ChemComp-CG2: CYTIDYL-2'-5'-PHOSPHO-GUANOSINE

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: CG2
• 名称: 名称: cytidyl-2'-5'-phospho-guanosine / 日化辞名称: 5′-グアニル酸2′-シチジル

Chemical information

組成

組成式: C₁₉H₂₅N₈O₁₂P / 原子数: 65 / 化学式量: 588.422 / 形式電荷: 0

• その他: タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: CG2

履歴

作成	2003年6月28日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / DrugBank / 日化辞 / PubChem / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C1N=C(N)C=CN1C5OC(CO)C(O)C5OP(=O)(O)OCC4OC(n3cnc2c3N=C(N)NC2=O)C(O)C4O
• CACTVS 3.341: NC1=Nc2n(cnc2C(=O)N1)[CH]3O[CH](CO[P](O)(=O)O[CH]4[CH](O)[CH](CO)O[CH]4N5C=CC(=NC5=O)N)[CH](O)[CH]3O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc2c(n1C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OC4C(C(OC4N5C=CC(=NC5=O)N)CO)O)O)O)N=C(NC2=O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: NC1=Nc2n(cnc2C(=O)N1)[C@@H]3O[C@H](CO[P@](O)(=O)O[C@@H]4[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]4N5C=CC(=NC5=O)N)[C@@H](O)[C@H]3O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc2c(n1[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CO[P@@](=O)(O)O[C@@H]4[C@@H]([C@H](O[C@H]4N5C=CC(=NC5=O)N)CO)O)O)O)N=C(NC2=O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C19H25N8O12P/c20-8-1-2-26(19(33)23-8)17-13(11(30)6(3-28)37-17)39-40(34,35)36-4-7-10(29)12(31)16(38-7)27-5-22-9-14(27)24-18(21)25-15(9)32/h1-2,5-7,10-13,16-17,28-31H,3-4H2,(H,34,35)(H2,20,23,33)(H3,21,24,25,32)/t6-,7-,10-,11-,12-,13-,16-,17-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: QZDUXDLOEVJGDG-VMIOUTBZSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: [(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl (2R,3R,4R,5R)-2-(4-amino-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-yl hydrogen (R)-phosphate (non-preferred name)
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methyl [(2R,3R,4R,5R)-2-(4-amino-2-oxo-pyrimidin-1-yl)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate

PDBエントリ

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PDB-1oj1:
Nonproductive and Novel Binding Modes in Cytotoxic Ribonucleases from Rana catesbeiana of Two Crystal Structures Complexed with (2,5 CpG) and d(ApCpGpA)