ChemComp-SGT: 2-amino-9-{2-deoxy-5-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)pho...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: SGT
• 名称: 名称: 2-amino-9-{2-deoxy-5-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-D-erythro-pentofuranosyl}-1,9-dihydro-6H-purine-6-thione; 日化辞名称: 2′-デオキシ-6-チオグアノシン5′-三りん酸

Chemical information

組成

組成式: C₁₀H₁₆N₅O₁₂P₃S / 原子数: 47 / 化学式量: 523.247 / 形式電荷: 0

その他

5wnx

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: SGT / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 5WNX

履歴

作成	2017年8月3日
公開	2017年9月13日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / CompTox / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / SureChEMBL / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: P(=O)(O)(O)OP(OP(=O)(O)OCC1OC(CC1O)n2cnc3C(=S)NC(=Nc23)N)(O)=O
• CACTVS 3.385: NC1=Nc2n(cnc2C(=S)N1)[CH]3C[CH](O)[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)O3
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: c1nc2c(n1C3CC(C(O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)N=C(NC2=S)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: NC1=Nc2n(cnc2C(=S)N1)[C@H]3C[C@H](O)[C@@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)O3
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: c1nc2c(n1[C@H]3C[C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)N=C(NC2=S)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C10H16N5O12P3S/c11-10-13-8-7(9(31)14-10)12-3-15(8)6-1-4(16)5(25-6)2-24-29(20,21)27-30(22,23)26-28(17,18)19/h3-6,16H,1-2H2,(H,20,21)(H,22,23)(H2,17,18,19)(H3,11,13,14,31)/t4-,5+,6+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: BXZRFHUVVWIHMV-KVQBGUIXSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 2-amino-9-{2-deoxy-5-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-D-erythro-pentofuranosyl}-1,9-dihydro-6H-purine-6-thione
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: [[(2~{R},3~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-sulfanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-5wnx:
DNA polymerase beta substrate complex with incoming 6-TdGTP