[C@@H](C)C(=O)C[P@@H](O)=O
OpenEye OEToolkits 1.5.0	C[C@H](C[C@H](C)[C@@H]([C@@H](C)C(=O)C[P@H](=O)O)O)CO

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InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C11H23O5P/c1-7(5-12)4-8(2)11(14)9(3)10(13)6-17(15)16/h7-9,11-12,14,17H,4-6H2,1-3H3,(H,15,16)/t7-,8+,9+,11+/m1/s1

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InChIKey

InChI 1.03	OMENZZONRIXNPG-HJGDQZAQSA-N

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SYSTEMATIC NAME

ACDLabs 10.04	(R)-[(3R,4S,5S,7R)-4,8-dihydroxy-3,5,7-trimethyl-2-oxooctyl]phosphinic acid
OpenEye OEToolkits 1.5.0	[(3R,4S,5S,7R)-4,8-dihydroxy-3,5,7-trimethyl-2-oxo-octyl]phosphinic acid

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PDB-2hfj:
Pikromycin thioesterase with covalent pentaketide affinity label

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
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関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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