ChemComp-23G: GUANOSINE-5'-PHOSPHATE-2',3'-CYCLIC PHOSPHATE

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 23G
• 名称: 名称: guanosine-5'-phosphate-2',3'-cyclic phosphate

Chemical information

組成

組成式: C₁₀H₁₃N₅O₁₀P₂ / 原子数: 40 / 化学式量: 425.185 / 形式電荷: 0

その他

3ivn

G

タイプ: RNA OH 3 prime terminus / PDB分類: ATOMN / 3文字コード: 23G / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3IVN / 親要素: G

履歴

作成	2009年9月9日
aromatic_flag"を修正	2011年6月4日
記述子を修正	2011年6月4日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 11.02: O=C4NC(=Nc1c4ncn1C2OC(C3OP(=O)(O)OC23)COP(=O)(O)O)N
• CACTVS 3.352: NC1=Nc2n(cnc2C(=O)N1)[CH]3O[CH](CO[P](O)(O)=O)[CH]4O[P](O)(=O)O[CH]34
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: c1nc2c(n1C3C4C(C(O3)COP(=O)(O)O)OP(=O)(O4)O)N=C(NC2=O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.352: NC1=Nc2n(cnc2C(=O)N1)[C@@H]3O[C@H](CO[P](O)(O)=O)[C@H]4O[P](O)(=O)O[C@@H]34
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: c1nc2c(n1[C@H]3[C@H]4[C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(O)O)O[P@@](=O)(O4)O)N=C(NC2=O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C10H13N5O10P2/c11-10-13-7-4(8(16)14-10)12-2-15(7)9-6-5(24-27(20,21)25-6)3(23-9)1-22-26(17,18)19/h2-3,5-6,9H,1H2,(H,20,21)(H2,17,18,19)(H3,11,13,14,16)/t3-,5-,6-,9-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: ZBMMALUAVDLKSL-UUOKFMHZSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 11.02: [(2S,3aR,4R,6R,6aR)-6-(2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)-2-hydroxy-2-oxidotetrahydrofuro[3,4-d][1,3,2]dioxaphosphol-4-yl]methyl dihydrogen phosphate
• OpenEye OEToolkits 1.6.1: [(1R,3S,5R,6R,8R)-8-(2-azanyl-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxy-3-oxo-2,4,7-trioxa-3$l^{5}-phosphabicyclo[3.3.0]octan-6-yl]methyl dihydrogen phosphate

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-6if5:
Crystal structure of monkey TLR7 in complex with 2',3'-cGMP (Guanosine 2',3'-cyclic phosphate)