ChemComp-3GD: N-[(2S,3R,4E)-1-{[4-O-(beta-D-galactopyranosyl)-beta-D-glucopyran...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 3GD
• 名称: 名称: N-[(2S,3R,4E)-1-{[4-O-(beta-D-galactopyranosyl)-beta-D-glucopyranosyl]oxy}-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl]docosanamide; 日化辞名称: N-(ドコサノイル)-1-O-[4-O-(β-D-ガラクトピラノシル)-β-D-グルコピラノシル]スフィンゴシン

Chemical information

組成

組成式: C₅₂H₉₉NO₁₃ / 原子数: 165 / 化学式量: 946.341 / 形式電荷: 0

その他

3sdd

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 3GD / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3SDD

履歴

作成	2011年8月21日

• 外部リンク: ChEBI / UniChem / HMDB / LipidMaps / Metabolights / 日化辞 / PubChem / SwissLipids / ZINC / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C(NC(COC2OC(C(OC1OC(CO)C(O)C(O)C1O)C(O)C2O)CO)C(O)/C=C/CCCCCCCCCCCCC)CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
• CACTVS 3.370: CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[CH](CO[CH]1O[CH](CO)[CH](O[CH]2O[CH](CO)[CH](O)[CH](O)[CH]2O)[CH](O)[CH]1O)[CH](O)C=CCCCCCCCCCCCCC
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)NC(COC1C(C(C(C(O1)CO)OC2C(C(C(C(O2)CO)O)O)O)O)O)C(C=CCCCCCCCCCCCCC)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O[C@@H]2O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]2O)[C@H](O)[C@H]1O)[C@H](O)/C=C/CCCCCCCCCCCCC
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O1)CO)O[C@H]2[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O2)CO)O)O)O)O)O)[C@@H](/C=C/CCCCCCCCCCCCC)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C52H99NO13/c1-3-5-7-9-11-13-15-17-18-19-20-21-22-24-26-28-30-32-34-36-44(57)53-40(41(56)35-33-31-29-27-25-23-16-14-12-10-8-6-4-2)39-63-51-49(62)47(60)50(43(38-55)65-51)66-52-48(61)46(59)45(58)42(37-54)64-52/h33,35,40-43,45-52,54-56,58-62H,3-32,34,36-39H2,1-2H3,(H,53,57)/b35-33+/t40-,41+,42+,43+,45-,46-,47+,48+,49+,50+,51+,52-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: QYWVASPEUXEHSY-NNRNTGNWSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: N-[(2S,3R,4E)-1-{[4-O-(beta-D-galactopyranosyl)-beta-D-glucopyranosyl]oxy}-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl]docosanamide
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: N-[(E,2S,3R)-1-[(2R,3R,4R,5S,6R)-6-(hydroxymethyl)-5-[(2S,3R,4S,5R,6R)-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3,4-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3-oxidanyl-octadec-4-en-2-yl]docosanamide

PDBエントリ

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PDB-3sdd:
Crystal structure of autoreactive-Valpha14-Vbeta6 NKT TCR in complex with CD1d-beta-lactosylceramide