ChemComp-SCG: Secologanin

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: SCG
• 名称: 名称: Secologanin; 別称: METHYL (2S,3R,4S)-2-(BETA-D-GLUCOPYRANOSYLOXY)-4-(2-OXOETHYL)-3-VINYL-3,4-DIHYDRO-2H-PYRAN-5-CARBOXYLATE; 日化辞名称: セコロガニン
• コメント: alkaloid*YM

Chemical information

組成

組成式: C₁₇H₂₄O₁₀ / 原子数: 51 / 化学式量: 388.366 / 形式電荷: 0

その他

2fpc

タイプ: D-saccharide / PDB分類: ATOMS / 3文字コード: SCG / モデル座標のPDB-ID: 2FPC

履歴

作成	2006年1月19日
記述子を修正	2011年6月4日
Other modification	2020年7月3日
Modify name	2020年7月17日
Modify synonyms	2020年7月17日
Modify linking type	2020年7月17日
Modify atom id	2020年7月17日
Modify component atom id	2020年7月17日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=CCC2C(C(=O)OC)=COC(OC1OC(C(O)C(O)C1O)CO)C2\C=C
• CACTVS 3.341: COC(=O)C1=CO[CH](O[CH]2O[CH](CO)[CH](O)[CH](O)[CH]2O)[CH](C=C)[CH]1CC=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: COC(=O)C1=COC(C(C1CC=O)C=C)OC2C(C(C(C(O2)CO)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: COC(=O)C1=CO[C@@H](O[C@@H]2O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]2O)[C@H](C=C)[C@@H]1CC=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: COC(=O)C1=CO[C@H]([C@@H]([C@@H]1CC=O)C=C)O[C@H]2[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O2)CO)O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C17H24O10/c1-3-8-9(4-5-18)10(15(23)24-2)7-25-16(8)27-17-14(22)13(21)12(20)11(6-19)26-17/h3,5,7-9,11-14,16-17,19-22H,1,4,6H2,2H3/t8-,9+,11-,12-,13+,14-,16+,17+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: CSKKDSFETGLMSB-NRZPKYKESA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: methyl (2S,3R,4S)-3-ethenyl-2-(beta-D-glucopyranosyloxy)-4-(2-oxoethyl)-3,4-dihydro-2H-pyran-5-carboxylate
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: methyl

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-2fpc:
Structure of Strictosidine Synthase, the Biosynthetic Entry to the Monoterpenoid Indole Alkaloid Family

PDB-3u5y:
Structures of Alkaloid Biosynthetic Glucosidases Decode Substrate Specificity