ChemComp-C9V: [(2R,5R,11R,14S,24E)-14-[(acetyloxy)methyl]-8-{[5-(3,5-dimethyl-1...

IDまたはキーワード:

登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: C9V
名称	名称: [(2R,5R,11R,14S,24E)-14-[(acetyloxy)methyl]-8-{[5-(3,5-dimethyl-1H-pyrrol-2-yl-kappaN)-5-(3,5-dimethyl-2H-pyrrol-2-ylidene-kappaN)pentanoyl]oxy}-5,11-dihydroxy-2-{[(9E)-octadec-9-enoyl]oxy}- ...名称: [(2R,5R,11R,14S,24E)-14-[(acetyloxy)methyl]-8-{[5-(3,5-dimethyl-1H-pyrrol-2-yl-kappaN)-5-(3,5-dimethyl-2H-pyrrol-2-ylidene-kappaN)pentanoyl]oxy}-5,11-dihydroxy-2-{[(9E)-octadec-9-enoyl]oxy}-5,11,16-trioxo-4,6,10,12,15-pentaoxa-5lambda~5~,11lambda~5~-diphosphatritriacont-24-en-1-yl (9E)-octadec-9-enoatato](difluoro)boron

登録情報

データベース: PDB化学物質要素 / ID: C9V

名称

名称: [(2R,5R,11R,14S,24E)-14-[(acetyloxy)methyl]-8-{[5-(3,5-dimethyl-1H-pyrrol-2-yl-kappaN)-5-(3,5-dimethyl-2H-pyrrol-2-ylidene-kappaN)pentanoyl]oxy}-5,11-dihydroxy-2-{[(9E)-octadec-9-enoyl]oxy}- ...

組成

組成式: C₈₂H₁₃₉BF₂N₂O₁₈P₂ / 原子数: 246 / 化学式量: 1551.739 / 形式電荷: 0

その他

6b21

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: C9V / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 6B21

履歴

作成	2017年9月20日
公開	2018年3月7日

外部リンク

UniChem /

ChemSpider /

PubChem /

Wikipedia search /

Google search

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
SMILES

ACDLabs 12.01	C1(=CC(=[N+]3C1=C(CCCC(OC(COP(OCC(OC(=O)CCCCCCC[C@H]=[C@H]CCCCCCCC)COC(C)=O)(=O)O)COP(O)(OCC(COC(CCCCCCC[C@H]=[C@H]CCCCCCCC)=O)OC(CCCCCCC[C@H]=[C@H]CCCCCCCC)=O)=O)=O)c2c(C)cc(n2[B-]3(F)F)C)C)C
CACTVS 3.385	CCCCCCCCC=CCCCCCCCC(=O)OC[CH](CO[P](O)(=O)OC[CH](CO[P](O)(=O)OC[CH](COC(C)=O)OC(=O)CCCCCCCC=CCCCCCCCC)OC(=O)CCCC1=C2C(=CC(=[N+]2[B-](F)(F)n3c(C)cc(C)c13)C)C)OC(=O)CCCCCCCC=CCCCCCCCC
OpenEye OEToolkits 2.0.6	[B-]1(n2c(cc(c2C(=C3[N+]1=C(C=C3C)C)CCCC(=O)OC(COP(=O)(O)OCC(COC(=O)C)OC(=O)CCCCCCCC=CCCCCCCCC)COP(=O)(O)OCC(COC(=O)CCCCCCCC=CCCCCCCCC)OC(=O)CCCCCCCC=CCCCCCCCC)C)C)(F)F

-
SMILES CANONICAL

CACTVS 3.385	CCCCCCCC\C=C\CCCCCCCC(=O)OC[C@H](CO[P](O)(=O)OC[C@@H](CO[P](O)(=O)OC[C@H](COC(C)=O)OC(=O)CCCCCCC/C=C/CCCCCCCC)OC(=O)CCCC1=C2C(=CC(=[N+]2[B-](F)(F)n3c(C)cc(C)c13)C)C)OC(=O)CCCCCCC/C=C/CCCCCCCC
OpenEye OEToolkits 2.0.6	[B-]1(n2c(cc(c2C(=C3[N+]1=C(C=C3C)C)CCCC(=O)O[C@H](COP(=O)(O)OC[C@H](COC(=O)C)OC(=O)CCCCCCC/C=C/CCCCCCCC)COP(=O)(O)OC[C@@H](COC(=O)CCCCCCC/C=C/CCCCCCCC)OC(=O)CCCCCCC/C=C/CCCCCCCC)C)C)(F)F

