ChemComp-NK4: (5S)-5'-O-(5-amino-5-deoxy-beta-D-ribofuranosyl)-5'-C-[(2S,5S,6S)...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: NK4
• 名称: 名称: (5S)-5'-O-(5-amino-5-deoxy-beta-D-ribofuranosyl)-5'-C-[(2S,5S,6S)-5-carboxy-6-heptadecyl-1,4-dimethyl-3-oxo-1,4-diazepan-2-yl]uridine

Chemical information

組成

組成式: C₃₉H₆₇N₅O₁₂ / 原子数: 123 / 化学式量: 797.976 / 形式電荷: 0

その他

6oyh

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: NK4 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 6OYH

履歴

作成	2019年5月16日
公開	2019年7月10日

• 外部リンク: UniChem / BindingDB / ChEMBL / PubChem / PubChem_TPharma / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: C1(CN)C(C(O)C(O1)OC(C2N(CC(CCCCCCCCCCCCCCCCC)C(C(O)=O)N(C)C2=O)C)C4C(C(C(N3C(NC(C=C3)=O)=O)O4)O)O)O
• CACTVS 3.385: CCCCCCCCCCCCCCCCC[CH]1CN(C)[CH]([CH](O[CH]2O[CH](CN)[CH](O)[CH]2O)[CH]3O[CH]([CH](O)[CH]3O)N4C=CC(=O)NC4=O)C(=O)N(C)[CH]1C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: CCCCCCCCCCCCCCCCCC1CN(C(C(=O)N(C1C(=O)O)C)C(C2C(C(C(O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O)OC4C(C(C(O4)CN)O)O)C

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: CCCCCCCCCCCCCCCCC[C@H]1CN(C)[C@@H]([C@H](O[C@@H]2O[C@H](CN)[C@@H](O)[C@H]2O)[C@H]3O[C@H]([C@H](O)[C@@H]3O)N4C=CC(=O)NC4=O)C(=O)N(C)[C@@H]1C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: CCCCCCCCCCCCCCCCC[C@H]1CN([C@H](C(=O)N([C@@H]1C(=O)O)C)[C@@H]([C@@H]2[C@H]([C@H]([C@@H](O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O)O[C@H]4[C@@H]([C@@H]([C@H](O4)CN)O)O)C

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C39H67N5O12/c1-4-5-6-7-8-9-10-11-12-13-14-15-16-17-18-19-24-23-42(2)28(35(50)43(3)27(24)37(51)52)33(56-38-32(49)29(46)25(22-40)54-38)34-30(47)31(48)36(55-34)44-21-20-26(45)41-39(44)53/h20-21,24-25,27-34,36,38,46-49H,4-19,22-23,40H2,1-3H3,(H,51,52)(H,41,45,53)/t24-,25+,27-,28-,29+,30-,31+,32+,33-,34-,36+,38-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: GERCPLXZNIROKC-PUWYXTMPSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: (5S)-5'-O-(5-amino-5-deoxy-beta-D-ribofuranosyl)-5'-C-[(2S,5S,6S)-5-carboxy-6-heptadecyl-1,4-dimethyl-3-oxo-1,4-diazepan-2-yl]uridine
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: (2~{S},5~{S},6~{S})-2-[(~{S})-[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(aminomethyl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]oxy-[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl]-6-heptadecyl-1,4-dimethyl-3-oxidanylidene-1,4-diazepane-5-carboxylic acid

PDBエントリ

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PDB-6oyh:
Crystal structure of MraY bound to carbacaprazamycin