ChemComp-BV2: 1,3-BIS-([3-(4-{3-[3-NITRO-5-(GALACTOPYRANOSYLOXY)-BENZOYLAMINO]-...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: BV2
• 名称: 名称: 1,3-bis-([3-(4-{3-[3-nitro-5-(galactopyranosyloxy)-benzoylamino]-propyl}-piperazin-1-yl)-propyl-amino]-carbonyloxy)-2-amino-propane; 別称: BV2

Chemical information

組成

組成式: C₅₁H₇₉N₁₁O₂₂ / 原子数: 163 / 化学式量: 1198.233 / 形式電荷: 0

その他

1rd9

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: BV2 / モデル座標のPDB-ID: 1RD9

履歴

作成	2003年11月24日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2021年3月1日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: [O-][N+](=O)c2cc(cc(OC1OC(CO)C(O)C(O)C1O)c2)C(=O)NCCCN3CCN(CC3)CCCNC(=O)OCC(N)COC(=O)NCCCN4CCN(CC4)CCCNC(=O)c6cc(OC5OC(C(O)C(O)C5O)CO)cc([N+]([O-])=O)c6
• CACTVS 3.341: NC(COC(=O)NCCCN1CCN(CCCNC(=O)c2cc(O[CH]3O[CH](CO)[CH](O)[CH](O)[CH]3O)cc(c2)[N+]([O-])=O)CC1)COC(=O)NCCCN4CCN(CCCNC(=O)c5cc(OC6OC(CO)C(O)C(O)C6O)cc(c5)[N+]([O-])=O)CC4
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1c(cc(cc1[N+](=O)[O-])OC2C(C(C(C(O2)CO)O)O)O)C(=O)NCCCN3CCN(CC3)CCCNC(=O)OCC(COC(=O)NCCCN4CCN(CC4)CCCNC(=O)c5cc(cc(c5)OC6C(C(C(C(O6)CO)O)O)O)[N+](=O)[O-])N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: NC(COC(=O)NCCCN1CCN(CCCNC(=O)c2cc(O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]3O)cc(c2)[N+]([O-])=O)CC1)COC(=O)NCCCN4CCN(CCCNC(=O)c5cc(OC6OC(CO)C(O)C(O)C6O)cc(c5)[N+]([O-])=O)CC4
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1c(cc(cc1[N+](=O)[O-])O[C@@H]2[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O2)CO)O)O)O)C(=O)NCCCN3CCN(CC3)CCCNC(=O)OCC(COC(=O)NCCCN4CCN(CC4)CCCNC(=O)c5cc(cc(c5)O[C@@H]6[C@@H]([C@@H]([C@@H]([C@@H](O6)CO)O)O)O)[N+](=O)[O-])N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C51H79N11O22/c52-33(29-79-50(73)55-7-3-11-59-17-13-57(14-18-59)9-1-5-53-46(71)31-21-34(61(75)76)25-36(23-31)81-48-44(69)42(67)40(65)38(27-63)83-48)30-80-51(74)56-8-4-12-60-19-15-58(16-20-60)10-2-6-54-47(72)32-22-35(62(77)78)26-37(24-32)82-49-45(70)43(68)41(66)39(28-64)84-49/h21-26,33,38-45,48-49,63-70H,1-20,27-30,52H2,(H,53,71)(H,54,72)(H,55,73)(H,56,74)/t33?,38-,39?,40+,41?,42+,43?,44-,45?,48+,49?/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: RJLCAAJYVGPDFG-LNGNCPBTSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 2-amino-3-[({3-[4-(3-{[(3-nitro-5-{[(2R,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)tetrahydro-2H-pyran-2-yl]oxy}phenyl)carbonyl]amino}propyl)piperazin-1-yl]propyl}carbamoyl)oxy]propyl {3-[4-(3-{[(3-nitro-5-{[3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)tetrahydro-2H-pyran-2-yl]oxy}phenyl)carbonyl]amino}propyl)piperazin-1-yl]propyl}carbamate (non-preferred name)
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [2-amino-3-[3-[4-[3-[[3-nitro-5-[(2R,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-phenyl]carbonylamino]propyl]piperazin-1-yl]propylcarbamoyloxy]propyl] N-[3-[4-[3-[[3-nitro-5-[(2R,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-phenyl]carbonylamino]propyl]piperazin-1-yl]propyl]carbamate

PDBエントリ

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PDB-1rd9:
Cholera Toxin B-Pentamer Complexed With Bivalent Nitrophenol-Galactoside Ligand BV2