ChemComp-UD4: UDP-2-acetamido-4-amino-2,4,6-trideoxy-alpha-D-glucopyranose

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: UD4
• 名称: 名称: udp-2-acetamido-4-amino-2,4,6-trideoxy-alpha-D-glucopyranose; 別称: (2R,3R,4S,5S,6R)-3-(acetylamino)-5-amino-4-hydroxy-6-methyltetrahydro-2H-pyran-2-yl; 日化辞名称: ウリジン5′-二りん酸β-[2-(アセチルアミノ)-4-アミノ-2,4,6-トリデオキシ-α-D-グルコピラノシル]

Chemical information

組成

組成式: C₁₇H₂₈N₄O₁₅P₂ / 原子数: 66 / 化学式量: 590.37 / 形式電荷: 0

その他

3bss

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: UD4 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3BSS

履歴

作成	2008年5月21日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2021年3月13日

• 外部リンク: UniChem / Brenda / ChEBI / KEGG_Ligand / 日化辞 / PubChem / ZINC / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=P(OC1OC(C(N)C(O)C1NC(=O)C)C)(O)OP(=O)(O)OCC3OC(N2C=CC(=O)NC2=O)C(O)C3O
• CACTVS 3.341: C[CH]1O[CH](O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]2O[CH]([CH](O)[CH]2O)N3C=CC(=O)NC3=O)[CH](NC(C)=O)[CH](O)[CH]1N
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CC1C(C(C(C(O1)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2C(C(C(O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O)NC(=O)C)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: C[C@H]1O[C@H](O[P@](O)(=O)O[P@@](O)(=O)OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O)[C@@H]2O)N3C=CC(=O)NC3=O)[C@H](NC(C)=O)[C@@H](O)[C@@H]1N
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C[C@@H]1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@H](O1)O[P@@](=O)(O)O[P@](=O)(O)OC[C@@H]2[C@H]([C@H]([C@@H](O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O)NC(=O)C)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C17H28N4O15P2/c1-6-10(18)13(25)11(19-7(2)22)16(33-6)35-38(30,31)36-37(28,29)32-5-8-12(24)14(26)15(34-8)21-4-3-9(23)20-17(21)27/h3-4,6,8,10-16,24-26H,5,18H2,1-2H3,(H,19,22)(H,28,29)(H,30,31)(H,20,23,27)/t6-,8-,10-,11-,12-,13+,14-,15-,16-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: FUUMLYWEEZBCQR-UINYWEPJSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: (2R,3R,4S,5S,6R)-3-(acetylamino)-5-amino-4-hydroxy-6-methyltetrahydro-2H-pyran-2-yl [(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name)
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2R,3R,4S,5S,6R)-3-acetamido-5-amino-4-hydroxy-6-methyl-oxan-2-yl] [[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl] hydrogen phosphate

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-3bss:
PglD from Campylobacter jejuni, NCTC 11168, with native substrate

PDB-7l81:
x-ray structure of the psychrobacter cryohalolentis N-acetyltransferase Pcryo_0637 in the presence of coenzyme A and