ChemComp-UDZ: [(2R,3S,4R,5R,6R)-5-acetamido-6-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-[2,4-bis(oxida...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: UDZ
• 名称: 名称: [(2R,3S,4R,5R,6R)-5-acetamido-6-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3,4-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methylimino-azanylidene-azanium

Chemical information

組成

組成式: C₁₇H₂₇N₆O₁₆P₂ / 原子数: 68 / 化学式量: 633.374 / 形式電荷: 1

その他

3w1v

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: UDZ / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3W1V

履歴

作成	2012年11月30日
公開	2013年6月12日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C1C=CN(C(=O)N1)C2OC(C(O)C2O)COP(=O)(OP(=O)(OC3OC(C(O)C(O)C3NC(=O)C)C/N=[N+]=[N@H])O)O
• CACTVS 3.370: CC(=O)N[CH]1[CH](O)[CH](O)[CH](CN=[N+]=N)O[CH]1O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]2O[CH]([CH](O)[CH]2O)N3C=CC(=O)NC3=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: CC(=O)NC1C(C(C(OC1OP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2C(C(C(O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O)CN=[N+]=N)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: CC(=O)N[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN=[N+]=N)O[C@@H]1O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O)[C@@H]2O)N3C=CC(=O)NC3=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: CC(=O)N[C@@H]1[C@H]([C@@H]([C@H](O[C@@H]1OP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H]2[C@H]([C@H]([C@@H](O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O)CN=[N+]=N)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C17H26N6O16P2/c1-6(24)20-10-13(28)11(26)7(4-19-22-18)37-16(10)38-41(33,34)39-40(31,32)35-5-8-12(27)14(29)15(36-8)23-3-2-9(25)21-17(23)30/h2-3,7-8,10-16,18,26-29H,4-5H2,1H3,(H3-,20,21,24,25,30,31,32,33,34)/p+1/t7-,8-,10-,11-,12-,13-,14-,15-,16-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: JRORMXITLCSMOP-CFRASDGPSA-O

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 1-{[(2R,3S,4R,5R,6R)-5-(acetylamino)-6-{[(S)-{[(S)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-3,4-dihydroxytetrahydro-2H-pyran-2-yl]methyl}triaza-1,2-dien-2-ium (non-preferred name)
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: [(2R,3S,4R,5R,6R)-5-acetamido-6-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3,4-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methylimino-azanylidene-azanium

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-3w1v:
Crystal Structure of Capsular Polysaccharide Synthesizing Enzyme CapE from Staphylococcus aureus in complex with inihibitor