ChemComp-APW: {5'-O-[(R)-{[(S)-AMINO(HYDROXY-KAPPAO)PHOSPHORYL]OXY}(HYDROXY-KAP...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: APW
• 名称: 名称: {5'-O-[(R)-{[(S)-amino(hydroxy-kappao)phosphoryl]oxy}(hydroxy-kappao)phosphoryl]adenosinato(2-)}magnesium; 別称: MAGNESIUM-5'-ADENYLY-BETA-AMIDO-DIPHOSPHATE

Chemical information

組成

組成式: C₁₀H₁₄MgN₆O₉P₂ / 原子数: 42 / 化学式量: 448.505 / 形式電荷: 0

• その他: タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: APW

履歴

作成	2006年2月19日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2020年6月5日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=P4(O[Mg]OP(=O)(OCC3OC(n1c2ncnc(N)c2nc1)C(O)C3O)O4)N
• CACTVS 3.341: Nc1ncnc2n(cnc12)[CH]3O[CH](CO[P]4(=O)O[Mg]O[P](N)(=O)O4)[CH](O)[CH]3O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc(c2c(n1)n(cn2)C3C(C(C(O3)COP4(=O)O[Mg]OP(=O)(O4)N)O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]3O[C@H](CO[P@]4(=O)O[Mg]O[P@](N)(=O)O4)[C@@H](O)[C@H]3O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc(c2c(n1)n(cn2)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CO[P@]4(=O)O[Mg]O[P@](=O)(O4)N)O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C10H16N6O9P2.Mg/c11-8-5-9(14-2-13-8)16(3-15-5)10-7(18)6(17)4(24-10)1-23-27(21,22)25-26(12,19)20;/h2-4,6-7,10,17-18H,1H2,(H,21,22)(H2,11,13,14)(H3,12,19,20);/q;+2/p-2/t4-,6-,7-,10-;/m1./s1

InChIKey

• InChI 1.03: XFWUVFOBMRZZRT-MCDZGGTQSA-L

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: {5'-O-[(R)-{[(S)-amino(hydroxy-kappaO)phosphoryl]oxy}(hydroxy-kappaO)phosphoryl]adenosinato(2-)}magnesium
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: (2R,3S,4R,5R)-2-[[(2R,4S)-4-amino-2,4-dioxo-1,3,5-trioxa-2$l^{5},4$l^{5}-diphospha-6$l^{2}-magnesacyclohex-2-yl]oxymethyl]-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolane-3,4-diol

PDBエントリ

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PDB-2dej:
Crystal Structure of galaktokinase from Pyrococcus horikoshii with AMP-PN and galactose