ChemComp-BYT: Biocytin

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: BYT
• 名称: 名称: Biocytin; 別称: N~6~-{5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}-L-lysine; 日化辞名称: ビオシチン

Chemical information

組成

組成式: C₁₆H₂₈N₄O₄S / 原子数: 53 / 化学式量: 372.483 / 形式電荷: 0

その他

4lod
PDB 未公開エントリ

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: BYT / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4LOD

履歴

作成	2013年8月1日
公開	2014年9月10日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / ChEBI / ChemicalBook / HMDB / Metabolights / NMRShiftDB / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / SureChEMBL / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C1NC2C(SCC2N1)CCCCC(=O)NCCCCC(C(=O)O)N
• CACTVS 3.385: N[CH](CCCCNC(=O)CCCC[CH]1SC[CH]2NC(=O)N[CH]12)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C1C2C(C(S1)CCCCC(=O)NCCCCC(C(=O)O)N)NC(=O)N2

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: N[C@@H](CCCCNC(=O)CCCC[C@@H]1SC[C@@H]2NC(=O)N[C@H]12)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C1[C@H]2[C@@H]([C@@H](S1)CCCCC(=O)NCCCC[C@@H](C(=O)O)N)NC(=O)N2

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C16H28N4O4S/c17-10(15(22)23)5-3-4-8-18-13(21)7-2-1-6-12-14-11(9-25-12)19-16(24)20-14/h10-12,14H,1-9,17H2,(H,18,21)(H,22,23)(H2,19,20,24)/t10-,11-,12-,14-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: BAQMYDQNMFBZNA-MNXVOIDGSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: N~6~-{5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}-L-lysine
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: (2S)-6-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxidanylidene-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]-2-azanyl-hexanoic acid

PDBエントリ

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PDB-4m6v:
Structure of the carboxyl transferase domain from Rhizobium etli pyruvate carboxylase with pyruvate and biocytin