ChemComp-J34: N-{[(1S)-1-carboxy-5-({[2-({4,44-dioxo-48-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexa...

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登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: J34
名称	名称: N-{[(1S)-1-carboxy-5-({[2-({4,44-dioxo-48-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40-dodecaoxa-3,43-diazaoctatetracont-1-yl}oxy)phenyl] ...名称: N-{[(1S)-1-carboxy-5-({[2-({4,44-dioxo-48-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40-dodecaoxa-3,43-diazaoctatetracont-1-yl}oxy)phenyl]carbamoyl}amino)pentyl]carbamoyl}-L-glutamic acid

登録情報

データベース: PDB化学物質要素 / ID: J34

名称

名称: N-{[(1S)-1-carboxy-5-({[2-({4,44-dioxo-48-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40-dodecaoxa-3,43-diazaoctatetracont-1-yl}oxy)phenyl] ...

組成

組成式: C₅₈H₉₈N₈O₂₄S / 原子数: 189 / 化学式量: 1323.503 / 形式電荷: 0

その他

4ngs

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: J34 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4NGS

履歴

作成	2013年12月11日
公開	2014年6月18日

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構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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SMILES

ACDLabs 12.01	O=C(O)C(NC(=O)NC(C(=O)O)CCCCNC(=O)Nc3ccccc3OCCNC(=O)CCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCNC(=O)CCCCC1SCC2NC(=O)NC12)CCC(=O)O
CACTVS 3.385	OC(=O)CC[CH](NC(=O)N[CH](CCCCNC(=O)Nc1ccccc1OCCNC(=O)CCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCNC(=O)CCCC[CH]2SC[CH]3NC(=O)N[CH]23)C(O)=O)C(O)=O
OpenEye OEToolkits 1.7.6	c1ccc(c(c1)NC(=O)NCCCCC(C(=O)O)NC(=O)NC(CCC(=O)O)C(=O)O)OCCNC(=O)CCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCNC(=O)CCCCC2C3C(CS2)NC(=O)N3

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SMILES CANONICAL

CACTVS 3.385	OC(=O)CC[C@H](NC(=O)N[C@@H](CCCCNC(=O)Nc1ccccc1OCCNC(=O)CCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCNC(=O)CCCC[C@@H]2SC[C@@H]3NC(=O)N[C@H]23)C(O)=O)C(O)=O
OpenEye OEToolkits 1.7.6	c1ccc(c(c1)NC(=O)NCCCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)OCCNC(=O)CCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCNC(=O)CCCC[C@H]2[C@@H]3[C@H](CS2)NC(=O)N3

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InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C58H98N8O24S/c67-50(11-4-3-10-49-53-47(43-91-49)65-58(77)66-53)59-16-19-79-22-24-81-26-28-83-30-32-85-34-36-87-38-40-89-42-41-88-39-37-86-35-33-84-31-29-82-27-25-80-23-21-78-18-14-51(68)60-17-20-90-48-9-2-1-7-44(48)62-56(75)61-15-6-5-8-45(54(71)72)63-57(76)64-46(55(73)74)12-13-52(69)70/h1-2,7,9,45-47,49,53H,3-6,8,10-43H2,(H,59,67)(H,60,68)(H,69,70)(H,71,72)(H,73,74)(H2,61,62,75)(H2,63,64,76)(H2,65,66,77)/t45-,46-,47-,49-,53-/m0/s1

InChI 1.03

InChI=1S/C58H98N8O24S/c67-50(11-4-3-10-49-53-47(43-91-49)65-58(77)66-53)59-16-19-79-22-24-81-26-28-83-30-32-85-34-36-87-38-40-89-42-41-88-39-37-86-35-33-84-31-29-82-27-25-80-23-21-78-18-14-51(68)60-17-20-90-48-9-2-1-7-44(48)62-56(75)61-15-6-5-8-45(54(71)72)63-57(76)64-46(55(73)74)12-13-52(69)70/h1-2,7,9,45-47,49,53H,3-6,8,10-43H2,(H,59,67)(H,60,68)(H,69,70)(H,71,72)(H,73,74)(H2,61,62,75)(H2,63,64,76)(H2,65,66,77)/t45-,46-,47-,49-,53-/m0/s1

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InChIKey

InChI 1.03	XRZNULQNCHFEIW-HJXABITDSA-N

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SYSTEMATIC NAME

ACDLabs 12.01	N-{[(1S)-1-carboxy-5-({[2-({4,44-dioxo-48-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40-dodecaoxa-3,43-diazaoctatetracont-1-yl}oxy)phenyl]carbamoyl}amino)pentyl]carbamoyl}-L-glutamic acid
OpenEye OEToolkits 1.7.6	(2S)-2-[[(2S)-6-[[2-[2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxidanylidene-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]propanoylamino]ethoxy]phenyl]carbamoylamino]-1-oxidanyl-1-oxidanylidene-hexan-2-yl]carbamoylamino]pentanedioic acid

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PDB-4ngs:
Crystal Structure of Glutamate Carboxypeptidase II in a complex with urea-based inhibitor

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