ChemComp-S00: N-(benzylsulfonyl)-3-cyclohexyl-D-alanyl-N-(4-carbamimidoylbenzyl...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: S00
• 名称: 名称: N-(benzylsulfonyl)-3-cyclohexyl-D-alanyl-N-(4-carbamimidoylbenzyl)-L-prolinamide

BIRD information

• タイプ: ペプチド様 / トロンビン阻害剤
• ダウンロード: Molecular definition / Chemical definition / Family definition

別称

• MI003 (PDB)

Annotation

• 分子機能: inhibitor of Thrombin, EC: 3.4.21.5EC: inhibitor of Thrombin, EC: 3.4.21.5 / 情報源: DOI:10.2210/pdb3rm2/pdb

External info

• PubChem: 46899736

Family

X-Pro-Aminomethyl-benzenecarboximidamide-containing inhibitor

N-(BENZYLSULFONYL)GLYCYL-N-(4-CARBAMIMIDOYLBENZYL)-L-PROLINAMIDE / N-(BENZYLSULFONYL)-D-ALANYL-N-(4-CARBAMIMIDOYLBENZYL)-L-PROLINAMIDE / N-(BENZYLSULFONYL)-D-VALYL-N-(4-CARBAMIMIDOYLBENZYL)-L-PROLINAMIDE / N-(BENZYLSULFONYL)-3-CYCLOHEXYL-D-ALANYL-N-(4-CARBAMIMIDOYLBENZYL)-L-PROLINAMIDE / (2S)-1-[(2R)-2-(BENZYLSULFONYLAMINO)-5-GUANIDINO-PENTANOYL]-N-[(4-CARBAMIMIDOYLPHENYL)METHYL]PYRROLIDINE-2-CARBOXAMIDE / N-(BENZYLSULFONYL)-D-LEUCYL-N-(4-CARBAMIMIDOYLBENZYL)-L-PROLINAMIDE

Chemical information

組成

組成式: C₂₉H₃₉N₅O₄S / 原子数: 78 / 化学式量: 553.716 / 形式電荷: 0

その他

3rm2

PMS

ZAL

PRO

00S

タイプ: peptide-like / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: S00 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3RM2 / 子要素: PMS, ZAL, PRO, 00S

履歴

作成	2011年4月25日
Modify subcomponent list	2011年5月5日
aromatic_flag"を修正	2011年6月4日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: BindingDB / UniChem / Brenda / ChEMBL / PubChem / PubChem_TPharma / SureChEMBL / ZINC / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C(NCc1ccc(C(=[N@H])N)cc1)C4N(C(=O)C(NS(=O)(=O)Cc2ccccc2)CC3CCCCC3)CCC4
• CACTVS 3.370: NC(=N)c1ccc(CNC(=O)[CH]2CCCN2C(=O)[CH](CC3CCCCC3)N[S](=O)(=O)Cc4ccccc4)cc1
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: c1ccc(cc1)CS(=O)(=O)NC(CC2CCCCC2)C(=O)N3CCCC3C(=O)NCc4ccc(cc4)C(=N)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: NC(=N)c1ccc(CNC(=O)[C@@H]2CCCN2C(=O)[C@@H](CC3CCCCC3)N[S](=O)(=O)Cc4ccccc4)cc1
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: [H]/N=C(/c1ccc(cc1)CNC(=O)[C@@H]2CCCN2C(=O)[C@@H](CC3CCCCC3)NS(=O)(=O)Cc4ccccc4)\\N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C29H39N5O4S/c30-27(31)24-15-13-22(14-16-24)19-32-28(35)26-12-7-17-34(26)29(36)25(18-21-8-3-1-4-9-21)33-39(37,38)20-23-10-5-2-6-11-23/h2,5-6,10-11,13-16,21,25-26,33H,1,3-4,7-9,12,17-20H2,(H3,30,31)(H,32,35)/t25-,26+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: DJNNZKJZFCRFRX-FTJBHMTQSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: N-(benzylsulfonyl)-3-cyclohexyl-D-alanyl-N-(4-carbamimidoylbenzyl)-L-prolinamide
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: (2S)-N-[(4-carbamimidoylphenyl)methyl]-1-[(2R)-3-cyclohexyl-2-[(phenylmethyl)sulfonylamino]propanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-3rm2:
Human Thrombin in complex with MI003