ChemComp-AO3: ALLOSAMIDIN

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: AO3
• 名称: 名称: allosamidin; 別称: (3AR,4R,5R,6S,6AS)-2-(DIMETHYLAMINO)-3A,5,6,6A-TETRAHYDRO-4-HYDROXY-6-(HYDROXYMETHYL)-4H-CYCLOPENTOXAZOL-5-YL-2-(ACETYL; 日化辞名称: アロサミジン

BIRD information

• タイプ: オリゴ糖 / 阻害剤
• ダウンロード: Molecular definition / Chemical definition

由来

• Streptomyces sp. (バクテリア), :
• Streptomyces sp. AJ9463, :

Chemical information

組成

組成式: C₂₅H₄₂N₄O₁₄ / 原子数: 85 / 化学式量: 622.619 / 形式電荷: 0

その他

1x6n

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: AO3 / モデル座標のPDB-ID: 1X6N

履歴

作成	2004年8月18日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / BindingDB / ChEMBL / ChemicalBook / CompTox / DrugBank / KEGG_Ligand / NMRShiftDB / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / SureChEMBL / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C(NC4C(O)C(O)C(OC4OC3C(OC(OC1C(O)C2N=C(OC2C1CO)N(C)C)C(NC(=O)C)C3O)CO)CO)C
• CACTVS 3.341: CN(C)C1=N[CH]2[CH](O)[CH](O[CH]3O[CH](CO)[CH](O[CH]4O[CH](CO)[CH](O)[CH](O)[CH]4NC(C)=O)[CH](O)[CH]3NC(C)=O)[CH](CO)[CH]2O1
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CC(=O)NC1C(C(C(OC1OC2C(OC(C(C2O)NC(=O)C)OC3C(C4C(C3O)N=C(O4)N(C)C)CO)CO)CO)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: CN(C)C1=N[C@@H]2[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]3O[C@H](CO)[C@@H](O[C@@H]4O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H]4NC(C)=O)[C@@H](O)[C@H]3NC(C)=O)[C@@H](CO)[C@@H]2O1
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CC(=O)N[C@@H]1[C@@H]([C@@H]([C@H](O[C@H]1O[C@@H]2[C@H](O[C@H]([C@@H]([C@@H]2O)NC(=O)C)O[C@@H]3[C@H]([C@H]4[C@@H]([C@H]3O)N=C(O4)N(C)C)CO)CO)CO)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C25H42N4O14/c1-8(33)26-14-17(36)16(35)11(6-31)39-23(14)42-22-12(7-32)40-24(15(19(22)38)27-9(2)34)41-21-10(5-30)20-13(18(21)37)28-25(43-20)29(3)4/h10-24,30-32,35-38H,5-7H2,1-4H3,(H,26,33)(H,27,34)/t10-,11+,12+,13+,14+,15+,16+,17-,18+,19-,20-,21+,22+,23-,24-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: MDWNFWDBQGOKNZ-XYUDZHFQSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: (3aR,4R,5R,6S,6aS)-2-(dimethylamino)-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-4,5,6,6a-tetrahydro-3aH-cyclopenta[d][1,3]oxazol-5-yl 2-(acetylamino)-4-O-[2-(acetylamino)-2-deoxy-beta-D-allopyranosyl]-2-deoxy-beta-D-allopyranoside
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: N-[(2S,3R,4S,5S,6R)-2-[(2R,3S,4S,5R,6R)-6-[[(3aR,4R,5R,6S,6aS)-2-dimethylamino-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-4,5,6,6a-tetrahydro-3aH-cyclopenta[d][1,3]oxazol-5-yl]oxy]-5-acetamido-4-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]oxy-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]ethanamide

PDBエントリ

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PDB-6hm1:
Structural and thermodynamic signatures of ligand binding to an enigmatic chitinase-D from Serratia proteamaculans