ChemComp-Q1V: 2-amino-3-[(R)-{[(3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: Q1V
• 名称: 名称: 2-amino-3-[(R)-{[(3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)-4-hydroxyoxolan-3-yl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-1-[(S)-{[(3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)-4-hydroxyoxolan-3-yl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-1H-imidazol-3-ium

Chemical information

組成

組成式: C₂₁H₂₆N₁₃O₁₂P₂ / 原子数: 74 / 化学式量: 714.459 / 形式電荷: 1

その他

6u8u

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: Q1V / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 6U8U

履歴

作成	2019年9月6日
公開	2020年12月9日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: OP([n+]4c(n(P(O)(OC1COC(C1O)n2c3c(nc2)C(NC(N)=N3)=O)=O)cc4)N)(OC5C(C(OC5)n7c6N=C(N)NC(=O)c6nc7)O)=O
• CACTVS 3.385: NC1=Nc2n(cnc2C(=O)N1)[CH]3OC[CH](O[P](O)(=O)n4cc[n+](c4N)[P](O)(=O)O[CH]5CO[CH]([CH]5O)n6cnc7C(=O)NC(=Nc67)N)[CH]3O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: c1c[n+](c(n1P(=O)(O)OC2COC(C2O)n3cnc4c3N=C(NC4=O)N)N)P(=O)(O)OC5COC(C5O)n6cnc7c6N=C(NC7=O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: NC1=Nc2n(cnc2C(=O)N1)[C@@H]3OC[C@H](O[P](O)(=O)n4cc[n+](c4N)[P](O)(=O)O[C@H]5CO[C@H]([C@@H]5O)n6cnc7C(=O)NC(=Nc67)N)[C@H]3O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: c1c[n+](c(n1P(=O)(O)O[C@H]2CO[C@H]([C@@H]2O)n3cnc4c3N=C(NC4=O)N)N)P(=O)(O)O[C@H]5CO[C@H]([C@@H]5O)n6cnc7c6N=C(NC7=O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C21H25N13O12P2/c22-19-27-13-9(15(37)29-19)25-5-31(13)17-11(35)7(3-43-17)45-47(39,40)33-1-2-34(21(33)24)48(41,42)46-8-4-44-18(12(8)36)32-6-26-10-14(32)28-20(23)30-16(10)38/h1-2,5-8,11-12,17-18,24,35-36H,3-4H2,(H8,22,23,27,28,29,30,37,38,39,40,41,42)/p+1/t7-,8-,11+,12+,17+,18+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: ZVPUVGSJWNSRDP-QIHYXNHISA-O

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 2-amino-3-[(R)-{[(3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)-4-hydroxyoxolan-3-yl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-1-[(S)-{[(3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)-4-hydroxyoxolan-3-yl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-1H-imidazol-3-ium
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: [2-azanyl-3-[[(3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-4-oxidanyl-oxolan-3-yl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]imidazol-1-ium-1-yl]-[(3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-4-oxidanyl-oxolan-3-yl]oxy-phosphinic acid

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-6u8u:
RNA duplex bound with TNA 3'-3' imidazolium dimer