ChemComp-KGJ: [1-[2-[3-[[(2~{R})-4-[[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: KGJ
• 名称: 名称: [1-[2-[3-[[(2~{R})-4-[[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-3-phosphonooxy-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-butanoyl]amino]propanoylamino]ethylamino]-1-oxidanylidene-propan-2-ylidene]-bis(oxidanidyl)azanium

Chemical information

組成

組成式: C₂₄H₃₉N₉O₁₉P₃ / 原子数: 94 / 化学式量: 850.537 / 形式電荷: -1

その他

6n94

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: KGJ / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 6N94

履歴

作成	2018年12月3日
Modify formal charge	2019年2月25日
公開	2019年4月10日

• 外部リンク: UniChem / PubChem / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: n1c(c2c(nc1)n(cn2)C3OC(C(C3O)OP(=O)(O)O)COP(OP(OCC(C)(C)C(O)C(=O)NCCC(=O)NCCNC(=O)/C(C)=[N+](\[O-])[O-])(O)=O)(O)=O)N
• CACTVS 3.385: CC(C(=O)NCCNC(=O)CCNC(=O)[CH](O)C(C)(C)CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]1O[CH]([CH](O)[CH]1O[P](O)(O)=O)n2cnc3c(N)ncnc23)=[N+]([O-])[O-]
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: CC(=[N+]([O-])[O-])C(=O)NCCNC(=O)CCNC(=O)C(C(C)(C)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC1C(C(C(O1)n2cnc3c2ncnc3N)O)OP(=O)(O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: CC(C(=O)NCCNC(=O)CCNC(=O)[C@H](O)C(C)(C)CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1O[P](O)(O)=O)n2cnc3c(N)ncnc23)=[N+]([O-])[O-]
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: CC(=[N+]([O-])[O-])C(=O)NCCNC(=O)CCNC(=O)[C@@H](C(C)(C)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H]1[C@H]([C@H]([C@@H](O1)n2cnc3c2ncnc3N)O)OP(=O)(O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C24H39N9O19P3/c1-12(33(39)40)21(37)28-7-6-26-14(34)4-5-27-22(38)18(36)24(2,3)9-49-55(46,47)52-54(44,45)48-8-13-17(51-53(41,42)43)16(35)23(50-13)32-11-31-15-19(25)29-10-30-20(15)32/h10-11,13,16-18,23,35-36H,4-9H2,1-3H3,(H9-,25,26,27,28,29,30,34,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47)/q-1/t13-,16-,17-,18+,23-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: NCNYDGGYTDSUKJ-CUDSEXNASA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: [(3R,5R,9R)-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]-20-(dioxido-lambda~5~-azanylidene)-3,5,9-trihydroxy-8,8,20-trimethyl-3,5-dioxido-10,14,19-trioxo-2,4,6-trioxa-11,15,18-triaza-3lambda~5~,5lambda~5~-diphosphaicos-1-yl]oxidanide (non-preferred name)
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: [1-[2-[3-[[(2~{R})-4-[[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-3-phosphonooxy-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-butanoyl]amino]propanoylamino]ethylamino]-1-oxidanylidene-propan-2-ylidene]-bis(oxidanidyl)azanium

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-6n94:
Methylmalonyl-CoA decarboxylase in complex with 2-nitronate-propionyl-amino(dethia)-CoA

PDB-6x7n:
LnmK in complex with 2-nitronate-propionyl-amino(dethia)-CoA