ChemComp-CSG: 2'-amino-2'-deoxycytidine 5'-(tetrahydrogen triphosphate)

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: CSG
• 名称: 名称: 2'-amino-2'-deoxycytidine 5'-(tetrahydrogen triphosphate); 別称: 2'-amino-2'-deoxycytidine-5'-triphosphate; 日化辞名称: 2′-アミノ-2′-デオキシシチジン-5′-三りん酸

Chemical information

組成

組成式: C₉H₁₇N₄O₁₃P₃ / 原子数: 46 / 化学式量: 482.172 / 形式電荷: 0

その他

3h5x

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: CSG / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3H5X

履歴

作成	2009年4月23日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / 日化辞 / PubChem / SureChEMBL / ZINC / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=P(O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2OC(N1C(=O)N=C(N)C=C1)C(N)C2O
• CACTVS 3.341: N[CH]1[CH](O)[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)O[CH]1N2C=CC(=NC2=O)N
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1=CN(C(=O)N=C1N)C2C(C(C(O2)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: N[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO[P@@](O)(=O)O[P@](O)(=O)O[P](O)(O)=O)O[C@H]1N2C=CC(=NC2=O)N
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1=CN(C(=O)N=C1N)[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)CO[P@](=O)(O)O[P@@](=O)(O)OP(=O)(O)O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C9H17N4O13P3/c10-5-1-2-13(9(15)12-5)8-6(11)7(14)4(24-8)3-23-28(19,20)26-29(21,22)25-27(16,17)18/h1-2,4,6-8,14H,3,11H2,(H,19,20)(H,21,22)(H2,10,12,15)(H2,16,17,18)/t4-,6-,7-,8-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: WNVZQYHBHSLUHJ-XVFCMESISA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 2'-amino-2'-deoxycytidine 5'-(tetrahydrogen triphosphate)
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2R,3S,4R,5R)-4-amino-5-(4-amino-2-oxo-pyrimidin-1-yl)-3-hydroxy-oxolan-2-yl]methyl (hydroxy-phosphonooxy-phosphoryl) hydrogen phosphate

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-3h5x:
Crystal Structure of 2'-amino-2'-deoxy-cytidine-5'-triphosphate bound to Norovirus GII RNA polymerase