ChemComp-B4F: biotin-4-fluorescein

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: B4F
• 名称: 名称: biotin-4-fluorescein / 日化辞名称: ビオチン-4-フルオレセイン

Chemical information

組成

組成式: C₃₃H₃₂N₄O₈S / 原子数: 78 / 化学式量: 644.694 / 形式電荷: 0

その他

4bx7

タイプ: non-polymer / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: B4F / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4bx7

履歴

作成	2013年7月9日
公開	2013年9月25日
記述子を修正	2014年9月5日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / 日化辞 / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C1NC2C(SCC2N1)CCCCC(=O)NCCNC(=O)c6ccc(C=4c5ccc(O)cc5OC3=CC(=O)C=CC3=4)c(C(=O)O)c6
• CACTVS 3.385: OC(=O)c1cc(ccc1C2=C3C=CC(=O)C=C3Oc4cc(O)ccc24)C(=O)NCCNC(=O)CCCC[CH]5SC[CH]6NC(=O)N[CH]56
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: c1cc(c(cc1C(=O)NCCNC(=O)CCCCC2C3C(CS2)NC(=O)N3)C(=O)O)C4=C5C=CC(=O)C=C5Oc6c4ccc(c6)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: OC(=O)c1cc(ccc1C2=C3C=CC(=O)C=C3Oc4cc(O)ccc24)C(=O)NCCNC(=O)CCCC[C@@H]5SC[C@@H]6NC(=O)N[C@H]56
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: c1cc(c(cc1C(=O)NCCNC(=O)CCCC[C@H]2[C@@H]3[C@H](CS2)NC(=O)N3)C(=O)O)C4=C5C=CC(=O)C=C5Oc6c4ccc(c6)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C33H32N4O8S/c38-18-6-9-21-25(14-18)45-26-15-19(39)7-10-22(26)29(21)20-8-5-17(13-23(20)32(42)43)31(41)35-12-11-34-28(40)4-2-1-3-27-30-24(16-46-27)36-33(44)37-30/h5-10,13-15,24,27,30,38H,1-4,11-12,16H2,(H,34,40)(H,35,41)(H,42,43)(H2,36,37,44)/t24-,27-,30-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: DFUFXKZUEOKPSD-LFERIPGTSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 2-(6-hydroxy-3-oxo-3H-xanthen-9-yl)-5-{[2-({5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoyl}amino)ethyl]carbamoyl}benzoic acid
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: 5-[2-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxidanylidene-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]ethylcarbamoyl]-2-(3-oxidanyl-6-oxidanylidene-xanthen-9-yl)benzoic acid

PDBエントリ

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PDB-4bx7:
trans-divalent streptavidin bound to biotin-4-fluorescein