ChemComp-1G5: HMB-Val-Ser-Phe(4-NH2CH2)-methyl vinyl sulfone, bound form

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 1G5
• 名称: 名称: hmb-Val-Ser-Phe(4-nh2ch2)-methyl vinyl sulfone, bound form

BIRD information

• タイプ: ペプチド様 / 阻害剤
• ダウンロード: Molecular definition / Chemical definition / Family definition

別称

• vinyl sulfone LU122 (PDB)

Annotation

• 分子機能: inhibitor of 20S proteasome / 情報源: PubMed: 23320547

External info

• PubChem: 70680739

Family

Vinyl sulfone inhibitor with P1 position benzylamine

N3PHE-LEU-LEU-PHE(4-NH2CH2)-METHYL VINYL SULFONE, BOUND FORM / HMB-VAL-SER-PHE(4-NH2CH2)-METHYL VINYL SULFONE, BOUND FORM / N3PHE-PHE(4-NH2CH2)-LEU-PHE(4-NH2CH2)-METHYL VINYL SULFONE, BOUND FORM

Chemical information

組成

組成式: C₂₈H₄₀N₄O₇S / 原子数: 80 / 化学式量: 576.705 / 形式電荷: 0

その他

4int

PF0

VAL

SER

1G3

タイプ: peptide-like / PDB分類: ATOMP / 3文字コード: 1G5 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4INT / 子要素: PF0, VAL, SER, 1G3

履歴

作成	2013年1月22日
公開	2013年1月25日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=S(=O)(C)CCC(NC(=O)C(NC(=O)C(NC(=O)c1cccc(O)c1C)C(C)C)CO)Cc2ccc(cc2)CN
• CACTVS 3.370: CC(C)[CH](NC(=O)c1cccc(O)c1C)C(=O)N[CH](CO)C(=O)N[CH](CC[S](C)(=O)=O)Cc2ccc(CN)cc2
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: Cc1c(cccc1O)C(=O)NC(C(C)C)C(=O)NC(CO)C(=O)NC(CCS(=O)(=O)C)Cc2ccc(cc2)CN

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: CC(C)[C@H](NC(=O)c1cccc(O)c1C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](CC[S](C)(=O)=O)Cc2ccc(CN)cc2
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: Cc1c(cccc1O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](CCS(=O)(=O)C)Cc2ccc(cc2)CN

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C28H40N4O7S/c1-17(2)25(32-26(35)22-6-5-7-24(34)18(22)3)28(37)31-23(16-33)27(36)30-21(12-13-40(4,38)39)14-19-8-10-20(15-29)11-9-19/h5-11,17,21,23,25,33-34H,12-16,29H2,1-4H3,(H,30,36)(H,31,37)(H,32,35)/t21-,23+,25+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: OCEOTFNCOHQGQA-VTZPFEBOSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: N-(3-hydroxy-2-methylbenzoyl)-L-valyl-N-[(2S)-1-[4-(aminomethyl)phenyl]-4-(methylsulfonyl)butan-2-yl]-L-serinamide
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: N-[(2S)-1-[[(2S)-1-[[(2S)-1-[4-(aminomethyl)phenyl]-4-methylsulfonyl-butan-2-yl]amino]-3-oxidanyl-1-oxidanylidene-propan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]-2-methyl-3-oxidanyl-benzamide

PDBエントリ

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PDB-4int:
Yeast 20S proteasome in complex with the vinyl sulfone LU122