ChemComp-AOF: N-(5-amino-2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl)-5-O-phosph...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: AOF
• 名称: 名称: N-(5-amino-2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl)-5-O-phosphono-beta-D-ribofuranosylamine; 日化辞名称: 5-アミノ-6-(5-O-ホスホノ-β-D-リボフラノシルアミノ)ピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン

Chemical information

組成

組成式: C₉H₁₅N₄O₉P / 原子数: 38 / 化学式量: 354.211 / 形式電荷: 0

その他

4g3m

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: AOF / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4G3M

履歴

作成	2012年8月9日
Modify name	2012年10月5日
Modify value order	2012年10月5日
公開	2013年2月15日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / ChEBI / KEGG_Ligand / Metabolights / 日化辞 / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=P(O)(O)OCC2OC(NC=1NC(=O)NC(=O)C=1N)C(O)C2O
• CACTVS 3.370: NC1=C(N[CH]2O[CH](CO[P](O)(O)=O)[CH](O)[CH]2O)NC(=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C(C1C(C(C(O1)NC2=C(C(=O)NC(=O)N2)N)O)O)OP(=O)(O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: NC1=C(N[C@@H]2O[C@H](CO[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]2O)NC(=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C([C@@H]1[C@H]([C@H]([C@@H](O1)NC2=C(C(=O)NC(=O)N2)N)O)O)OP(=O)(O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C9H15N4O9P/c10-3-6(12-9(17)13-7(3)16)11-8-5(15)4(14)2(22-8)1-21-23(18,19)20/h2,4-5,8,14-15H,1,10H2,(H2,18,19,20)(H3,11,12,13,16,17)/t2-,4-,5-,8-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: LZEXYCAGPMYXLX-UMMCILCDSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: N-(5-amino-2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl)-5-O-phosphono-beta-D-ribofuranosylamine
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: [(2R,3S,4R,5R)-5-[[5-azanyl-2,4-bis(oxidanylidene)-1H-pyrimidin-6-yl]amino]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate

PDBエントリ

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PDB-4g3m:
Complex Structure of Bacillus subtilis RibG: The Deamination Process in Riboflavin Biosynthesis