ChemComp-1C4: (2S)-2-({(3S,5R,9R)-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 1C4
• 名称: 名称: (2S)-2-({(3S,5R,9R)-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]-3,5,9-trihydroxy-8,8-dimethyl-3,5-dioxido-10,14,20-trioxo-2,4,6-trioxa-18-thia-11,15-diaza-3lambda~5~,5lambda~5~-diphosphaicosan-20-yl}amino)pentanedioic acid (non-preferred name)

Chemical information

組成

組成式: C₂₈H₄₅N₈O₂₁P₃S / 原子数: 106 / 化学式量: 954.684 / 形式電荷: 0

その他

4i49

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 1C4 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4I49

履歴

作成	2012年11月30日
公開	2013年1月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C(O)C(NC(=O)CSCCNC(=O)CCNC(=O)C(O)C(C)(C)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC3OC(n2cnc1c(ncnc12)N)C(O)C3OP(=O)(O)O)CCC(=O)O
• CACTVS 3.370: CC(C)(CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]1O[CH]([CH](O)[CH]1O[P](O)(O)=O)n2cnc3c(N)ncnc23)[CH](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSCC(=O)N[CH](CCC(O)=O)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: CC(C)(COP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC1C(C(C(O1)n2cnc3c2ncnc3N)O)OP(=O)(O)O)C(C(=O)NCCC(=O)NCCSCC(=O)NC(CCC(=O)O)C(=O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: CC(C)(CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1O[P](O)(O)=O)n2cnc3c(N)ncnc23)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: CC(C)(COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H]1[C@H]([C@H]([C@@H](O1)n2cnc3c2ncnc3N)O)OP(=O)(O)O)[C@H](C(=O)NCCC(=O)NCCSCC(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C28H45N8O21P3S/c1-28(2,22(42)25(43)31-6-5-16(37)30-7-8-61-10-17(38)35-14(27(44)45)3-4-18(39)40)11-54-60(51,52)57-59(49,50)53-9-15-21(56-58(46,47)48)20(41)26(55-15)36-13-34-19-23(29)32-12-33-24(19)36/h12-15,20-22,26,41-42H,3-11H2,1-2H3,(H,30,37)(H,31,43)(H,35,38)(H,39,40)(H,44,45)(H,49,50)(H,51,52)(H2,29,32,33)(H2,46,47,48)/t14-,15+,20+,21+,22-,26+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: WCWCYRFADJEDNS-NOTSHUFBSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: (2S)-2-({(3S,5R,9R)-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]-3,5,9-trihydroxy-8,8-dimethyl-3,5-dioxido-10,14,20-trioxo-2,4,6-trioxa-18-thia-11,15-diaza-3lambda~5~,5lambda~5~-diphosphaicosan-20-yl}amino)pentanedioic acid (non-preferred name)
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: (2S)-2-[2-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-3-phosphonooxy-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-butanoyl]amino]propanoylamino]ethylsulfanyl]ethanoylamino]pentanedioic acid

PDBエントリ

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PDB-4i49:
Structure of ngNAGS bound with bisubstrate analog CoA-NAG