ChemComp-XAH: 5'-O-{(R)-hydroxy[(L-lysylamino)oxy]phosphoryl}adenosine

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: XAH
• 名称: 名称: 5'-O-{(R)-hydroxy[(L-lysylamino)oxy]phosphoryl}adenosine

Chemical information

組成

組成式: C₁₆H₂₇N₈O₈P / 原子数: 60 / 化学式量: 490.408 / 形式電荷: 0

その他

3e9i

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: XAH / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3E9I

履歴

作成	2008年8月27日
aromatic_flag"を修正	2011年6月4日
記述子を修正	2011年6月4日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=P(O)(ONC(=O)C(N)CCCCN)OCC3OC(n2cnc1c(ncnc12)N)C(O)C3O
• CACTVS 3.341: NCCCC[CH](N)C(=O)NO[P](O)(=O)OC[CH]1O[CH]([CH](O)[CH]1O)n2cnc3c(N)ncnc23
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc(c2c(n1)n(cn2)C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)ONC(=O)C(CCCCN)N)O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: NCCCC[C@H](N)C(=O)NO[P@@](O)(=O)OC[C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1O)n2cnc3c(N)ncnc23
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc(c2c(n1)n(cn2)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CO[P@@](=O)(O)ONC(=O)[C@H](CCCCN)N)O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C16H27N8O8P/c17-4-2-1-3-8(18)15(27)23-32-33(28,29)30-5-9-11(25)12(26)16(31-9)24-7-22-10-13(19)20-6-21-14(10)24/h6-9,11-12,16,25-26H,1-5,17-18H2,(H,23,27)(H,28,29)(H2,19,20,21)/t8-,9+,11+,12+,16+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: UZJSLDPAROCUBS-LEJQEAHTSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 5'-O-{(R)-hydroxy[(L-lysylamino)oxy]phosphoryl}adenosine
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methyl [[(2S)-2,6-diaminohexanoyl]amino] hydrogen phosphate

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-3e9i:
Lysyl-tRNA synthetase from Bacillus stearothermophilus complexed with L-Lysine hydroxamate-AMP