ChemComp-OOB: 5'-O-[(R)-(benzoyloxy)(hydroxy)phosphoryl]adenosine

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: OOB
• 名称: 名称: 5'-O-[(R)-(benzoyloxy)(hydroxy)phosphoryl]adenosine / 日化辞名称: 5′-アデニル酸ベンゾイル

Chemical information

組成

組成式: C₁₇H₁₈N₅O₈P / 原子数: 49 / 化学式量: 451.327 / 形式電荷: 0

その他

4zjz

タイプ: RNA OH 5 prime terminus / PDB分類: ATOMN / 3文字コード: OOB / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4ZJZ

履歴

作成	2015年5月4日
公開	2015年9月30日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / ChEBI / KEGG_Ligand / 日化辞 / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: C(=O)(OP(=O)(O)OCC1C(O)C(O)C(O1)n3c2ncnc(c2nc3)N)c4ccccc4
• CACTVS 3.385: Nc1ncnc2n(cnc12)[CH]3O[CH](CO[P](O)(=O)OC(=O)c4ccccc4)[CH](O)[CH]3O
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: c1ccc(cc1)C(=O)OP(=O)(O)OCC2C(C(C(O2)n3cnc4c3ncnc4N)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]3O[C@H](CO[P](O)(=O)OC(=O)c4ccccc4)[C@@H](O)[C@H]3O
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: c1ccc(cc1)C(=O)OP(=O)(O)OC[C@@H]2[C@H]([C@H]([C@@H](O2)n3cnc4c3ncnc4N)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C17H18N5O8P/c18-14-11-15(20-7-19-14)22(8-21-11)16-13(24)12(23)10(29-16)6-28-31(26,27)30-17(25)9-4-2-1-3-5-9/h1-5,7-8,10,12-13,16,23-24H,6H2,(H,26,27)(H2,18,19,20)/t10-,12-,13-,16-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: PTJTVELTWZMHPG-XNIJJKJLSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 5'-O-[(R)-(benzoyloxy)(hydroxy)phosphoryl]adenosine
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: [[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] benzoate

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-4zjz:
Crystal structure of a benzoate coenzyme A ligase with Benzoyl-AMP

PDB-5wm6:
Crystal Structure of CahJ in Complex with Benzoyl Adenylate