-
InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C82H139BF2N2O18P2/c1-9-12-15-18-21-24-27-30-33-36-39-42-45-48-51-56-77(89)98-63-74(104-79(91)58-53-50-47-44-41-38-35-32-29-26-23-20-17-14-11-3)65-100-107(95,96)102-67-75(105-80(92)59-54-55-76-81-68(4)60-70(6)86(81)83(84,85)87-71(7)61-69(5)82(76)87)66-101-106(93,94)99-64-73(62-97-72(8)88)103-78(90)57-52-49-46-43-40-37-34-31-28-25-22-19-16-13-10-2/h30-35,60-61,73-75H,9-29,36-59,62-67H2,1-8H3,(H,93,94)(H,95,96)/b33-30+,34-31+,35-32+/t73-,74+,75+/m0/s1

InChI 1.03

InChI=1S/C82H139BF2N2O18P2/c1-9-12-15-18-21-24-27-30-33-36-39-42-45-48-51-56-77(89)98-63-74(104-79(91)58-53-50-47-44-41-38-35-32-29-26-23-20-17-14-11-3)65-100-107(95,96)102-67-75(105-80(92)59-54-55-76-81-68(4)60-70(6)86(81)83(84,85)87-71(7)61-69(5)82(76)87)66-101-106(93,94)99-64-73(62-97-72(8)88)103-78(90)57-52-49-46-43-40-37-34-31-28-25-22-19-16-13-10-2/h30-35,60-61,73-75H,9-29,36-59,62-67H2,1-8H3,(H,93,94)(H,95,96)/b33-30+,34-31+,35-32+/t73-,74+,75+/m0/s1

-
InChIKey

InChI 1.03	GDYLGRNGCDWDQL-UUEIIFSHSA-N

-
SYSTEMATIC NAME

ACDLabs 12.01	[(2R,5R,11R,14S,24E)-14-[(acetyloxy)methyl]-8-{[5-(3,5-dimethyl-1H-pyrrol-2-yl-kappaN)-5-(3,5-dimethyl-2H-pyrrol-2-ylidene-kappaN)pentanoyl]oxy}-5,11-dihydroxy-2-{[(9E)-octadec-9-enoyl]oxy}-5,11,16-trioxo-4,6,10,12,15-pentaoxa-5lambda~5~,11lambda~5~-diphosphatritriacont-24-en-1-yl (9E)-octadec-9-enoatato](difluoro)boron
OpenEye OEToolkits 2.0.6	[(2~{R})-3-[[(2~{R})-3-[[(2~{S})-3-acetyloxy-2-[(~{E})-octadec-9-enoyl]oxy-propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxy-2-[4-[2,2-bis(fluoranyl)-4,6,10,12-tetramethyl-3-aza-1-azonia-2-boranuidatricyclo[7.3.0.0^{3,7}]dodeca-1(12),4,6,8,10-pentaen-8-yl]butanoyloxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxy-2-[(~{E})-octadec-9-enoyl]oxy-propyl] (~{E})-octadec-9-enoate

全1件を表示しています

PDB-6b21:
Crystal structure of AmtB from E. coli bound to TopFluor cardiolipin

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
Chemical information

-
構造の表示

-
詳細

-
SMILES

-
SMILES CANONICAL

-
InChI

-
InChIKey

-
SYSTEMATIC NAME

-
PDBエントリ

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-Chemical information

-構造の表示

-詳細

-SMILES

-SMILES CANONICAL

-InChI

-InChIKey

-SYSTEMATIC NAME

-PDBエントリ

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
Chemical information

-
構造の表示

-
詳細

-
SMILES

-
SMILES CANONICAL

-
InChI

-
InChIKey

-
SYSTEMATIC NAME

-
PDBエントリ

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)