ChemComp-V5X: (2R)-N~8~-HYDROXY-2-{[(5-METHOXY-2-METHYL-1H-INDOL-3-YL)ACETYL]AM...

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登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: V5X
名称	名称: (2R)-N~8~-hydroxy-2-{[(5-methoxy-2-methyl-1H-indol-3-yl)acetyl]amino}-N~1~-[2-(2-phenyl-1H-indol-3-yl)ethyl]octanediamide

組成

組成式: C₃₆H₄₁N₅O₅ / 原子数: 87 / 化学式量: 623.741 / 形式電荷: 0

その他

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: V5X / 理論座標の詳細: Corina

履歴

作成	2007年7月12日
aromatic_flag"を修正	2011年6月4日
記述子を修正	2011年6月4日

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構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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SMILES

ACDLabs 10.04	O=C(NCCc3c1ccccc1nc3c2ccccc2)C(NC(=O)Cc5c4cc(OC)ccc4nc5C)CCCCCC(=O)NO
CACTVS 3.341	COc1ccc2[nH]c(C)c(CC(=O)N[CH](CCCCCC(=O)NO)C(=O)NCCc3c([nH]c4ccccc34)c5ccccc5)c2c1
OpenEye OEToolkits 1.5.0	Cc1c(c2cc(ccc2[nH]1)OC)CC(=O)NC(CCCCCC(=O)NO)C(=O)NCCc3c4ccccc4[nH]c3c5ccccc5

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SMILES CANONICAL

CACTVS 3.341	COc1ccc2[nH]c(C)c(CC(=O)N[C@H](CCCCCC(=O)NO)C(=O)NCCc3c([nH]c4ccccc34)c5ccccc5)c2c1
OpenEye OEToolkits 1.5.0	Cc1c(c2cc(ccc2[nH]1)OC)CC(=O)N[C@H](CCCCCC(=O)NO)C(=O)NCCc3c4ccccc4[nH]c3c5ccccc5

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InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C36H41N5O5/c1-23-28(29-21-25(46-2)17-18-31(29)38-23)22-34(43)39-32(15-7-4-8-16-33(42)41-45)36(44)37-20-19-27-26-13-9-10-14-30(26)40-35(27)24-11-5-3-6-12-24/h3,5-6,9-14,17-18,21,32,38,40,45H,4,7-8,15-16,19-20,22H2,1-2H3,(H,37,44)(H,39,43)(H,41,42)/t32-/m1/s1

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InChIKey

InChI 1.03	VBWCMILVHANAGG-JGCGQSQUSA-N

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SYSTEMATIC NAME

ACDLabs 10.04	(2R)-N~8~-hydroxy-2-{[(5-methoxy-2-methyl-1H-indol-3-yl)acetyl]amino}-N~1~-[2-(2-phenyl-1H-indol-3-yl)ethyl]octanediamide
OpenEye OEToolkits 1.5.0	(2R)-N'-hydroxy-2-[2-(5-methoxy-2-methyl-1H-indol-3-yl)ethanoylamino]-N-[2-(2-phenyl-1H-indol-3-yl)ethyl]octanediamide

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PDB-2v5x:
Crystal structure of HDAC8-inhibitor complex

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbjlc1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

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関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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