ChemComp-2TS: (2S)-N-[[2-(aminomethyl)-5-chloro-phenyl]methyl]-1-[(2R)-5-carbam...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 2TS
• 名称: 名称: (2S)-N-[[2-(aminomethyl)-5-chloro-phenyl]methyl]-1-[(2R)-5-carbamimidamido-2-(phenylmethylsulfonylamino)pentanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide; 別称: (S)-1-((R)-5-Guanidino-2-phenylmethanesulfonylamino-pentanoyl)-pyrrolidine-2-carboxylic acid 2aminomethyl-5-chloro-benzylamide

BIRD information

• タイプ: ペプチド様 / トロンビン阻害剤
• ダウンロード: Molecular definition / Chemical definition / Family definition

別称

• (S)-1-((R)-5-Guanidino-2-phenylmethanesulfonylamino-pentanoyl)-pyrrolidine-2-carboxylic acid2-aminomethyl-5-chloro-benzylamide (PDB)

Annotation

• 分子機能: Inhibitor of thrombin,EC: 3.4.21.5 / 情報源: DOI:10.2210/pdb3eq0/pdb

External info

• ChEMBL: 1229260
• PubChem: 44144381

Family

Chlorobenzyl-dimethylanamine inhibitors

N~2~-(benzylsulfonyl)-D-arginyl-N-[2-(aminomethyl)-5-chlorobenzyl]-L-prolinamide / N-(BENZYLSULFONYL)-3-CYCLOHEXYL-D-ALANYL-N-[2-(AMINOMETHYL)-5-CHLOROBENZYL]-L-PROLINAMIDE / N-(BENZYLSULFONYL)GLYCYL-N-[2-(AMINOMETHYL)-5-CHLOROBENZYL]-L-PROLINAMIDE / N-(BENZYLSULFONYL)-D-VALYL-N-[2-(AMINOMETHYL)-5-CHLOROBENZYL]-L-PROLINAMIDE / N-(BENZYLSULFONYL)-D-ALANYL-N-[2-(AMINOMETHYL)-5-CHLOROBENZYL]-L-PROLINAMIDE / N-(BENZYLSULFONYL)-D-LEUCYL-N-[2-(AMINOMETHYL)-5-CHLOROBENZYL]-L-PROLINAMIDE / (2S)-N-[[2-(AMINOMETHYL)-5-CHLORANYL-PHENYL]METHYL]-1-[(2S)-2-[(3-CHLORANYL-4-METHOXY-PHENYL)SULFONYLAMINO]-4-[(4-CYANOPHENYL)METHYLAMINO]-4-OXIDANYLIDENE-BUTANOYL]PYRROLIDINE-2-CARBOXAMIDE

Chemical information

組成

組成式: C₂₆H₃₆ClN₇O₄S / 原子数: 75 / 化学式量: 578.127 / 形式電荷: 0

その他

3eq0

PMS

DAR

PRO

00T

タイプ: peptide-like / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 2TS / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3EQ0 / 子要素: PMS, DAR, PRO, 00T

履歴

作成	2008年10月1日
Modify subcomponent list	2010年11月12日
aromatic_flag"を修正	2011年6月4日
記述子を修正	2011年6月4日
記述子を修正	2012年1月5日
Modify synonyms	2021年3月1日

• 外部リンク: UniChem / BindingDB / Brenda / ChEMBL / PubChem / ZINC / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C(NCc1cc(Cl)ccc1CN)C3N(C(=O)C(NS(=O)(=O)Cc2ccccc2)CCCNC(=[N@H])N)CCC3
• CACTVS 3.385: NCc1ccc(Cl)cc1CNC(=O)[CH]2CCCN2C(=O)[CH](CCCNC(N)=N)N[S](=O)(=O)Cc3ccccc3
• OpenEye OEToolkits 1.7.5: c1ccc(cc1)CS(=O)(=O)NC(CCCNC(=N)N)C(=O)N2CCCC2C(=O)NCc3cc(ccc3CN)Cl

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: NCc1ccc(Cl)cc1CNC(=O)[C@@H]2CCCN2C(=O)[C@@H](CCCNC(N)=N)N[S](=O)(=O)Cc3ccccc3
• OpenEye OEToolkits 1.7.5: [H]/N=C(\N)/NCCC[C@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCc2cc(ccc2CN)Cl)NS(=O)(=O)Cc3ccccc3

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C26H36ClN7O4S/c27-21-11-10-19(15-28)20(14-21)16-32-24(35)23-9-5-13-34(23)25(36)22(8-4-12-31-26(29)30)33-39(37,38)17-18-6-2-1-3-7-18/h1-3,6-7,10-11,14,22-23,33H,4-5,8-9,12-13,15-17,28H2,(H,32,35)(H4,29,30,31)/t22-,23+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: MWLLGEVAEDIFRC-PKTZIBPZSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: N~2~-(benzylsulfonyl)-D-arginyl-N-[2-(aminomethyl)-5-chlorobenzyl]-L-prolinamide
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: (2S)-N-[[2-(aminomethyl)-5-chloro-phenyl]methyl]-1-[(2R)-5-carbamimidamido-2-(phenylmethylsulfonylamino)pentanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-3eq0:
Thrombin Inhibitor

PDB-5jfd:
Thrombin in complex with (S)-N-(2-(aminomethyl)-5-chlorobenzyl)-1-((benzylsulfonyl)-D-arginyl)pyrrolidine-2-carboxamide