ChemComp-6FM: 2'-deoxy-4'-ethynyl-2-fluoroadenosine 5'-(dihydrogen phosphate)

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 6FM
• 名称: 名称: 2'-deoxy-4'-ethynyl-2-fluoroadenosine 5'-(dihydrogen phosphate)

Chemical information

組成

組成式: C₁₂H₁₃FN₅O₆P / 原子数: 38 / 化学式量: 373.234 / 形式電荷: 0

その他

5j2n

タイプ: DNA linking / PDB分類: ATOMN / 3文字コード: 6FM / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 5J2N

履歴

作成	2016年3月30日
公開	2016年8月3日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: c21n(cnc1c(nc(n2)F)N)C3CC(C(C#C)(O3)COP(O)(=O)O)O
• CACTVS 3.385: Nc1nc(F)nc2n(cnc12)[CH]3C[CH](O)[C](CO[P](O)(O)=O)(O3)C#C
• OpenEye OEToolkits 2.0.4: C#CC1(C(CC(O1)n2cnc3c2nc(nc3N)F)O)COP(=O)(O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: Nc1nc(F)nc2n(cnc12)[C@H]3C[C@H](O)[C@@](CO[P](O)(O)=O)(O3)C#C
• OpenEye OEToolkits 2.0.4: C#C[C@]1([C@H](C[C@@H](O1)n2cnc3c2nc(nc3N)F)O)COP(=O)(O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C12H13FN5O6P/c1-2-12(4-23-25(20,21)22)6(19)3-7(24-12)18-5-15-8-9(14)16-11(13)17-10(8)18/h1,5-7,19H,3-4H2,(H2,14,16,17)(H2,20,21,22)/t6-,7+,12+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: MAIQRKKYFLNZMS-QRPMWFLTSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 2'-deoxy-4'-ethynyl-2-fluoroadenosine 5'-(dihydrogen phosphate)
• OpenEye OEToolkits 2.0.4: [(2~{R},3~{S},5~{R})-5-(6-azanyl-2-fluoranyl-purin-9-yl)-2-ethynyl-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-5j2p:
HIV-1 reverse transcriptase in complex with DNA that has incorporated EFdA-MP at the P-(post-translocation) site and a second EFdA-MP at the N-(pre-translocation) site