ChemComp-CMM: 2-[2-(1-CARBAMIMIDOYL-PIPERIDIN-3-YL)-ACETYLAMINO]-3-{4-[2-(3-OXA...

IDまたはキーワード:

登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: CMM
名称	名称: 2-[2-(1-carbamimidoyl-piperidin-3-yl)-acetylamino]-3-{4-[2-(3-oxalyl-1H-indol-7-yl)ethyl]-phenyl}-propionic acid methyl ester

組成

組成式: C₃₀H₃₅N₅O₆ / 原子数: 76 / 化学式量: 561.629 / 形式電荷: 0

その他

1m49

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: CMM / モデル座標のPDB-ID: 1M49

履歴

作成	2002年7月23日
記述子を修正	2011年6月4日

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構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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SMILES

ACDLabs 10.04	O=C(OC)C(NC(=O)CC1CCCN(C(=[N@H])N)C1)Cc2ccc(cc2)CCc3cccc4c3ncc4C(=O)C(=O)O
CACTVS 3.341	COC(=O)[CH](Cc1ccc(CCc2cccc3c2[nH]cc3C(=O)C(O)=O)cc1)NC(=O)C[CH]4CCCN(C4)C(N)=N
OpenEye OEToolkits 1.5.0	[H]N=C(N)N1CCCC(C1)CC(=O)NC(Cc2ccc(cc2)CCc3cccc4c3[nH]cc4C(=O)C(=O)O)C(=O)OC

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SMILES CANONICAL

CACTVS 3.341	COC(=O)[C@H](Cc1ccc(CCc2cccc3c2[nH]cc3C(=O)C(O)=O)cc1)NC(=O)C[C@H]4CCCN(C4)C(N)=N
OpenEye OEToolkits 1.5.0	[H]/N=C(/N)\N1CCC[C@@H](C1)CC(=O)N[C@@H](Cc2ccc(cc2)CCc3cccc4c3[nH]cc4C(=O)C(=O)O)C(=O)OC

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InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C30H35N5O6/c1-41-29(40)24(34-25(36)15-20-4-3-13-35(17-20)30(31)32)14-19-9-7-18(8-10-19)11-12-21-5-2-6-22-23(16-33-26(21)22)27(37)28(38)39/h2,5-10,16,20,24,33H,3-4,11-15,17H2,1H3,(H3,31,32)(H,34,36)(H,38,39)/t20-,24+/m1/s1

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InChIKey

InChI 1.03	YRVAENMKEUHMEX-YKSBVNFPSA-N

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SYSTEMATIC NAME

ACDLabs 10.04	[7-(2-{4-[(2S)-2-({[(3R)-1-carbamimidoylpiperidin-3-yl]acetyl}amino)-3-methoxy-3-oxopropyl]phenyl}ethyl)-1H-indol-3-yl](oxo)acetic acid
OpenEye OEToolkits 1.5.0	2-[7-[2-[4-[(2S)-2-[2-[(3R)-1-carbamimidoylpiperidin-3-yl]ethanoylamino]-3-methoxy-3-oxo-propyl]phenyl]ethyl]-1H-indol-3-yl]-2-oxo-ethanoic acid

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PDB-1m49:
Crystal Structure of Human Interleukin-2 Complexed with SP-1985

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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